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新抑癌基因SCNN1B通过降解GRP78对胃癌生长和转移的影响及机制研究

致谢第5-7页
中文摘要第7-11页
ABSTRACT第11-13页
插图和附表清单第14-17页
缩写及符号清单第17-22页
1 引言第22-25页
2 材料与方法第25-68页
    2.1 实验材料第25-31页
        2.1.1 临床胃癌病例信息及组织样本的收集第25页
        2.1.2 细胞培养第25-26页
        2.1.3 动物饲养第26页
        2.1.4 试剂和仪器第26-31页
    2.2 实验方法第31-68页
        2.2.1 RNA提取第31-33页
        2.2.2 cDNA合成第33页
        2.2.3 实时定量荧光PCR法(Real-Time PCR)检测组织及细胞系中目的基因的表达第33-35页
        2.2.4 逆转录RT-PCR检测检测组织及细胞系中目的基因的表达第35-36页
        2.2.5 提取总蛋白以及蛋白浓度检测第36-37页
        2.2.6 蛋白免疫印迹(Western Blot)分析第37-40页
        2.2.7 甲基化特异性PCR(Methylation Specific PCR,MSP)第40-45页
        2.2.8 亚硫酸氢盐基因组测序法(Bisulfite genomic sequencing,BGS)第45-47页
        2.2.9 5-aza-2'-deoxycytidine (5-Aza)和trichostatin A(TSA)处理细胞第47页
        2.2.10 实验相关表达载体的构建和转染第47-58页
        2.2.11 siRNA靶向干扰技术第58页
        2.2.12 组织病理分析第58-60页
        2.2.13 分析大型癌症和肿瘤基因数据库(Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)第60-61页
        2.2.14 细胞活性实验第61-63页
        2.2.15 细胞迁移、侵袭和粘附实验第63-64页
        2.2.16 建立稳定过表达SCNN1B的裸鼠皮下成瘤模型第64-65页
        2.2.17 免疫共沉淀与质谱分析第65页
        2.2.18 免疫荧光染色第65-66页
        2.2.19 统计学方法第66-68页
3 技术路线第68-70页
    3.1 SCNN1B体内体外功能实验第68页
    3.2 SCNN1B胃癌临床队列和数据库分析第68-69页
    3.3 SCNN1B抑制胃癌的分子机制研究第69-70页
4 结果第70-125页
    4.1 全基因组甲基化芯片扫描筛选出SCNN1B为候选抑癌基因第70-71页
    4.2 SCNN1B在胃癌细胞株及胃癌组织中表达沉默与该基因DNA启动子上的CPG岛发生甲基化相关第71-83页
        4.2.1 逆转录PCR检测SCNN1B在正常成人组织中的表达第71页
        4.2.2 逆转录PCR检测SCNN1B在胃癌细胞株及正常胃组织中的表达第71-73页
        4.2.3 甲基化特异PCR及亚硫酸氢盐基因组测序检测基因SCNN1B启动子区甲基化水平第73-76页
        4.2.4 去甲基化试剂5-Aza和组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA处理细胞后检测SCNN1B的复表达水平第76-77页
        4.2.5 检测SCNN1B在临床胃癌组织与配对癌旁正常组织的表达差异,对候选抑癌基因SCNN1B作进一步验证第77-80页
        4.2.6 甲基化特异性PCR及亚硫酸氢盐基因组测序法检测SCNN1B在临床胃癌组织配对样本中启动子甲基化程度的差异第80-81页
        4.2.7 TCGA数据库验证SCNN1B在胃癌组织中的DNA甲基化水平与基因表达水平第81-83页
    4.3 评估SCNN1B在胃癌组织中的表达水平与患者临床特征及生存预后的关系第83-96页
        4.3.1 免疫组化法检测胃癌组织芯片SCNN1B表达水平,评估SCNN1B的蛋白表达水平与胃癌患者临床特征及生存预后间的关系第83-88页
        4.3.2 胃癌数据集GSE62254分析,验证SCNN1B的mRNA表达水平与胃癌临床特征及生存预后的关系第88-94页
        4.3.3 胃癌数据集GSE14210分析,验证SCNN1B的mRNA表达水平与胃癌临床特征及生存预后的关系第94-96页
    4.4 SCNN1B通过诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞,进而抑制胃癌细胞的生长第96-104页
        4.4.1 SCNN1B转染后验证第96-97页
        4.4.2 SCNN1B抑制胃癌细胞增殖第97-98页
        4.4.3 SCNN1B诱导胃癌细胞凋亡和细胞周期阻滞第98-102页
        4.4.4 siRNA靶向敲低SCNN1B增加细胞集落形成能力,同时促进细胞从G_1期进入S期第102-104页
    4.5 SCNN1B可以抑制胃癌细胞的迁移与侵袭、促进细胞的粘附第104-109页
        4.5.1 SCNN1B抑制胃癌细胞的迁移能力第104-106页
        4.5.2 SCNN1B可抑制胃癌细胞的侵袭能力第106页
        4.5.3 SCNN1B可促进胃癌细胞的粘附能力第106-107页
        4.5.4 siRNA靶向敲低SCNN1B促进胃癌细胞的迁移、抑制胃癌细胞的粘附第107-109页
    4.6 SCNN1B抑制胃癌细胞体内成瘤能力第109-113页
        4.6.1 建立稳定转染SCNN1B或空白载体的MKN45裸鼠皮下成瘤模型第110-111页
        4.6.2 建立稳定转染SCNN1B或空白载体的BGC823裸鼠皮下成瘤模型第111-113页
    4.7 SCNN1B与GRP78相互作用,通过泛素化作用降解蛋白GRP78第113-125页
        4.7.1 免疫共沉淀实验联合质谱分析筛选出SCNN1B的候选相互作用蛋白GRP78第113-114页
        4.7.2 验证蛋白SCNN1B与蛋白GRP78的相互作用第114页
        4.7.3 免疫荧光实验确定蛋白SCNN1B与蛋白GRP78在细胞内的定位第114-115页
        4.7.4 探索蛋白SCNN1B与蛋白GRP78之间的相互作用第115-125页
5 讨论第125-128页
6 结论第128-129页
参考文献第129-133页
综述第133-153页
    參考文献第143-153页
作者简历及在学期间所取得的科研成果第153-158页

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