核桃（Juglans regia）SLAF遗传连锁图谱构建及抗炭疽病QTL定位
| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 引言 | 第12-23页 |
| ·核桃炭疽病研究进展 | 第12-14页 |
| ·核桃炭疽病及其危害 | 第12-13页 |
| ·核桃炭疽病的防治研究 | 第13页 |
| ·核桃抗炭疽病基因研究 | 第13-14页 |
| ·分子标记技术 | 第14-17页 |
| ·基于Southern杂交技术的分子标记 | 第14页 |
| ·基于PCR技术的分子标记 | 第14-16页 |
| ·RAPD标记 | 第14-15页 |
| ·AFLP标记 | 第15页 |
| ·SSR标记 | 第15页 |
| ·SRAP标记 | 第15-16页 |
| ·以DNA序列为基础的分子标记 | 第16-17页 |
| ·EST标记 | 第16页 |
| ·SNP标记 | 第16-17页 |
| ·SLAF-seq测序技术及SLAF分子标记 | 第17-18页 |
| ·SLAF-seq测序技术 | 第17页 |
| ·SLAF分子标记 | 第17-18页 |
| ·SLAF分子标记的原理 | 第17-18页 |
| ·SLAF分子标记的特点及应用 | 第18页 |
| ·分子遗传图谱 | 第18-21页 |
| ·分子遗传图谱构建的理论依据 | 第18-19页 |
| ·构建分子遗传图谱的主要步骤 | 第19-21页 |
| ·作图亲本的选择 | 第19页 |
| ·作图群体类型的选择 | 第19-20页 |
| ·作图群体大小 | 第20页 |
| ·作图常用软件 | 第20-21页 |
| ·QTL定位 | 第21页 |
| ·QTL定位的原理 | 第21页 |
| ·QTL定位的方法 | 第21页 |
| ·关于核桃分子标记研究进展 | 第21-23页 |
| ·核桃分子标记研究 | 第21-22页 |
| ·核桃遗传连锁图谱构建和QTL定位研究 | 第22-23页 |
| ·本研究的目的意义 | 第23页 |
| 2 材料和方法 | 第23-31页 |
| ·实验材料 | 第23-24页 |
| ·植物材料 | 第23页 |
| ·试剂与设备 | 第23-24页 |
| ·实验方法 | 第24-31页 |
| ·核桃基因组DNA的提取 | 第24-25页 |
| ·基因组DNA浓度和纯度检测 | 第25页 |
| ·核桃抗炭疽病性状的调查 | 第25页 |
| ·SLAF文库的构建及测序 | 第25-28页 |
| ·测序数椐分析 | 第28-30页 |
| ·SLAF原始数据统计与评估 | 第28-29页 |
| ·SLAF标记筛选 | 第29页 |
| ·SLAF标记多态性分析和基因型编码 | 第29-30页 |
| ·核桃高密度遗传连锁图谱的构建 | 第30-31页 |
| ·雌性和雄性图谱的构建 | 第30页 |
| ·整合图谱的构建 | 第30-31页 |
| ·核桃抗炭疽病QTL定位 | 第31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-55页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第31页 |
| ·核桃抗炭疽病性状的调查 | 第31-32页 |
| ·SLAF测序数据评估与统计 | 第32-40页 |
| ·测序质量值评估 | 第32-33页 |
| ·碱基分布检查 | 第33-34页 |
| ·SLAF测序数据统计 | 第34-39页 |
| ·Control数据与基因组比对统计 | 第39-40页 |
| ·SLAF标记开发 | 第40-45页 |
| ·SLAF标记多态性分析 | 第40-43页 |
| ·编码基因型 | 第43-44页 |
| ·标记筛选 | 第44-45页 |
| ·核桃遗传连锁图谱构建 | 第45-48页 |
| ·图谱评估 | 第48-54页 |
| ·图谱的基本信息 | 第48-49页 |
| ·图谱偏分离标记分析 | 第49-50页 |
| ·图谱标记类型分析 | 第50-51页 |
| ·图谱标记的SNP分型 | 第51-52页 |
| ·图谱可视化评估 | 第52-54页 |
| ·核桃抗炭疽病的QTL定位 | 第54-55页 |
| 4.讨论 | 第55-58页 |
| ·关于SLAF标记和偏分离标记 | 第55-56页 |
| ·作图群体的评价 | 第56-57页 |
| ·关于核桃遗传连锁图谱 | 第57-58页 |
| ·核桃抗炭疽病相关的QTL定位分析 | 第58页 |
| 5 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-71页 |
| 附录: 相关试剂的配制 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第73页 |
