| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语表(Abbreviation) | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-25页 |
| ·研究问题的由来 | 第11-12页 |
| ·文献综述 | 第12-24页 |
| ·伪狂犬病毒的概述及其生物特性 | 第12-15页 |
| ·3D基因组的概述及其主要研究方法 | 第15-21页 |
| ·第二代高通量测序技术 | 第21-22页 |
| ·荧光原位杂交技术 | 第22-24页 |
| ·本课题的实验设计思路 | 第24-25页 |
| 2 研究目的与意义 | 第25-26页 |
| 3 实验材料与方法 | 第26-42页 |
| ·实验材料 | 第26-29页 |
| ·毒株、质粒和细胞系 | 第26页 |
| ·实验试剂耗材 | 第26-27页 |
| ·缓冲液（溶液）及其配制 | 第27-29页 |
| ·重要仪器及设备 | 第29页 |
| ·实验方法 | 第29-42页 |
| ·实验室常规实验 | 第29-32页 |
| ·3C文库的构建 | 第32-34页 |
| ·TAIL_PCR反应体系和程序 | 第34-36页 |
| ·荧光原位杂交 | 第36-37页 |
| ·4C文库的构建 | 第37页 |
| ·第二代高通量测序文库构建 | 第37-39页 |
| ·二代测序数据的分析 | 第39-40页 |
| ·3C-QPCR试验流程 | 第40-41页 |
| ·3C-PCR试验流程 | 第41-42页 |
| 4 结果与分析 | 第42-68页 |
| ·空斑实验 | 第42页 |
| ·探索性实验 | 第42-49页 |
| ·探索性实验流程 | 第42-44页 |
| ·3C文库构建结果 | 第44-45页 |
| ·TAIL_PCR结果 | 第45-46页 |
| ·序列验证及结果分析 | 第46-47页 |
| ·DNA_FISH验证 | 第47-49页 |
| ·系统性验证实验 | 第49-68页 |
| ·4C文库的构建 | 第49-54页 |
| ·4C数据的分析 | 第54-60页 |
| ·4C结果的验证 | 第60-68页 |
| 5 讨论与结论 | 第68-71页 |
| ·PRV与宿主在 3D基因组层面互作的揭示 | 第68页 |
| ·PRV基因组内部结构的探索 | 第68-69页 |
| ·PRV和宿主在 3D基因组层面互作现象的可能解释 | 第69页 |
| ·本实验的局限性 | 第69页 |
| ·本研究的启示 | 第69-70页 |
| ·结论 | 第70-71页 |
| 6 参考文献 | 第71-78页 |
| 致谢 | 第78页 |