基于图能量的蛋白质2D图形表示及其应用
摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-11页 |
第一章 绪论 | 第12-18页 |
1.1 课题的研究背景及意义 | 第12-13页 |
1.2 生物序列的图形表示 | 第13-14页 |
1.2.1 序列比对 | 第13页 |
1.2.2 生物序列的图形表示 | 第13-14页 |
1.3 生物序列的相似性分析 | 第14-16页 |
1.3.1 生物序列的相似性分析 | 第14-15页 |
1.3.2 系统发育分析 | 第15-16页 |
1.4 文章的结构安排 | 第16-18页 |
1.4.1 论文的主要工作和研究内容 | 第16页 |
1.4.2 论文的组织结构 | 第16-18页 |
第二章 20种氨基酸的图形表示 | 第18-26页 |
2.1 引言 | 第18-19页 |
2.1.1 蛋白质与氨基酸 | 第18-19页 |
2.1.2 氨基酸常见的物理化学性质 | 第19页 |
2.2 20种氨基酸的图形表示 | 第19-23页 |
2.2.1 20种氨基酸的理化性质 | 第19-20页 |
2.2.2 20种氨基酸的图形表示 | 第20-23页 |
2.3 20种氨基酸的图能量 | 第23-25页 |
2.3.1 图能量的定义 | 第23-24页 |
2.3.2 20种氨基酸的图能量 | 第24-25页 |
2.4 本章小结 | 第25-26页 |
第三章 基于图能量的蛋白质序列2D图形表示 | 第26-30页 |
3.1 引言 | 第26-27页 |
3.2 蛋白质序列的图形表示 | 第27-29页 |
3.3 本章小结 | 第29-30页 |
第四章 蛋白质序列的相似性分析 | 第30-44页 |
4.1 引言 | 第30-33页 |
4.1.1 蛋白质数值特征的提取方法 | 第30页 |
4.1.2 多维向量距离的计算方法 | 第30-32页 |
4.1.3 常用的序列比对工具 | 第32-33页 |
4.2 蛋白质序列数值特征的提取 | 第33-35页 |
4.2.1 数值特征的提取 | 第33页 |
4.2.2 向量维数的确定 | 第33-35页 |
4.3 蛋白质序列的相似性分析 | 第35-43页 |
4.3.1 ND5数据集中蛋白质序列的相似性分析 | 第35-38页 |
4.3.2 24条转铁蛋白质序列的相似性分析 | 第38-41页 |
4.3.3 36条蛋白质序列的相似性分析 | 第41-43页 |
4.4 本章小结 | 第43-44页 |
第五章 总结与展望 | 第44-46页 |
5.1 总结 | 第44页 |
5.2 展望 | 第44-46页 |
参考文献 | 第46-50页 |
致谢 | 第50-51页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第51-52页 |
附录 | 第52-61页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第61页 |