| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 第一章 前言 | 第9-24页 |
| 1.1 植物反转录转座子研究进展 | 第9-19页 |
| 1.1.1 植物反转录转座子类型 | 第10-12页 |
| 1.1.2 植物反转录转座子的结构特征 | 第12-14页 |
| 1.1.3 植物反转录转座子的分布特点 | 第14-15页 |
| 1.1.4 LTR反转录转座子的转座机制 | 第15-16页 |
| 1.1.5 LTR反转录转座子的活性及影响因素 | 第16-17页 |
| 1.1.6 植物LTR反转录转座子分离鉴定 | 第17-18页 |
| 1.1.7 基于反转录转座子的分子标记种类 | 第18-19页 |
| 1.2 火龙果的体细胞变异与分子鉴定 | 第19-22页 |
| 1.2.1 火龙果起源和地理分布 | 第19-20页 |
| 1.2.2 火龙果的分类 | 第20-21页 |
| 1.2.3 国外内火龙果研究现状 | 第21页 |
| 1.2.4 火龙体细胞变异检测 | 第21-22页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 1.4 研究内容与技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子序列克隆 | 第24-48页 |
| 2.1 试验材料 | 第24-25页 |
| 2.2 实验试剂及仪器设备 | 第25页 |
| 2.3 方法 | 第25-31页 |
| 2.3.1 基因组DNA提取及检测 | 第25-26页 |
| 2.3.2 反转录酶序列的PCR扩增 | 第26-27页 |
| 2.3.3 PCR产物回收 | 第27-28页 |
| 2.3.4 PCR产物连接与转化 | 第28-29页 |
| 2.3.5 质粒提取 | 第29-30页 |
| 2.3.6 菌落PCR及测序 | 第30页 |
| 2.3.7 反转录酶序列分析 | 第30-31页 |
| 2.4 结果与分析 | 第31-44页 |
| 2.4.1 火龙果基因组DNA检测 | 第31页 |
| 2.4.2 火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列扩增 | 第31-34页 |
| 2.4.3 红肉火龙果Ty3-gypsy类RT核苷酸序列分析 | 第34-36页 |
| 2.4.4 红肉火龙果Ty3-gypsy类RT氨基酸序列分析 | 第36-38页 |
| 2.4.5 白肉火龙果Ty3-gypsy类RT核苷酸序列分析 | 第38-40页 |
| 2.4.6 白肉火龙果Ty3-gypsy类RT氨基酸序列分析 | 第40-43页 |
| 2.4.7 Ty3-gypsy类反转录转座子RT的系统进化分析 | 第43-44页 |
| 2.5 讨论 | 第44-48页 |
| 2.5.1 火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子异质性 | 第44-46页 |
| 2.5.2 反转录酶基因的进化分析 | 第46-48页 |
| 第三章 火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子的活性检测 | 第48-58页 |
| 3.1 试验材料 | 第48-49页 |
| 3.2 实验试剂及仪器设备 | 第49页 |
| 3.3 试验方法 | 第49-52页 |
| 3.3.1 总RNA提取及检测 | 第49-50页 |
| 3.3.2 cDNA的合成 | 第50页 |
| 3.3.3 反转录酶转录活性检测 | 第50-51页 |
| 3.3.4 引物设计与内参基因筛选 | 第51-52页 |
| 3.3.5 半定量RT-PCR扩增 | 第52页 |
| 3.4 结果与分析 | 第52-55页 |
| 3.4.1 火龙果总RNA质量检测 | 第52-53页 |
| 3.4.2 反转录酶转录活性检测 | 第53页 |
| 3.4.3 半定量RT-PCR体系建立 | 第53-54页 |
| 3.4.4 半定量RT-PCR检测 | 第54-55页 |
| 3.5 讨论 | 第55-58页 |
| 第四章 火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子LTR序列克隆 | 第58-67页 |
| 4.1 试验材料 | 第58页 |
| 4.2 实验试剂及仪器设备 | 第58页 |
| 4.3 试验方法 | 第58-62页 |
| 4.3.1 火龙果基因组DNA提取 | 第59页 |
| 4.3.2 特异性引物设计 | 第59-60页 |
| 4.3.3 染色体步移法分离反转录转座子LTR序列 | 第60-62页 |
| 4.3.4 PCR产物回收与测序 | 第62页 |
| 4.3.5 序列分析 | 第62页 |
| 4.4 结果与分析 | 第62-64页 |
| 4.4.1 巢式PCR扩增 | 第62-64页 |
| 4.4.2 反转录转座子3'端序列特征分析 | 第64页 |
| 4.5 讨论 | 第64-67页 |
| 第五章 总结与展望 | 第67-69页 |
| 5.1 主要结果 | 第67-68页 |
| 5.2 后续工作展望 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 附录 | 第81-82页 |
