| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 地质微生物生态学简述 | 第10页 |
| 1.2 微生物介导的地球化学反应过程 | 第10-12页 |
| 1.2.1 微生物成矿作用 | 第10-11页 |
| 1.2.2 微生物在重金属迁移转化中的作用 | 第11页 |
| 1.2.3 微生物在矿山环境重金属污染中的修复作用 | 第11-12页 |
| 1.3 微生物多样性概念 | 第12页 |
| 1.4 微生物多样性分析技术 | 第12-15页 |
| 1.4.1 传统分离方法 | 第12-13页 |
| 1.4.2 16S rRNA克隆文库构建分析方法 | 第13页 |
| 1.4.3 限制性片段长度多态性分析（RFLP） | 第13-14页 |
| 1.4.4 末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP) | 第14页 |
| 1.4.5 变形梯度凝胶电泳(DGGE) | 第14-15页 |
| 1.4.6 荧光定量PCR（qPCR） | 第15页 |
| 1.4.7 现代高通量测序技术 | 第15页 |
| 1.5 本文的研究目的和意义 | 第15-18页 |
| 2 主要试验材料和方法 | 第18-28页 |
| 2.1 试验材料和器材 | 第18-22页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.3 引物序列 | 第20页 |
| 2.1.4 序列分析软件 | 第20页 |
| 2.1.5 常用培养基，溶液的配置 | 第20-22页 |
| 2.2 试验分析方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 微波消解 | 第22页 |
| 2.2.2 XRD | 第22页 |
| 2.2.3 总DNA提取 | 第22-24页 |
| 2.2.4 琼脂糖凝胶上DNA片段的回收 | 第24页 |
| 2.2.5 PCR反应 | 第24-25页 |
| 2.2.6 PCR产物的连接 | 第25页 |
| 2.2.7 双酶切反应 | 第25-26页 |
| 2.2.8 序列测定与分析 | 第26-28页 |
| 3 山东玲珑金矿微生物多样性分析 | 第28-54页 |
| 3.1 引言 | 第28页 |
| 3.2 试验材料 | 第28页 |
| 3.3 试验方法与步骤 | 第28-30页 |
| 3.3.1 金矿样品重金属含量测定 | 第28-29页 |
| 3.3.2 金矿样品XRD分析 | 第29页 |
| 3.3.3 样品处理 | 第29页 |
| 3.3.4 样品总DNA的提取 | 第29页 |
| 3.3.5 扩增菌株 16S rRNA基因 | 第29页 |
| 3.3.6 双酶切反应 | 第29页 |
| 3.3.7 PCR产物回收 | 第29-30页 |
| 3.3.8 PCR产物测序 | 第30页 |
| 3.3.9 OTU分析 | 第30页 |
| 3.3.10 16S rRNA基因序列比对及系统发育树构建 | 第30页 |
| 3.4 结果与分析 | 第30-51页 |
| 3.4.1 玲珑金矿样品中重金属含量 | 第30-32页 |
| 3.4.2 玲珑金矿XRD结果 | 第32页 |
| 3.4.3 玲珑金矿可培养好氧菌株分析 | 第32-36页 |
| 3.4.4 玲珑金矿可培养厌氧菌株分析 | 第36-39页 |
| 3.4.5 玲珑金矿可培养好氧菌株和可培养厌氧菌株比较 | 第39-43页 |
| 3.4.6 玲珑金矿群落多样性分析 | 第43-51页 |
| 3.5 本章小结 | 第51-54页 |
| 4 甘肃白银铜矿微生物多样性分析 | 第54-64页 |
| 4.1 引言 | 第54页 |
| 4.2 试验材料 | 第54页 |
| 4.3 试验方法与步骤 | 第54-56页 |
| 4.3.1 铜矿样品重金属含量测定 | 第54-55页 |
| 4.3.2 样品处理及培养基配置 | 第55页 |
| 4.3.3 样品总DNA的提取 | 第55页 |
| 4.3.4 扩增菌株 16S rRNA基因 | 第55页 |
| 4.3.5 双酶切反应 | 第55页 |
| 4.3.6 PCR产物回收 | 第55页 |
| 4.3.7 PCR产物测序 | 第55-56页 |
| 4.3.8 16S rRNA基因序列比对及系统发育树构建 | 第56页 |
| 4.4 结果分析 | 第56-62页 |
| 4.4.1 白银铜矿重金属含量 | 第56-57页 |
| 4.4.2 白银铜矿可培养菌株多样性 | 第57-62页 |
| 4.5 本章小结 | 第62-64页 |
| 5 结论与展望 | 第64-66页 |
| 5.1 主要研究结论 | 第64页 |
| 5.2 展望 | 第64-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 附录 研究生期间发表的论文情况 | 第72页 |
