| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-29页 |
| 第一节 选题背景与意义 | 第12-15页 |
| 一、立题目的与研究背景 | 第12-13页 |
| 二、研究意义 | 第13-15页 |
| 第二节 国内外研究进展 | 第15-27页 |
| 一、蓝藻及噬藻体 | 第15-16页 |
| 二、噬藻体遗传基因多样性研究的分子标记-g20 基因 | 第16-17页 |
| 三、自然环境中噬藻体g20 基因多样性 | 第17-22页 |
| （一）海洋中噬藻体g20 基因多样性 | 第17-19页 |
| （二）湖泊中噬藻体g20 基因多样性 | 第19-20页 |
| （三）稻田中噬藻体g20 基因多样性 | 第20-22页 |
| 四、噬藻体psbA基因多样性研究 | 第22-23页 |
| 五、蓝藻及其伴生细菌的研究 | 第23-27页 |
| 第三节 研究内容、技术路线和创新点 | 第27-29页 |
| 一、研究内容 | 第27页 |
| （一）东北稻田水体噬藻体g20 基因多样性研究 | 第27页 |
| （二）东北稻田水体噬藻体psbA基因多样性研究 | 第27页 |
| （三）东北稻田水体蓝藻的分离与鉴定 | 第27页 |
| （四）蓝藻伴生菌的分离及其鉴定 | 第27页 |
| 二、技术路线 | 第27-28页 |
| 三、论文创新点 | 第28-29页 |
| 第二章 东北稻田水体噬藻体g20 基因多样性 | 第29-45页 |
| 第一节 材料与方法 | 第30-32页 |
| 一、稻田水样的采集 | 第30页 |
| 二、DNA提取及PCR扩增 | 第30-31页 |
| 三、克隆、变性梯度凝胶电泳（DGGE）和测序 | 第31页 |
| 四、系统发育分析 | 第31-32页 |
| 第二节 结果与分析 | 第32-42页 |
| 一、环境DNA提取、PCR扩增、阳性克隆检测及DGGE分析 | 第32页 |
| 二、g20 基因的最近亲缘序列分析 | 第32-34页 |
| 三、g20 基因的系统发生 | 第34-39页 |
| 四、g20 基因群集的UniFrac分析 | 第39-42页 |
| 第三节 讨论 | 第42-44页 |
| 一、中国东北稻田水体中g20 基因的系统发育位置 | 第42页 |
| 二、稻田水体中g20 基因的噬藻体寄主 | 第42-43页 |
| 三、稻田水体与其他环境噬藻体群落g20 基因群集的比较 | 第43-44页 |
| 第四节 小结 | 第44-45页 |
| 第三章 东北稻田水体噬藻体psbA基因多样性 | 第45-57页 |
| 第一节 材料与方法 | 第46-47页 |
| 一、稻田水样的采集 | 第46页 |
| 二、试验材料与试验方法 | 第46-47页 |
| （一）DNA提取及PCR扩增 | 第46页 |
| （二）克隆与测序 | 第46页 |
| （三）系统进化分析 | 第46-47页 |
| 第二节 结果与分析 | 第47-53页 |
| 一、稻田水体病毒DNA提取及PCR扩增 | 第47-48页 |
| （一）水体中病毒DNA的提取 | 第47页 |
| （二）稻田水体中psbA基因的扩增 | 第47-48页 |
| 二、稻田水体psbA基因的克隆与比对 | 第48-50页 |
| （一）psbA基因克隆及阳性克隆的筛选及测序 | 第48-49页 |
| （二）psbA基因的最近亲缘序列分析 | 第49-50页 |
| 三、psbA基因的系统进化分析 | 第50-53页 |
| 第三节 讨论 | 第53-56页 |
| 一、实验方法 | 第53页 |
| 二、东北稻田水体psbA基因的来源 | 第53-55页 |
| 三、稻田水体中噬藻体psbA基因多样性 | 第55-56页 |
| 第四节 小结 | 第56-57页 |
| 第四章 稻田水体蓝藻的分离与鉴定 | 第57-75页 |
| 第一节 材料与方法 | 第58-61页 |
| 一、稻田水样及土壤的采集 | 第58页 |
| 二、试验材料与方法 | 第58-61页 |
| （一）稻田蓝藻的富集 | 第58-59页 |
| （二）稻田蓝藻的分离与纯化 | 第59页 |
| （三）蓝藻DNA提取 | 第59页 |
| （四）蓝藻的 16S rDNA及psbA基因的PCR扩增 | 第59-60页 |
| （五）系统发育分析 | 第60-61页 |
| 第二节 结果与分析 | 第61-71页 |
| 一、来自中国东北稻田蓝藻的形态学特征 | 第61-64页 |
| 二、蓝藻 16S rRNA基因和psbA基因扩增 | 第64-66页 |
| （一）DNA的提取 | 第64页 |
| （二）蓝藻的 16 S rRNA及psbA基因的扩增 | 第64-65页 |
| （三）蓝藻的 16 S rRNA及psbA基因片段的纯化 | 第65页 |
| （四）蓝藻的 16S rRNA和psbA基因阳性克隆的检测 | 第65页 |
| （五）蓝藻 16S rRNA基因阳性克隆的菌体PCR产物及DGGE图谱 | 第65-66页 |
| 三、基于蓝藻的 16S rRNA基因和psbA基因的系统进化分析 | 第66-71页 |
| 第三节 讨论 | 第71-74页 |
| 一、蓝藻的分离及其形态学特征 | 第71-73页 |
| 二、基于 16S rRNA基因鉴定蓝藻菌株 | 第73页 |
| 三、基于psbA基因对蓝藻的分离鉴定 | 第73-74页 |
| 第四节 小结 | 第74-75页 |
| 第五章 蓝藻伴生菌的分离与鉴定 | 第75-88页 |
| 第一节 材料与方法 | 第76-79页 |
| 一、供试蓝藻菌株 | 第76页 |
| 二、供试土壤 | 第76-77页 |
| 三、试验设计 | 第77-78页 |
| 四、菌体DNA提取 | 第78页 |
| 五、蓝藻伴生菌 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第78页 |
| 六、系统发育分析 | 第78-79页 |
| 第二节 结果与分析 | 第79-84页 |
| 一、东北稻田水体蓝藻分离纯化的伴生细菌系统进化分析 | 第79-81页 |
| 二、不同土壤样品中Anabaena伴生菌的系统进化分析 | 第81-84页 |
| 第三节 讨论 | 第84-87页 |
| 一、东北稻田水体蓝藻伴生细菌的鉴定 | 第84-85页 |
| 二、不同土壤中Anabaena伴生细菌的鉴定 | 第85-86页 |
| 三、蓝藻伴生细菌分离方法 | 第86-87页 |
| 第四节 小结 | 第87-88页 |
| 第六章 结论与展望 | 第88-90页 |
| 一、研究结论 | 第88页 |
| 二、本研究的不足之处 | 第88-89页 |
| 三、研究展望 | 第89-90页 |
| 附录一、试剂与培养基配方 | 第90-91页 |
| 附录二、实验方法与操作步骤 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-104页 |
| 发表文章目录 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
