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甘蔗叶片和茎全长cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
第一章 文献综述第14-37页
 1 cDNA 文库研究进展第14-21页
   ·cDNA 文库的概念及构建原理第14页
   ·cDNA 文库的分类第14-15页
   ·全长cDNA 文库的概述第15-17页
   ·全长cDNA 文库的构建方法、原理及优缺点第17-21页
 2 DNA 测序技术及研究进展第21-23页
 3 EST 技术研究进展第23-27页
   ·EST 概念及研究概况第23页
   ·EST 技术形成的原理第23-24页
   ·EST 技术的主要应用第24-26页
   ·EST 技术的局限性第26-27页
 4 生物信息学在EST 中的应用第27-34页
   ·生物信息学概念、产生背景及研究内容第27-28页
   ·生物信息学相关数据库第28-29页
   ·生物信息学在EST 技术中的应用第29-34页
 5 甘蔗EST 的研究现状第34-35页
 6 本研究目的及技术路线第35-37页
   ·研究目的第35页
   ·技术路线第35-37页
第二章 甘蔗叶片及茎全长cDNA 文库构建第37-53页
 1 材料与方法第37-46页
   ·材料第37-38页
   ·方法第38-46页
 2 结果与分析第46-49页
   ·甘蔗叶片和茎总RNA 的提取及mRNA 的分离纯化第46-47页
   ·双链cDNA(dscDNA)的合成及检测第47页
   ·文库的质量鉴定第47-49页
 3 讨论第49-53页
   ·总RNA 和mRNA 质量第49页
   ·构建cDNA 文库所用载体的选择第49-50页
   ·全长cDNA 文库构建方法的选择及改进第50-51页
   ·cDNA 全长判定第51-53页
第三章 甘蔗叶片和茎表达序列标签(EST)测序和分析第53-68页
 1 材料与方法第53-59页
   ·材料第53-54页
   ·方法第54-59页
 2 结果与分析第59-64页
   ·大规模质粒DNA 的提取及EST 产生第59页
   ·有效EST 的获得第59-61页
   ·EST 序列的拼接结果第61页
   ·EST 序列注释及功能分类第61-64页
 3 讨论第64-68页
   ·EST 测序第64-66页
   ·EST 序列生物信息学分析第66-68页
第四章 几个抗逆基因的生物信息学分析及原核表达和Real-time PCR 分析第68-125页
 1 材料与方法第69-77页
   ·材料第69-70页
   ·方法第70-77页
 2 结果与分析第77-115页
   ·Sc-Lea 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第77-81页
   ·Sc-MnSOD 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第81-86页
   ·Sc-zf 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第86-92页
   ·Sc-SAMDC 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第92-99页
   ·Sc-WRKY 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第99-105页
   ·Sc-GST 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第105-110页
   ·Sc-CyP 的生物信息学分析及原核表达和表达特性分析第110-115页
 3 讨论第115-125页
   ·甘蔗胚胎晚期丰富蛋白基因(Sc-Lea)第115-117页
   ·甘蔗锰超氧化物歧化酶基因(Sc-MnSOD)第117-118页
   ·甘蔗锌指蛋白基因(Sc-zf)第118-119页
   ·甘蔗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因(Sc-SAMDC)第119-121页
   ·甘蔗WRKY 转录因子(Sc-WRKY)第121-122页
   ·甘蔗谷胱甘肽硫转移酶基因(Sc-GST)第122-123页
   ·甘蔗亲环蛋白基因(Sc-CyP)第123-125页
第五章 结论与展望第125-128页
参考文献第128-143页
附表及附录第143-157页
 附表1 甘蔗叶片117 个EST 所代表的87 种功能已知蛋白功能分类表第144-148页
 附表2 甘蔗茎134 个EST 所代表的103 种功能已知蛋白功能分类表第148-154页
 附表3 缩略词表第154-155页
 附表4 主要试剂溶液及其配制表第155-156页
 附录Ⅰ Honglang 营养液的配制第156-157页
致谢第157页

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