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特有濒危植物青檀微卫星(EST-SSR)分子标记开发及其小尺度空间遗传结构研究

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
第一章 绪论第14-29页
    1.1 研究背景与意义第14-16页
    1.2 研究内容与目标第16页
    1.3 相关研究综述第16-29页
        1.3.1 高通量测序技术第16-21页
        1.3.2 微卫星分子标记第21-26页
        1.3.3 种群空间遗传结构和交配系统第26-29页
第二章 青檀种群结构与空间分布格局分析第29-40页
    2.1 研究方法第29-33页
        2.1.1 样地概况第29-30页
        2.1.2 样地设置第30-31页
        2.1.3 青檀种群结构第31-32页
        2.1.4 静态生命表与生存曲线第32页
        2.1.5 青檀空间分布格局分析第32-33页
    2.2 结果与分析第33-38页
        2.2.1 青檀种群年龄结构第33-35页
        2.2.2 青檀空间分布格局分析第35-38页
    2.3 讨论第38-40页
第三章 青檀转录组高通量测序分析及EST-SSR分子标记开发第40-71页
    3.1 实验材料与方法第40-50页
        3.1.1 实验材料第40-41页
        3.1.2 青檀转录组测序第41-42页
        3.1.3 青檀转录组数据筛选拼接第42页
        3.1.4 青檀Unigene结构注释、表达分析、功能注释第42-43页
        3.1.5 青檀SSR位点搜索分析与开发第43-50页
    3.2 结果与分析第50-68页
        3.2.1 青檀RNA-Seq测序及质量评估第50-51页
        3.2.2 青檀转录组数据组装与分析第51-52页
        3.2.3 青檀分类表达分析、结构注释、功能注释第52-57页
        3.2.4 青檀SSR位点搜索分析与开发第57-68页
    3.3 讨论第68-71页
第四章 青檀遗传多样性及小种群空间遗传结构分析第71-85页
    4.1 实验材料与方法第71-73页
        4.1.1 实验材料第71页
        4.1.2 青檀基因组DNA提取、PCR扩增及产物检测第71页
        4.1.3 多重PCR第71-72页
        4.1.4 遗传多样性分析第72页
        4.1.5 青檀空间遗传结构分析第72-73页
        4.1.6 亲本分析及基因流第73页
    4.2 结果与分析第73-81页
        4.2.1 多重PCR反应第73-74页
        4.2.2 青檀遗传多样性第74-75页
        4.2.3 青檀空间遗传结构第75-79页
        4.2.4 青檀亲本分析和基因流第79-81页
    4.3 讨论第81-85页
第五章 总结与展望第85-90页
    5.1 总结第85-88页
        5.1.1 琅琊山青檀天然种群动态第85-86页
        5.1.2 琅琊山青檀种群空间分布格局第86页
        5.1.3 青檀转录组测序第86页
        5.1.4 青檀SSR位点搜索分析与开发第86-87页
        5.1.5 琅琊山青檀种群遗传多样性第87页
        5.1.6 琅琊山青檀种群空间遗传结构第87-88页
        5.1.7 青檀保育启示第88页
    5.2 展望第88-90页
        5.2.1 不同生境下青檀种群的研究第88-89页
        5.2.2 青檀核基因组微卫星分子标记的开发第89页
        5.2.3 青檀功能基因的研究第89-90页
参考文献第90-98页
硕士期间论文发表情况第98-99页
致谢第99-100页

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