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废水处理系统中功能菌株分子标记的获得及应用检测

研究论文 废水处理系统中功能菌株分子标记的获得及初步检测应用第1-44页
 中文摘要第6-7页
 英文摘要第7-9页
 引言第9-13页
 第一章 废水处理功能菌的RAPD分析及SCAR标记的转化第13-34页
  1 材料与方法第13-24页
   ·实验材料第13页
   ·菌株与质粒第13-14页
   ·主要药品与试剂第14-15页
   ·培养基和溶液第15-16页
   ·实验方法第16-24页
     ·基因组总DNA提取第17-18页
       ·CTAB提取法第17页
       ·树脂吸附快速提取法第17-18页
     ·RAPD的PCR扩增第18-19页
       ·RAPD扩增条件的优化第18页
       ·RAPD扩增温度程序第18页
       ·RAPD产物电泳与分析第18-19页
       ·PCR大量扩增与电泳第19页
     ·RAPD标记的克隆及其验证与测序第19-23页
       ·目的PCR扩增产物的回收和纯化第19-20页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第20页
       ·目的产物与T-载体连接第20-21页
       ·大肠杆菌高效转化第21-22页
       ·质粒DNA小量提取第22-23页
       ·限制性内切酶酶切与PCR方法鉴定重组子第23页
     ·SEAR的PCR扩增第23-24页
       ·SCAR引物设计第23页
       ·SCAR-PCR获得SCAR标记第23-24页
       ·SCAR标记特异性验证第24页
  2 结果与讨论第24-34页
   ·细菌基因组DNA的提取第24-25页
   ·RAPD-PCR条件的优化第25-26页
     ·Mg2+浓度和模板DNA浓度第25-26页
     ·退火温度和PCR仪第26页
   ·RAPD分析第26-27页
     ·引物的筛选第26-27页
     ·条带分析第27页
   ·RAPD标记的克隆及其验证与测序第27-30页
     ·目的片段的回收、纯化第27-28页
     ·目的片段的克隆及重组子的PCR、限制性内切酶酶切鉴定第28-29页
     ·序列分析第29-30页
   ·SCAR分析第30-34页
     ·SCAR引物设计及SCAR-PCR反应条件的优化第30页
     ·SCAR标记分析第30-31页
     ·SCAR标记特异性验证第31-34页
 第二章 从活性污泥中提取总DNA并用于PCR分析的研究第34-39页
  1 材料和方法第34-36页
   ·材料第34页
   ·方法第34-36页
     ·活性污泥DNA提取第35页
     ·DNA浓度测定和电泳检测第35页
     ·DNA纯度检测第35页
     ·整细胞的显微计数第35-36页
     ·标记引物扩增第36页
  2 结果与讨论第36-39页
   ·不同裂解方法的有效性评价对第36-37页
   ·获得的活性污泥DNA质量评价第37页
   ·标记引物扩增第37-39页
 参考文献第39-44页
文献综述 环境中微生物群落结构及动力学监测的分子生物学方法研究进展第44-70页
 1 核酸探针杂交技术第44-47页
   ·技术原理第44-45页
   ·研究应用第45页
   ·荧光原位杂交技术第45-46页
   ·优点和缺点第46-47页
 2 PCR技术第47-54页
   ·定量PCR技术方法第47-49页
     ·竞争PCR第47-48页
     ·荧光定量PCR(FQ PCR)第48-49页
   ·rDNA同源性分析方法第49-52页
     ·技术原理第49-50页
     ·研究应用第50-51页
     ·rDNA同源性分析相关数据资源及方法第51页
     ·相关的技术第51-52页
       ·变性梯度胶电泳(DGGE)技术第51-52页
       ·扩增的rDNA限制酶切分析技术(ARDRA)第52页
   ·RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)第52-54页
     ·技术原理第52-53页
     ·研究应用第53页
     ·优缺点及其改进第53-54页
 3 免疫学方法第54-56页
   ·技术原理第54-55页
   ·研究应用第55页
   ·荧光标记蛋白第55-56页
   ·方法的优点与缺点第56页
 4 其他分析方法第56-57页
   ·编码特定蛋白的基因第56页
   ·降解特定物质的基因第56-57页
   ·DNA熔解(解链)及复性分析第57页
 5 实践问题与展望第57-59页
 参考文献第59-70页
在读硕士期间发表文章情况第70-71页
致谢第71-72页
声明第72页

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