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脆弱拟杆菌CcrA酶与头孢菌素类抗生素之间的分子识别和相互作用

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第12-24页
    1.1 引言第12-13页
    1.2 β-内酰胺酶第13-14页
    1.3 金属β-内酰胺酶CcrA第14-16页
    1.4 β-内酰胺类抗生素第16-18页
        1.4.1 头孢他啶第16-17页
        1.4.2 头孢噻肟第17-18页
    1.5 主要研究方法第18-21页
        1.5.1 荧光光谱法第18-20页
        1.5.2 紫外光谱法第20页
        1.5.3 分子对接第20-21页
        1.5.4 分子动力学模拟第21页
    1.6 本论文研究内容和意义第21-24页
        1.6.1 研究内容第21-22页
        1.6.2 研究目的及意义第22-24页
第二章 CcrA酶的表达鉴定和分离纯化第24-34页
    2.1 引言第24页
    2.2 实验材料第24-27页
        2.2.1 工程菌第24页
        2.2.2 试剂第24页
        2.2.3 主要仪器及型号第24-25页
        2.2.4 溶液的配制第25-27页
    2.3 实验方法第27-30页
        2.3.1 CcrA酶的诱导表达第27页
        2.3.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳法(SDS-PAGE)检测蛋白的表达第27-28页
        2.3.3 包涵体的洗涤和溶解第28-29页
        2.3.4 包涵体的变性、复性和分离纯化第29页
        2.3.5 CcrA酶的含量测定第29-30页
        2.3.6 CcrA酶对两种抗生素的水解动力学第30页
    2.4 结果与分析第30-32页
        2.4.1 CcrA酶的表达和纯化分析第30-32页
        2.4.2 CcrA酶的含量测定结果第32页
        2.4.3 CcrA酶对两种抗生素水解活性结果分析第32页
    2.5 本章小结第32-34页
第三章 CcrA酶与CTX结合过程的分子识别和相互作用研究第34-48页
    3.1 引言第34页
    3.2 仪器及试剂第34-35页
        3.2.1 实验仪器第34页
        3.2.2 实验试剂第34-35页
        3.2.3 溶液配制第35页
    3.3 实验方法第35-37页
        3.3.1 CcrA酶和CTX的结合实验第35页
        3.3.2 CcrA酶和CTX结合过程的内源荧光光谱测定第35页
        3.3.3 CcrA酶和CTX结合过程的同步荧光光谱测定第35页
        3.3.4 分子动力学模拟及分子对接第35-37页
    3.4 实验结果与讨论第37-46页
        3.4.1 CcrA酶和CTX结合过程的荧光发射光谱分析第37页
        3.4.2 CcrA酶和CTX结合过程的同步荧光光谱分析第37-39页
        3.4.3 CcrA酶和CTX相互作用的荧光猝灭类型第39-40页
        3.4.4 CcrA酶和CTX相互作用的结合常数和结合位点数第40-41页
        3.4.5 CcrA酶和CTX相互作用的热力学参数第41-42页
        3.4.6 CcrA酶分子中氨基酸残基的波动性第42-43页
        3.4.7 CcrA酶与CTX相互作用的分子对接结果第43-45页
        3.4.8 CcrA酶构象变化第45-46页
    3.5 本章小结第46-48页
第四章 CcrA酶与CAZ结合过程的分子识别和相互作用研究第48-60页
    4.1 引言第48页
    4.2 仪器及试剂第48-49页
        4.2.1 实验仪器第48页
        4.2.2 实验试剂第48页
        4.2.3 溶液配制第48-49页
    4.3 实验方法第49-50页
        4.3.1 CcrA酶和CAZ的结合实验第49页
        4.3.2 CcrA酶和CAZ结合过程的内源荧光光谱的测定第49页
        4.3.3 CcrA酶和CAZ结合过程的同步荧光光谱的测定第49页
        4.3.4 分子动力学模拟与分子对接第49-50页
    4.4 实验结果与讨论第50-57页
        4.4.1 CcrA酶和CAZ结合过程的荧光发射光谱分析第50-51页
        4.4.2 CcrA酶和CAZ结合过程的同步荧光光谱分析第51-52页
        4.4.3 CcrA酶和CAZ相互作用的荧光猝灭类型第52-53页
        4.4.4 CcrA酶和CAZ相互作用的结合常数和结合位点数第53-54页
        4.4.5 CcrA酶和CAZ相互作用的热力学参数第54-55页
        4.4.6 CcrA酶和CAZ相互作用的分子对接结果第55-57页
        4.4.7 CcrA酶构象变化第57页
    4.5 本章小结第57-60页
第五章 CcrA酶与CAZ和CTX两个结合体系的比较第60-64页
    5.1 引言第60页
    5.2 荧光猝灭常数Ksv和猝灭速率常数K_q第60页
    5.3 结合常数和结合位点的比较第60-61页
    5.4 分子对接比较第61-63页
    5.5 本章小结第63-64页
全文总结第64-66页
参考文献第66-76页
攻读博士/硕士学位期间取得的科研成果第76-78页
致谢第78页

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