| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 植物的抗病机制 | 第12-13页 |
| 1.1.1 植物抗病性研究 | 第12页 |
| 1.1.2 植物先天免疫系统 | 第12-13页 |
| 1.2 水稻纹枯病的抗性研究进展 | 第13-20页 |
| 1.2.1 水稻纹枯病的危害 | 第14页 |
| 1.2.2 纹枯病菌的侵染机制 | 第14-15页 |
| 1.2.3 水稻纹枯病的抗性遗传和QTL定位研究 | 第15-17页 |
| 1.2.4 水稻抗纹枯病的育种研究 | 第17-18页 |
| 1.2.4.1 水稻抗纹枯病种质资源的筛选 | 第17页 |
| 1.2.4.2 水稻抗纹枯病QTL的分子标记辅助选择育种 | 第17-18页 |
| 1.2.5 水稻抗纹枯病的生物技术研究 | 第18-20页 |
| 1.3 水稻纹枯病抗性鉴定体系 | 第20-23页 |
| 1.3.1 水稻纹枯病田间抗性鉴定体系 | 第20-22页 |
| 1.3.2 水稻纹枯病苗期抗性鉴定体系 | 第22-23页 |
| 1.4 高通量转录组测序技术 | 第23-25页 |
| 1.4.1 测序技术的发展 | 第23-24页 |
| 1.4.2 新一代测序技术的发展 | 第24-25页 |
| 1.5 本研究的目的意义 | 第25-26页 |
| 第2章 水稻响应纹枯病菌侵染的转录组分析 | 第26-45页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-31页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第26-27页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第27-31页 |
| 2.1.2.1 RNA提取及质量检测 | 第27-28页 |
| 2.1.2.2 RNA-Seq测序实验流程 | 第28页 |
| 2.1.2.3 RNA-Seq测序数据的产生 | 第28-29页 |
| 2.1.2.4 测序数据的质量评估 | 第29页 |
| 2.1.2.5 基因表达量的统计 | 第29-30页 |
| 2.1.2.6 差异表达基因的筛选 | 第30-31页 |
| 2.2 实验结果 | 第31-45页 |
| 2.2.1 RNA质量检测结果 | 第31页 |
| 2.2.2 RNA-Seq测序数据质量评估 | 第31-35页 |
| 2.2.3 RNA-Seq测序数据的比对统计 | 第35-37页 |
| 2.2.4 RNA-Seq测序数据的饱和度、随机性和覆盖度分析 | 第37-41页 |
| 2.2.5 生物学重复的关联性分析与基因表达定量 | 第41-42页 |
| 2.2.6 差异表达基因的筛选 | 第42-45页 |
| 第3章 与水稻纹枯病相关的差异表达基因的筛选与验证 | 第45-53页 |
| 3.1 材料与方法 | 第45-46页 |
| 3.1.1 实验数据 | 第45页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第45-46页 |
| 3.1.2.1 受病原菌诱导的差异表达基因的筛选 | 第45页 |
| 3.1.2.2 候选差异表达基因的半定量RT-PCR和qRT-PCR验证 | 第45-46页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第46-51页 |
| 3.2.1 与水稻纹枯病相关的上调差异表达基因的筛选 | 第46-48页 |
| 3.2.2 候选差异表达基因的半定量RT-PCR和qRT-PCR验证 | 第48-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-53页 |
| 第4章 水稻离体叶片抗纹枯病接种方法的研究 | 第53-63页 |
| 4.1 实验材料 | 第53-54页 |
| 4.1.1 供试水稻品种 | 第53-54页 |
| 4.1.2 实验主要仪器 | 第54页 |
| 4.1.3 实验主要试剂 | 第54页 |
| 4.2 实验方法 | 第54-58页 |
| 4.2.1 水稻离体叶片纹枯病接种 | 第54-57页 |
| 4.2.1.1 水稻种植 | 第54-55页 |
| 4.2.1.2 纹枯病菌培养 | 第55页 |
| 4.2.1.3 纹枯病菌接种 | 第55-56页 |
| 4.2.1.4 水稻离体叶片接种后病情调查及统计 | 第56页 |
| 4.2.1.5 接种纹枯病菌水稻材料的取样 | 第56页 |
| 4.2.1.6 水稻RNA提取及qRT-PCR分析鉴定 | 第56-57页 |
| 4.2.2 水稻大田成株期纹枯病接种鉴定 | 第57页 |
| 4.2.3 水稻苗期纹枯病接种鉴定 | 第57-58页 |
| 4.3 结果与分析 | 第58-61页 |
| 4.3.1 水稻离体叶片纹枯病菌接种的病级数据分析 | 第58-59页 |
| 4.3.2 离体叶片接种后水稻病程相关基因的qRT-PCR分析 | 第59-61页 |
| 4.3.3 供试水稻品种田间成株期和苗期微室法接种验证 | 第61页 |
| 4.4 讨论 | 第61-63页 |
| 第5章 结论与展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
