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平邑甜茶MhVPE基因的克隆及其生物信息学分析

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-12页
1. 前言第12-20页
   ·液泡加工系统第12-13页
   ·植物VPE 的亚家族第13页
   ·VPE 的底物专一性第13页
   ·VPE 的生物合成第13-14页
   ·VPEs 的生理作用第14-19页
     ·VPEs 在种子贮藏蛋白加工过程中的作用第14页
     ·VPE 通过裂解Asn-Gln 键产生功能蛋白第14-15页
     ·VPE 在细胞程序性死亡中的作用第15-18页
       ·VPE 与caspase 在结构上的相似性第15页
       ·VPE 与caspase 在功能上的相似性第15-17页
       ·VPE 与caspase 在调控PCD 机制上的相似性第17-18页
     ·VPE 在植物衰老过程及胁迫条件下的作用第18-19页
   ·本研究目的和意义第19-20页
2 材料与方法第20-36页
   ·试验材料第20-21页
     ·试材第20页
     ·菌株与质粒第20页
     ·酶及生化试剂第20页
     ·PCR 引物第20-21页
   ·试验方法第21-36页
     ·平邑甜茶总RNA 的提取第21-22页
       ·改进快速CTAB法提取步骤第21页
       ·传统CTAB 法和SLS 法提取RNA 步骤第21-22页
     ·RT-PCR 反转录合成cDNA第22-23页
     ·MhVPE 全长序列的扩增第23-28页
       ·巢式PCR 扩增MhVPE 中间片段第23-24页
       ·3’-RACE 法扩增 3’端序列第24-25页
       ·5’RACE 获得5’端序列第25-28页
     ·DNA 片段与克隆载体的连接第28-29页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第29页
     ·碱法小量质粒DNA 的提取第29-30页
     ·凝胶电泳中DNA 片段的回收第30-31页
     ·质粒DNA 的酶切鉴定第31页
     ·DNA 序列测定第31页
     ·平邑甜茶 MhVPE 基因正义表达载体的构建第31-32页
     ·MhVPE 基因反义表达载体的构建第32-33页
     ·根癌农杆菌LBA4404 感受态细胞的制备与转化第33-35页
     ·生物信息学分析第35-36页
3. 结果与分析第36-70页
   ·果树RNA 提取方法的改进第36-38页
     ·改进快速CTAB 法与传统CTAB 法及SLS 法的比较第36-37页
     ·改进快速CTAB 法提取不同果树材料RNA 的效果第37-38页
   ·平邑甜茶MhVPE 基因的克隆第38-39页
     ·MhVPE 中间片段的分离第38-39页
     ·MhVPE 5’片段的分离第39页
     ·MhVPE 3’片段的分离第39页
     ·MhVPE 全长cDNA 的分离第39页
   ·平邑甜茶MhVPE 核苷酸分析第39-45页
     ·平邑甜茶MhVPE核苷酸序列第42页
     ·平邑甜茶MhVPE 密码子偏好性分析第42-44页
     ·平邑甜茶 MhVPE 甲基化位点预测第44-45页
   ·平邑甜茶MhVPE 编码蛋白的结构分析第45-59页
     ·平邑甜茶MhVPE 一级结构分析第45-52页
       ·平邑甜茶 MhVPE 氨基酸组成及理化性质分析第45-46页
       ·平邑甜茶 MhVPE 疏水性/亲水性分析第46-48页
       ·平邑甜茶MhVPE 与其他VPE 氨基酸序列同源性分析第48-50页
       ·平邑甜茶MhVPE 与其他VPE 蛋白的聚类分析第50-52页
     ·平邑甜茶MhVPE 二级结构及属性分析第52-58页
       ·平邑甜茶MhVPE 二级结构分析第52-56页
       ·平邑甜茶MhVPE 跨膜区分析第56-58页
     ·平邑甜茶MhVPE 空间结构预测第58-59页
       ·平邑甜茶MhVPE 折叠化状态分析第58页
       ·平邑甜茶MhVPE 三维结构预测第58-59页
   ·平邑甜茶MhVPE 功能分析第59-67页
     ·平邑甜茶MhVPE 修饰位点分析第59-61页
     ·平邑甜茶 MhVPE 信号肽分析第61-63页
     ·平邑甜茶MhVPE 亚细胞定位分析第63-64页
     ·平邑甜茶MhVPE 生理功能预测第64-66页
     ·平邑甜茶MhVPE 与人类hcapase-1 的比较第66-67页
   ·平邑甜茶MhVPE 表达载体的构建第67-70页
     ·转基因烟草正义表达载体 pBI121-MhVPE 的构建第67-69页
     ·反义表达载体 pBI121-anti-MhVPE 的构建第69-70页
4. 讨论第70-73页
   ·果树 RNA 提取技术第70页
   ·平邑甜茶 MhVPE 基因的克隆与分析第70-73页
5. 结论第73-74页
参考文献第74-80页
致谢第80-81页
攻读硕士学位期间完成论文情况第81页

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