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耐辐射奇球菌PprM蛋白相互作用RNA的筛选及鉴定

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
主要英文缩略词第8-13页
第1章 引言第13-17页
    1.1 耐辐射奇球菌简介第13-15页
    1.2 立项依据第15-17页
第2章 耐辐射奇球菌PprM蛋白的表达与纯化第17-33页
    2.1 材料及仪器设备第17-21页
        2.1.1 实验所用菌株、质粒及培养条件第17-18页
        2.1.2 主要试剂第18页
        2.1.3 主要仪器设备第18-19页
        2.1.4 培养基、生化试剂的配制第19-21页
    2.2 实验方法第21-29页
        2.2.1 DR基因组DNA的提取第21页
        2.2.2 E.coli质粒DNA提取第21-22页
        2.2.3 DNA片段的纯化第22-23页
        2.2.4 大肠杆菌感受态的制备第23页
        2.2.5 大肠杆菌细胞的转化第23-24页
        2.2.6 PprM蛋白过表达载体的构建第24-27页
        2.2.7 PprM蛋白的表达与纯化第27-29页
    2.3 结果和分析第29-32页
        2.3.1 DR基因组DNA的提取结果第29页
        2.3.2 PprM蛋白过表达载体构建的结果第29-30页
        2.3.3 PprM蛋白的表达与纯化结果第30-32页
    2.4 本章小结第32-33页
第3章 耐辐射奇球菌PprM蛋白靶RNA的筛选第33-53页
    3.1 材料和方法第33-35页
        3.1.1 实验所用菌株、质粒及培养条件第33-34页
        3.1.2 主要试剂第34页
        3.1.3 主要仪器设备第34页
        3.1.4 主要生化试剂的配制第34-35页
    3.2 实验方法第35-43页
        3.2.1 DR总RNA的提取第35页
        3.2.2 总RNA中DNA的去除第35-36页
        3.2.3 RNA pull-Down第36-37页
        3.2.4 RNA 3'末端接头的连接第37-38页
        3.2.5 5'末端接头的连接第38-40页
        3.2.6 逆转录第40-41页
        3.2.7 PCR反应第41-42页
        3.2.8 TA克隆第42-43页
    3.3 结果和分析第43-51页
        3.3.1 PprM蛋白氨基酸序列分析第43-44页
        3.3.2 DR总RNA提取结果第44页
        3.3.3 Inner PCR结果第44-45页
        3.3.4 测序结果第45-51页
    3.4 本章小结第51-53页
第4章 PprM蛋白与靶RNA相互作用的验证第53-61页
    4.1 材料和方法第54页
        4.1.1 实验所用菌株、质粒及培养条件第54页
        4.1.2 主要试剂第54页
        4.1.3 主要仪器设备第54页
    4.2 实验方法第54-56页
        4.2.1 PCR扩增体外转录模板第54-55页
        4.2.2 体外转录制备pprM的 5'UTR序列第55-56页
        4.2.3 凝胶阻滞实验第56页
    4.3 结果和分析第56-59页
        4.3.1 生物信息分析PprM与靶RNA的相互作用第56-58页
        4.3.2 体外转录模板PCR扩增结果第58页
        4.3.3 pprM 5'-UTR片段体外转录结果第58-59页
        4.3.4 凝胶迁移实验结果第59页
    4.4 本章小结第59-61页
第5章 讨论第61-65页
第6章 结论第65-67页
参考文献第67-73页
文献综述第73-85页
    参考文献第79-85页
作者攻读学位期间的科研成果第85-86页
致谢第86页

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