蚁群算法和编码理论在序列分析中的应用
摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-12页 |
第1章 绪论 | 第12-21页 |
·选题背景和意义 | 第12-13页 |
·研究现状 | 第13-19页 |
·双序列比对现状 | 第13-14页 |
·多序列比对现状 | 第14-15页 |
·蚁群算法 | 第15-16页 |
·蚁群比对 | 第16-17页 |
·序列的图形表示及相似性分析 | 第17-19页 |
·本文的主要工作 | 第19页 |
·本文的章节安排 | 第19-20页 |
·小结 | 第20-21页 |
第2章 基于点阵图的蚁群双序列比对算法 | 第21-30页 |
·双序列比对算法 | 第21-25页 |
·算法的基本原理 | 第21-23页 |
·算法的实现 | 第23-24页 |
·算法的步骤 | 第24-25页 |
·实验及结果分析 | 第25-28页 |
·小结 | 第28-30页 |
第3章 基于多维图形的蚁群多序列比对方法 | 第30-46页 |
·多序列比对 | 第30-31页 |
·生物序列在超立方体上的表示 | 第31-39页 |
·立方体 | 第32-37页 |
·三维图形表示序列 | 第32-36页 |
·空间图形平面化 | 第36-37页 |
·更多维的图形表示 | 第37-39页 |
·引入蚁群算法来寻找多序列比对结果 | 第39-42页 |
·实验及结果分析 | 第42-45页 |
·小结 | 第45-46页 |
第4章 编码方法在序列和结构分析中的应用 | 第46-61页 |
·DNA 序列的数字表示方法 | 第46-50页 |
·改进的DNA 序列数字表示方法 | 第50-55页 |
·RNA 二级结构的数字表示方法 | 第55-58页 |
·相似性分析 | 第58-60页 |
·小结 | 第60-61页 |
结束语 | 第61-63页 |
参考文献 | 第63-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文和参加的项目 | 第69页 |