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15个猪品种MHCⅡ类区4个基因的SNPs分析及与免疫性状的关联

摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
第1章 MHC的研究进展第15-42页
 1 MHC的发现第15-16页
 2 MHC抗原的化学结构、组织分布第16-22页
   ·MHC分子结构第16-20页
     ·MHC Ⅰ类分子结构第16-18页
     ·MHC Ⅱ类分子结构第18-20页
   ·MHC分子的分布第20-21页
     ·MHC Ⅰ类分子第20页
     ·MHC Ⅱ类分子第20-21页
   ·MHC分子的功能第21-22页
 3 MHC与免疫应答第22-24页
   ·MHC在抗原递呈中的作用第22-23页
     ·MHC Ⅰ类分子的抗原递呈第22页
     ·MHC Ⅱ类分子的抗原递呈第22-23页
   ·TCR识别抗原的基础第23页
     ·MHC限制性第23页
     ·TCR识别抗原的机制第23页
   ·免疫应答第23-24页
 4 MHC基因结构及遗传特点第24-29页
   ·MHC基因结构第24-28页
     ·HLA基因结构第24-26页
     ·SLA基因结构第26-28页
   ·MHC的遗传特点第28-29页
     ·单倍型遗传第28页
     ·高度多态性第28-29页
     ·连锁不平衡第29页
 5 MHC产物与基因的分型方法第29-31页
   ·HLA血清学分型第29页
   ·HLA细胞学分型第29-30页
   ·分子学基因分型及有关分子生物学技术第30-31页
     ·PCR-RFLP技术第30页
     ·PCR-SSOP技术第30页
     ·基因芯片或DNA微阵列技术第30-31页
     ·PCR-SSCP技术第31页
     ·PCR-SSP技术第31页
     ·DNA序列测定及其它分型技术第31页
 6 MHC与性状间的关系第31-38页
   ·HLA与疾病的关系第31-33页
   ·SLA与猪的抗病性和经济性状第33-38页
     ·SLA复合体与免疫应答和抗病性第33-36页
     ·SLA复合体与繁殖性状第36页
     ·SLA复合体与生长和胴体性状第36-38页
 7 MHC多态与遗传多样性评估第38-41页
 8 本研究的目的意义第41-42页
第2章 15个猪品种MHC Ⅱ类区4个基因的序列测定及分析第42-96页
 1 前言第42-43页
 2 材料与方法第43-50页
   ·材料第43-45页
     ·DNA样品第43页
     ·培养基、酶及试剂盒第43-44页
     ·菌株和质粒第44页
     ·主要试剂及配制第44-45页
       ·主要试剂第44-45页
       ·其它试剂的配制第45页
     ·主要仪器设备第45页
     ·主要分子生物学软件第45页
   ·方法第45-50页
     ·SLA-DQA和SLA-DRA基因2-3外显子片段的获得第45-46页
       ·引物设计第45-46页
       ·PCR扩增第46页
     ·SLA-DQB和SLA-DRB基因第2外显子的PCR扩增第46-47页
     ·PCR产物的纯化、克隆第47-48页
       ·从低熔点琼脂糖凝胶中回收纯化PCR产物第47页
       ·PCR产物与pGEM-T载体的连接第47页
       ·感受态细胞的制备第47-48页
       ·连接产物的转化第48页
       ·质粒提取及酶切鉴定第48页
     ·DNA序列测定第48-49页
     ·DNA序列分析第49-50页
       ·测序峰图的判读第49-50页
       ·拆分杂合子第50页
       ·核苷酸序列分析第50页
       ·新等位基因分析第50页
     ·品种内与品种间的遗传距离分析第50页
 3 结果第50-92页
   ·SLA-DRA和SLA-DQA的PCR扩增结果第50-51页
     ·DRA的PCR扩增结果第50-51页
     ·DQA的PCR扩增结果第51页
   ·SLA-DRA 2-3外显子和SLA-DQA 2-3外显子测序结果第51-53页
     ·DRA 2-3外显子PCR产物测序结果第51-52页
     ·DQA 2-3外显子克隆及测序结果第52-53页
       ·DQA 2-3外显子重组质粒的酶切鉴定结果第52页
       ·DQA 2-3外显子测序结果第52-53页
   ·SLA-DRA和SLA-DQA基因结构分析第53-56页
     ·DRA基因结构分析第53-54页
     ·DQA基因结构分析第54-56页
   ·SLA-DRA和SLA-DQA在4个全同胞家系中的扩增结果第56-57页
     ·DRA在4个全同胞家系中的扩增结果第56页
     ·DQA在4个全同胞家系中的扩增结果第56-57页
   ·SLA-DRA和SLA-DQA在4个家系中的序列变异分析第57-62页
     ·DRA基因第2外显子序列变异分析第57-59页
       ·DRA基因第2外显子在4个家系中的序列变异分析第57-58页
       ·DRA基因第2外显子氨基酸编码分析第58-59页
     ·DQA基因第2外显子的序列变异分析第59-62页
   ·SLA-DRB第2外显子的扩增与测序结果第62-70页
   ·SLA-DQB第2外显子的扩增与测序结果第70-77页
   ·SLA-DRA、DQA、DRB、DQB基因在15个品种中的变异及SNPs分析第77-84页
     ·DRA第2外显子和第2内含子的变异及新等位基因分析第77-78页
     ·DQA第2外显子和第2内含子的变异及新等位基因的发现第78-80页
     ·DRB第2外显子的变异及新等位基因的发现第80-82页
     ·DQB第2外显子的变异及新等位基因的发现第82-84页
   ·利用SLA-DRA、DRB、DQA、DQB的序列信息分析中外15个猪品种间的亲缘关系第84-92页
     ·利用DRA的核苷酸序列信息分析中外15个猪品种间的亲缘关系第84-87页
       ·DRA第2外显子第84-86页
       ·DRA第2内含子第86-87页
     ·利用DQA的核苷酸序列信息分析中外15个猪品种间的亲缘关系第87-89页
     ·利用DRB的核苷酸序列信息分析中外15个猪品种间的亲缘关系第89-90页
     ·利用DQB的核苷酸序列信息分析中外15个猪品种间的亲缘关系第90-92页
 4 讨论第92-96页
   ·SLA-DRA、DQA、DRB、DQB基因第2外显子的多态性第92页
   ·SLA-DRA和SLA-DQA第2内含子的变异第92-93页
   ·关于SLA-DRA、DQA、DRB、DQB序列的拆分第93页
   ·关于SLA-DRA的两个新等位基因第93-94页
   ·关于SLA-DQA、DRB、DQB的新等位基因第94页
   ·关于利用SLA-DRA、DQA、DRB、DQB第2外显子和SLA-DRA第2内含子的信息分析中外15个猪品种的亲缘关系第94-96页
第3章 SLA-DRB、DQB第2外显子的PCR-RFLP与免疫性状的关联研究第96-113页
 1 前言第96-97页
 2 材料和方法第97-101页
   ·试验动物与试验材料第97-99页
     ·试验动物及DNA样品第97-98页
     ·仪器与试剂第98-99页
       ·主要仪器设备第98页
       ·主要试剂第98页
       ·主要试剂配制第98-99页
   ·方法第99-101页
     ·免疫性状的测定方法第99-100页
       ·血清中IgG的测定第99-100页
       ·红、白细胞计数等6个指标的测定第100页
       ·T-淋巴细胞酸性α-醋酸萘酯酶测定第100页
       ·迟发型皮肤超敏试验第100页
     ·SLA-DRB和SLA-DQB的PCR-RFLP多态检测方法第100-101页
       ·DRB、DQB的PCR扩增第100页
       ·DRB、DQB的PCR-RFLP第100-101页
       ·DRB、DQB的PCR-RFLP检测第101页
     ·基因的PCR-RFLP与性状的关联分析第101页
 3 结果与分析第101-110页
   ·免疫性状测定结果第101-103页
   ·SLA-DRB的PCR-RFLP检测结果第103-105页
     ·DRB的MspⅠ和RsaⅠ的单倍型分析第103-104页
     ·DRB的MspⅠ和RsaⅠ PCR-RFLP在通城猪、长大通和大长通猪中的检测结果第104-105页
   ·SLA-DQB的PCR-RFLP检测结果第105-108页
     ·DQB的RsaⅠ和HaeⅢ的酶切单倍型分析第105-107页
     ·DQB的RsaⅠ和HaeⅢ PCR-RFLP在通城猪、长大通和大长通猪中的检测结果第107-108页
   ·SLA-DRB和SLA-DQB基因的DNA多态性与免疫性状间的关系第108-110页
 4 讨论第110-113页
   ·关于免疫学性状的选择第110-111页
   ·关于免疫学性状测定时间的确定和试验动物的选择第111-112页
   ·关于基因与性状间关联分析结果第112-113页
小结第113-115页
参考文献第115-123页
致谢第123页

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