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棉纤维初始发育相关基因及转录因子的克隆与鉴定

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第12-13页
第一部分 文献综述第13-23页
 1 棉花纤维的形成第13-15页
   ·棉花纤维的发育过程第13-14页
   ·纤维原始细胞的分化和突起第14-15页
 2 棉花的种类和基因型第15页
 3 棉花纤维突变体第15-16页
 4 模式植物拟南芥表皮毛发育的研究概况第16-18页
   ·MYB-bHLH-WD40蛋白复合体调控表皮细胞分化的命运第16-17页
   ·拟南芥中调控表皮毛发育的重要基因第17-18页
 5 植物中的转录因子基因第18-23页
   ·MYB转录因子的结构特征第19-21页
   ·棉纤维发育基因及转录因子的研究进展第21-23页
     ·棉花中的MYB1到MYB6基因第21-22页
     ·转录因子GhMYB109第22页
     ·转录因子RDL1和GaMYB2(Fif1)第22页
     ·转录因子GhMYB7和GhMYB9第22-23页
第二部分 研究报告第23-83页
 引言第23页
 1 实验材料第23-30页
   ·植物材料第23-24页
   ·菌种和质粒第24页
   ·试剂第24-25页
   ·棉花MYB基因信息第25-26页
   ·引物第26-30页
 2 实验方法第30-41页
   ·棉花RNA的提取第30-32页
     ·改进的热硼酸法(提取除叶片外的棉花各组织)第30-31页
       ·实验前准备第30-31页
       ·实验步骤第31页
     ·CTAB法提取总RNA(用于棉花叶片的总RNA提取)第31-32页
   ·RACE步骤第32-33页
   ·差异显示PCR(DDRT-PCR)第33-35页
     ·差异显示PCR引物第33页
     ·cDNA片段的扩增第33-34页
     ·PAGE分析第34-35页
       ·PAGE电泳的准备第34页
       ·5%PAGE胶的制备第34页
       ·预电泳第34页
       ·上样第34页
       ·银染第34-35页
     ·差异片段的回收与再扩增第35页
       ·差异片段的回收第35页
       ·再扩增第35页
   ·扩增产物的电泳,回收,克隆及测序第35-36页
   ·RT-PCR第36-37页
     ·DNA的消化第36页
     ·cDNA第一链的合成第36-37页
     ·RT-PCR第37页
   ·棉花基因组DNA的提取第37-39页
   ·Southern杂交分析第39-41页
     ·基因组DNA酶切反应体系第39页
     ·试剂及其配制第39页
     ·Southern印迹第39-40页
     ·DIG标记探针第40页
     ·杂交第40-41页
     ·洗膜与显色第41页
   ·植物表达载体的构建第41页
   ·序列分析与进化树的构建第41页
 3 结果与讨论第41-83页
   ·棉纤维突变体的ODPA胚珠mRNA差异显示(DDRT-PCR)第41-48页
     ·总RNA的完整性第41-42页
     ·差异片段的获得第42-43页
     ·差异片段的再扩增与测序第43-44页
     ·RT-PCR验证假阳性第44页
     ·差异片段序列的延伸第44-47页
     ·讨论第47-48页
       ·mRNA著异显示法(DDRT-PCR)的缺陷第47-48页
       ·差异片段偏少的原因第48页
       ·差异片段的分析第48页
   ·三个转录因子基因的克隆与研究第48-66页
     ·基因GhTF1的克隆和表达研究第48-55页
       ·GhTF1全长基因的分离第48-50页
       ·GhTF1氨基酸序列的分析第50-51页
       ·棉花GhTF1与其它作物中同源基因的比较分析第51-52页
       ·GhTF1的表达分析第52-53页
       ·二倍体基因组中GhTF1序列变异分析和聚类结果第53页
       ·GhTF1的Southern杂交分析第53-54页
       ·GhTF1的正义植物表达载体构建第54-55页
         ·载体构建的思路第54页
         ·载体构建的验证第54-55页
     ·基因GhTF2的克隆和表达研究第55-60页
       ·GhTF2全长基因的分离第55-57页
       ·GhTF2氨基酸序列的分析结果第57-58页
       ·棉花GhTF2与其它作物中同源基因的比较分析第58-59页
       ·GhTF2的表达分析第59页
       ·二倍体基因组中GhTF2序列变异分析和聚类结果第59-60页
     ·基因GhTF3的克隆和表达研究第60-64页
       ·GhTF3全长基因的分离第60-61页
       ·GhTF3氨基酸序列的分析结果第61-62页
       ·棉花GhTF3与其它作物中同源基因的比较分析第62-63页
       ·GhTF3的表达分析第63-64页
       ·二倍体基因组中GhTF3序列变异分析和聚类结果第64页
     ·讨论第64-66页
   ·棉花MYB类基因的结构、表达及染色体定位研究第66-83页
     ·棉花中的MYB基因第66-67页
     ·二倍体基因组中MYB基因全长的克隆和序列分析第67-73页
       ·二倍体中MYB基因全长序列的获得第67-68页
       ·MYB基因中内含子情况分析第68页
       ·基因编码区序列差异分析第68-73页
       ·A、D基因组序列变异频率的比较第73页
       ·SNPs出现对氨基酸序列的影响第73页
       ·基因非编码区的序列差异第73页
     ·MYB基因表达水平的分析第73-75页
       ·亚洲棉材料中MYB基因的时空表达分析第73-74页
       ·无纤维突变体材料中MYB基因表达的检测第74-75页
     ·Ghmyb25的反义植物表达载体构建第75-76页
       ·载体构建的思路第75页
       ·载体构建的验证第75-76页
     ·MYB基因的染色体定位第76-80页
       ·基因GhTF1的染色体定位第76页
       ·基因GhMYB6的染色体定位第76-77页
       ·基因Ghmyb36的染色体定位第77页
       ·基因Ghmyb9的染色体定位第77-80页
     ·讨论第80-83页
       ·MYB转录因子中的R2R3结构域第80页
       ·MYB基因的序列变异第80页
       ·MYB基因的特异表达第80-81页
       ·本实验中染色体定位方法的讨论第81-82页
       ·MYB基因染色体定位的意义第82-83页
全文结论第83-84页
参考文献第84-92页
致谢第92页

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