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家蚕短散在重复元件BmSer_SINE的鉴定和功能研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-17页
第一章 文献综述第17-29页
   ·SINE的基本结构第17-19页
     ·SINEs的头部第18-19页
     ·SINEs的主体第19页
     ·SINEs的尾部第19页
     ·非典型结构的SINE第19页
   ·SINEs的复制机制第19-23页
     ·转录第19-20页
     ·转录后修饰第20-21页
     ·SINE输出到细胞质第21页
     ·SINE传递到反转录酶第21页
     ·SINE入核转运、反转录、整合到基因组第21-23页
   ·SINE活性的调节第23-24页
     ·SINE序列第23页
     ·侧翼序列第23页
     ·染色质环境第23页
     ·甲基化第23-24页
     ·RNA的稳定性第24页
   ·SINE的分布第24页
     ·在基因组中的分布第24页
     ·SINEs在有机体中的分布第24页
   ·SINEs的进化第24-26页
     ·SINEs的起源第24-25页
     ·SINE进化的机制和模式第25-26页
   ·SINEs的功能第26-27页
     ·新基因的产生第26页
     ·调节启动子活性第26-27页
   ·丝胶基因的转录调控第27-29页
第二章 引言第29-33页
   ·研究背景第29页
   ·研究的目的和意义第29页
   ·主要研究内容第29-31页
   ·技术路线第31-33页
第三章 家蚕丝胶1基因启动子的多态性研究第33-45页
   ·材料和方法第33-37页
     ·蚕品种第33页
     ·主要软件和网址第33页
     ·主要试剂和仪器第33-35页
     ·试验方法第35-37页
   ·结果与分析第37-43页
     ·丝胶1基因启动子的调查结果第37-38页
     ·家蚕丝胶1基因启动子的克隆和重组质粒的鉴定第38页
     ·丝胶1基因启动子序列分析第38-43页
   ·讨论第43-45页
第四章 家蚕BmSer_SINE的鉴定研究第45-57页
   ·材料与方法第45-49页
     ·蚕品种第45页
     ·数据库第45页
     ·分析的软件和程序第45-46页
     ·主要试剂和仪器第46-47页
     ·实验所用的主要仪器第47页
     ·实验方法第47-49页
   ·结果与分析第49-54页
     ·家蚕丝胶1基因启动子660bp和1kb序列在家蚕基因组中的比对第49-51页
     ·插入序列在家蚕染色体中分布和插入位点分析第51-52页
     ·插入序列的结构鉴定第52-53页
     ·BmSer_SINE在不同品种中的分布多样性调查。第53-54页
   ·讨论第54-57页
第五章 基于细胞转染对BmSer_SINE的活性研究第57-65页
   ·材料与方法第57-59页
     ·材料第57页
     ·实验试剂和仪器第57页
     ·方法和步骤第57-59页
   ·结果与分析第59-64页
     ·载体构建第59-61页
     ·细胞转染结果第61-64页
   ·讨论第64-65页
第六章 BmSer_SINE对丝胶1基因启动子活性的影响研究第65-81页
   ·材料和方法第65-71页
     ·蚕品种和质粒第65页
     ·实验试剂和仪器第65-67页
     ·实验方法第67-71页
   ·结果与分析第71-77页
     ·载体构建第71-72页
     ·转基因蚕阳性个体的检测第72-74页
     ·Southern杂交分析G1代转基因蚕第74页
     ·基于定量PCR检测DsRed的转录水平第74-75页
     ·基于Western blot检测DsRed的表达量第75-76页
     ·丝胶1基因启动子组织特异性表达第76-77页
   ·讨论第77-81页
     ·丝胶1基因启动子转录活性第77-78页
     ·DsRed荧光蛋白表达量差异第78-79页
     ·丝胶1基因的组织特异性表达第79-81页
第七章 BmSer_SINE作为增强子的机理初探第81-99页
   ·材料与方法第81-85页
     ·蚕品种第81页
     ·数据库第81页
     ·分析的工具软件第81页
     ·主要试剂及配方第81-83页
     ·主要仪器第83页
     ·实验方法第83-85页
   ·结果第85-97页
     ·Cy3末端标记探针的制备第85页
     ·细胞蛋白的抽提第85-86页
     ·凝胶迁移实验结果第86页
     ·滞后蛋白的LC/MS/MS分析第86-90页
     ·BmSer_SINE增强子广谱性的探讨第90-97页
   ·讨论第97-99页
     ·BmSer_SINE序列增强子的机理第97页
     ·BmSer_SINE序列增强蛋白质翻译机理第97-98页
     ·Bm_SerSINE作为增强子活性的广谱性第98-99页
第八章 小结与结论第99-101页
   ·家蚕丝胶1基因启动子片段存在多态性第99页
   ·丝胶1基因启动子中插入片段鉴定为BmSer_SINE第99页
   ·BmSer_SINE具有启动子活性第99页
   ·BmSer_SINE增强丝胶1基因启动子转录活性第99-100页
   ·BmSer_SINE作为增强子的广谱性第100-101页
论文的创新点第101-103页
参考文献第103-111页
附录第111-139页
在读期间发表的论文及参加课题第139-141页
致谢第141-142页

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