| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一部分 文献综述 | 第9-16页 |
| 1.噬藻体概述 | 第9-10页 |
| 2.噬藻体的分子生物学特征 | 第10-12页 |
| 3.噬藻体的多样性及分布 | 第12-15页 |
| 4.噬藻体PP的遗传性质及生态分布 | 第15页 |
| 5.本实验研究的目的及意义 | 第15-16页 |
| 第二部分 噬藻体PP测序引物的优化设计 | 第16-25页 |
| 1.实验材料与试剂 | 第16-17页 |
| ·材料 | 第16页 |
| ·实验所用主要试剂 | 第16-17页 |
| ·培养基和试剂配制 | 第17页 |
| 2.主要仪器设备 | 第17页 |
| 3.实验方法 | 第17-22页 |
| ·模板的制备 | 第17-19页 |
| ·PCR反应 | 第19-20页 |
| ·电泳 | 第20页 |
| ·目的片断的回收,纯化,检测 | 第20页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第20页 |
| ·目的片断的连接 | 第20-21页 |
| ·转化克隆 | 第21页 |
| ·质粒的提取 | 第21-22页 |
| ·克隆测序及序列分析 | 第22页 |
| ·159B引物的设计 | 第22页 |
| 4.实验结果 | 第22-24页 |
| ·PCR扩增产物 | 第22页 |
| ·159引物的温度梯度扩增结果 | 第22-23页 |
| ·优化反应程序后159PCR扩增结果 | 第23页 |
| ·测序结果 | 第23-24页 |
| ·159B引物的确定 | 第24页 |
| 5.讨论 | 第24-25页 |
| 第三部分 武汉东湖噬藻体PP遗传多样性研究——PCR法 | 第25-30页 |
| 1.材料和仪器 | 第25-26页 |
| ·生物材料 | 第25页 |
| ·培养基 | 第25页 |
| ·化学试剂及分子试剂 | 第25-26页 |
| ·主要仪器 | 第26页 |
| 2.方法 | 第26-28页 |
| ·采样点的选择 | 第26-27页 |
| ·环境水样的采集与噬藻体PP类噬藻体的分离 | 第27页 |
| ·159B引物扩增 | 第27页 |
| ·PCR产物胶回收纯化 | 第27-28页 |
| 3.实验结果 | 第28-29页 |
| ·环境样品中噬藻体PP类噬藻体的PCR扩增结果 | 第28页 |
| ·序列相似性比较 | 第28-29页 |
| 4.讨论 | 第29-30页 |
| 第四部分 武汉东湖噬藻体PP遗传多样性研究——RAPD法 | 第30-34页 |
| 1.实验材料与试剂 | 第30-31页 |
| ·材料 | 第30-31页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第31页 |
| 2.实验方法 | 第31-32页 |
| ·环境水样中噬藻体PP全基因组核酸的提取 | 第31-32页 |
| ·RAPD | 第32页 |
| 3.实验结果 | 第32-33页 |
| 4.讨论 | 第33-34页 |
| 第五部分 噬藻体PP基因组序列测定 | 第34-41页 |
| 1.实验材料和试剂 | 第34-35页 |
| ·实验材料 | 第34页 |
| ·试剂和培养基 | 第34-35页 |
| 2.实验方法 | 第35-36页 |
| ·织线藻病毒的大量增殖模型的建立 | 第35页 |
| ·织线藻病毒的分离与纯化和基因组DNA的提取-方法1 | 第35-36页 |
| ·织线藻病毒的分离与纯化和基因组DNA的提取-方法2 | 第36页 |
| ·基因组的酶切 | 第36页 |
| 3.实验结果 | 第36-39页 |
| ·纯化与提取方法1提取基因组DNA及酶切的结果 | 第36-38页 |
| ·纯化与提取方法2提取基因组DNA及酶切的结果 | 第38-39页 |
| ·基因组测序结果-见附录2 | 第39页 |
| ·测序结果的BlastX分析结果简表-见附录3 | 第39页 |
| 4.讨论 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-45页 |
| 附录1:东湖水样的PCR产物的测序结果 | 第45-47页 |
| 附录2:噬藻体PP全基因组测序结果 | 第47-82页 |
| 附录3:测序结果的BLASTX分析结果简表 | 第82-91页 |
| 在校期间发表的论文及科研成果等 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92页 |
