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利用CRISP-Cas9技术进行内源性c-FLIP蛋白靶向药物筛选细胞系的构建

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 绪论第19-29页
    1.1 TRAIL诱导肿瘤细胞凋亡的机制第19-20页
        1.1.1 受体途径第19页
        1.1.2 线粒体途径第19-20页
    1.2 TRAIL诱导的外源性凋亡途径中与耐受直接相关的分子及机制第20-23页
        1.2.1 TRAIL耐受机制及其表达调控第20-21页
        1.2.2 TRAIL受体耐受机制及其表达调控第21-22页
        1.2.3 caspase-8耐受机制及其表达调控第22页
        1.2.4 DISC耐受机制及其调控第22页
        1.2.5 c-FLIP耐受机制及其表达调控第22-23页
    1.3 TRAIL诱导的内源性凋亡途径中与耐受直接相关的分子及机制第23页
        1.3.1 Bcl-2家族蛋白耐受机制及其表达调控第23页
        1.3.2 IAP的耐受机制及其表达调控第23页
    1.4 TRAIL激活的存活途径第23-24页
    1.5 TRAIL与肿瘤治疗第24-25页
    1.6 本实验研究目的第25-26页
    1.7 本实验研究路线第26页
    1.8 用CRISPR-Cas9构建细胞系第26-27页
        1.8.1 最新的基因编辑技术——CRISPR-Cas9技术第26-27页
        1.8.2 CRISPR-Cas9原理第27页
    1.9 利用CRISPR Cas9技术在c-FLIPs序列中敲入GFP第27-29页
        1.9.1 构建Pcas-Guide载体第27页
        1.9.2 确定Guide-RNA切割效率第27页
        1.9.3 构建Donor DNA第27-28页
        1.9.4 转染第28页
        1.9.5 细胞系的鉴定第28页
        1.9.6 TRAIL处理细胞第28-29页
第二章 用CRISPR-Cas9技术构建cFLIPs-DED2-GFP细胞系第29-80页
    2.1 实验材料第29-36页
        2.1.1 载体、菌种及细胞第29页
        2.1.2 实验仪器及耗材第29-30页
        2.1.3 实验实际和药品第30-32页
        2.1.4 实验试剂的配制第32-36页
    2.2 实验内容与结果第36-80页
        2.2.1 Cas9载体构建第36-45页
            2.2.1.1 gRNA设计第37-38页
            2.2.1.2 提取pCas-Guide质粒第38-40页
            2.2.1.3 质粒pCas-Guide的双酶切体系第40-42页
            2.2.1.4 gRNA引物预处理第42页
            2.2.1.5 连接反应第42-43页
            2.2.1.6 重组载体的转化涂板第43页
            2.2.1.7 菌落PCR、测序保菌第43-45页
        2.2.2 Donor DNA构建第45-70页
            2.2.2.1 pEASY-Blunt- c-FLIP -exon5 -GFP载体构建第46-62页
            2.2.2.2 pcDNA3.1- cFLIPs-exon5 -GFP载体构建第62-68页
            2.2.2.3 去内毒素提取质粒第68-70页
        2.2.3 细胞实验第70-80页
            2.2.3.1 U20S细胞的培养及传代第70页
            2.2.3.2 将质粒gRNA和pcDNA3.1-c-FLIP-exon5-GFP共同转染到U2OS细胞第70-73页
            2.2.3.3 将质粒gRNA2和Dornor DNA(a1)用德国NOZA电转仪进行转染第73-74页
            2.2.3.4 HEK293细胞培养第74页
            2.2.3.5 将质粒gRNA2和Dornor DNA(a1)共同转染到HEK293细胞第74-75页
            2.2.3.6 用坏死坏死抑制剂Necrostatin (40μM)提前处理ERK293细胞第75-76页
            2.2.3.7 用凋亡抑制剂Z-VAD-FMK (20μM)提前处理ERK293细胞后第76-78页
            2.2.3.8 MTT检测第78-80页
第三章 用CRIPR-Cas9技术在内源性cFLIP的exon8中敲入GFP第80-117页
    3.1 实验材料第80页
        3.1.1 载体、菌种第80页
        3.1.2 实验仪器和耗材第80页
        3.1.3 实验试剂和药品第80页
        3.1.4 实验试剂的配制第80页
    3.2 实验内容和结果第80-117页
        3.2.1 Cas9载体构建第80-86页
            3.2.1.1 gRNA设计第81页
            3.2.1.2 提取pCas-Guide质粒第81-82页
            3.2.1.3 质粒pCas-Guide的双酶切体系第82-86页
        3.2.2 Donor DNA构建第86-115页
            3.2.2.1 融合PCR的原理第86页
            3.2.2.2 全基因组的提取第86-87页
            3.2.2.3 靶序列上半段和下半段引物设计第87-88页
            3.2.2.4 GFP引物设计第88页
            3.2.2.5 80分Donor DNA片段载体构建第88-96页
            3.2.2.6 扩增带有XhoI和BamHI两个酶切位点的GFP第96-100页
            3.2.2.7 71分Donor DNA片段载体的构建第100-108页
            3.2.2.8 扩增带有XhoI和BamHI两个酶切位点的GFP第108-114页
            3.2.2.9 去内毒素提取质粒第114-115页
        3.2.3 细胞实验第115-117页
            3.2.3.1 HEK293细胞培养第115页
            3.2.3.2 转染gRNA_(80)b和Donor DNA_(80)第115-117页
第四章 用CRIPR-Cas9技术构建cFLIP-exon8-GFP细胞系第117-144页
    4.1 实验材料第117页
        4.1.1 载体、菌种、酶第117页
        4.1.2 实验仪器和耗材第117页
        4.1.3 实验试剂和药品第117页
        4.1.4 实验试剂的配制第117页
    4.2 实验内容和结果第117-144页
        4.2.1 Cas9载体构建第117-122页
            4.2.1.1 gRNA设计第118-119页
            4.2.1.2 提取pSpCas9(BB)质粒第119页
            4.2.1.3 质粒pSpCas9(BB)的双酶切体系第119-120页
            4.2.1.4 gRNA引物的前处理第120页
            4.2.1.5 连接反应第120页
            4.2.1.6 重组载体的转化涂板第120页
            4.2.1.7 菌落PCR、测序保菌第120-122页
        4.2.4 细胞实验第122-144页
            4.2.4.1 通过Cruiser TM酶验证所构建的gRNA80的切割效率第122-123页
            4.2.4.2 通过Cruiser TM酶验证所构建的gRNA71的切割效率第123-124页
            4.2.4.3 HEK293细胞培养第124页
            4.2.4.4 转染gRNA(61-80)和c-FLIPs -exon8 (80) b-GFP扩增片段第124-126页
            4.2.4.5 潮霉素(hyg)筛选第126页
            4.2.4.6 挑单克隆第126-127页
            4.2.4.7 蛋白水平鉴定GFP定点敲入的稳定细胞系第127-131页
            4.2.4.8 基因水平鉴定GFP定点敲入的稳定细胞系第131-137页
            4.2.4.9 高内涵细胞成像分析第137-144页
第五章 总结与讨论第144-146页
参考文献第146-152页
致谢第152-153页
附录A 攻读硕士期间发表论文目录第153-154页
附录B 其他需要说明的内容第154页

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