| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-15页 |
| §1-1 人类基因组计划（HGP） | 第10-11页 |
| §1-2 相关生物学知识 | 第11-15页 |
| 1-2-1 核苷酸序列 | 第11-12页 |
| 1-2-2 哺乳动物基因组的mosaic 结构 | 第12-13页 |
| 1-2-3 MHC 序列及其结构 | 第13-14页 |
| 1-2-4 Isochore 结构分析的几种常见方法 | 第14-15页 |
| 第二章 双窗口模型技术 | 第15-18页 |
| §2-1 DNA 序列的滑动窗口模型技术 | 第15-16页 |
| §2-2 双窗口模型——对滑动窗口模型的改进 | 第16-18页 |
| 第三章 小波多尺度分析理论 | 第18-28页 |
| §3-1 引言 | 第18页 |
| §3-2 Fourior 变换和小波变换 | 第18-21页 |
| 3-2-1 Fourior 变换 | 第18-20页 |
| 3-2-2 小波分析 | 第20-21页 |
| §3-3 常用的小波函数（Daubechies 小波系） | 第21-23页 |
| §3-4 离散小波变换和二进制小波变换 | 第23-25页 |
| 3-4-1 离散小波变换 | 第23-24页 |
| 3-4-2 二进制小波变换 | 第24-25页 |
| §3-5 多分辨率分析（Multiresolution Analysis） | 第25-27页 |
| §3-6 小波对信号的消噪和小波分析在生物信息学中的应用 | 第27-28页 |
| 第四章 识别 ISOCHORE 的边界 | 第28-40页 |
| §4-1 引言 | 第28页 |
| §4-2 材料与方法 | 第28-30页 |
| 4-2-1 材料 | 第28-29页 |
| 4-2-2 双窗口模型的应用 | 第29页 |
| 4-2-3 小波对信号的消噪处理 | 第29-30页 |
| 4-2-4 区域的合并原则 | 第30页 |
| §4-3 结果与讨论 | 第30-38页 |
| 4-3-1 人类组织相容性复合体（MHC）的isochore 结构 | 第30-31页 |
| 4-3-2 人类21 号、22 号和Y 染色体的isochore 结构 | 第31-38页 |
| §4-4 结论 | 第38-40页 |
| 第五章 微生物基因识别与肠细菌病毒岛分析 | 第40-52页 |
| §5-1 微生物基因识别 | 第40-49页 |
| 5-1-1 引言 | 第40页 |
| 5-1-2 基因预测及产物分析 | 第40-42页 |
| 5-1-3 基因预测产物的功能 | 第42-45页 |
| 5-1-4 基因组的进化分析 | 第45-49页 |
| §5-2 肠细菌毒力岛分析 | 第49-52页 |
| 5-2-1 毒力岛的概念及特征 | 第49-50页 |
| 5-2-2 大肠杆菌的毒力岛 | 第50页 |
| 5-2-3 志贺氏痢疾杆菌的毒力岛 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
