| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 主要缩略词 | 第13-17页 |
| 1 文献综述 | 第17-50页 |
| ·耐辐射球菌的研究进展 | 第17-32页 |
| ·耐辐射球菌的分类、生长特性和形态结构 | 第17-20页 |
| ·耐辐射球菌的基因组 | 第20-21页 |
| ·耐辐射球菌的电离辐射抗性机制 | 第21-28页 |
| ·耐辐射球菌氧化抗性机制 | 第28-32页 |
| ·OxyR的研究进展 | 第32-38页 |
| ·OxyR的结构及作用 | 第32-33页 |
| ·OxyR调节子的组成 | 第33页 |
| ·OxyR调节子的作用 | 第33-35页 |
| ·OxyR调控作用的分子机制 | 第35-38页 |
| ·参考文献 | 第38-50页 |
| 2 耐辐射球菌DRA0336的生物信息学分析以及突变株和相关 | 第50-70页 |
| ·引言 | 第50-51页 |
| ·实验材料与方法 | 第51-57页 |
| ·试剂与仪器 | 第51页 |
| ·生物信息学分析 | 第51-52页 |
| ·菌株,质粒与生长条件 | 第52-54页 |
| ·基因缺失突变株的构建方法 | 第54-55页 |
| ·突变体的功能补偿株的构建 | 第55页 |
| ·DRA0336 C_(228),C_(272)和C_(290)位点的定点突变 | 第55-57页 |
| ·结果与分析 | 第57-66页 |
| ·DRA0336的生物信息学分析 | 第57-62页 |
| ·DRA0336缺失突变株的构建 | 第62-63页 |
| ·DRA0336和DR0615缺失的双突变株的构建 | 第63-64页 |
| ·D.radiodurans OxyR同源物的敲除突变株对过氧化氢敏感 | 第64-66页 |
| ·讨论 | 第66-67页 |
| ·参考文献 | 第67-70页 |
| 3 耐辐射球菌MOxyR_2突变株和补偿株的特性分析 | 第70-89页 |
| ·引言 | 第70页 |
| ·材料与方法 | 第70-76页 |
| ·试剂与仪器 | 第70页 |
| ·菌株及生长条件 | 第70-72页 |
| ·过氧化氢处理后耐辐射球菌细胞存活率分析 | 第72页 |
| ·~(60)Co电离辐射处理后耐辐射球菌细胞存活率分析 | 第72页 |
| ·蛋白溶液中过氧化氢酶总活性的测定 | 第72-73页 |
| ·细胞内活性氧(ROS)积累量的测定 | 第73-74页 |
| ·耐辐射球菌DRA0336补偿大肠杆菌OxyR突变株GS09的菌株构建 | 第74页 |
| ·大肠杆菌的过氧化氢敏感性实验 | 第74-75页 |
| ·实时定量PCR | 第75-76页 |
| ·结果与分析 | 第76-85页 |
| ·oxyR_2基因的敲除导致突变株对过氧化氢氧化胁迫很敏感 | 第76-77页 |
| ·双突变株对过氧化氢处理更敏感 | 第77-78页 |
| ·oxyR_2基因的敲除导致突变株细胞内积累更多的活性氧(ROS) | 第78-79页 |
| ·oxyR_2基因的敲除削弱过氧化氢酶的总活性 | 第79-80页 |
| ·耐辐射球菌OxyR_2的C_(228)是一个关键位点 | 第80-82页 |
| ·耐辐射球菌OxyR_2不能补偿E coli的OxyR突变株GS09 | 第82-83页 |
| ·突变株MOxyR_2和MOxyR不伴随oxyR和oxyR2转录水平的补偿 | 第83-85页 |
| ·讨论 | 第85-87页 |
| ·参考文献 | 第87-89页 |
| 4 耐辐射球菌DRA0336突变株的转录谱的分析 | 第89-107页 |
| ·引言 | 第89-90页 |
| ·实验材料与方法 | 第90-95页 |
| ·基因芯片和实时定量PCR所需的试剂和仪器 | 第90-91页 |
| ·细菌培养和处理 | 第91页 |
| ·耐辐射球菌总RNA的抽提,质检和浓度测定 | 第91-92页 |
| ·耐辐射球菌寡核苷酸芯片的制备 | 第92页 |
| ·杂交探针的制备 | 第92-93页 |
| ·寡核苷酸芯片的预杂交,杂交和清洗 | 第93页 |
| ·数据分析 | 第93-95页 |
| ·实时定量PCR(quantitative real-time PCR,QRT-PCR) | 第95页 |
| ·结果与分析 | 第95-102页 |
| ·突变株转录谱明显改变 | 第95-101页 |
| ·QRT-PCR方法验证芯片数据 | 第101-102页 |
| ·讨论 | 第102-105页 |
| ·参考文献 | 第105-107页 |
| 5 耐辐射球菌紫外辐射后的转录组研究 | 第107-123页 |
| ·引言 | 第107-108页 |
| ·实验材料与方法 | 第108-109页 |
| ·试剂与仪器 | 第108页 |
| ·细菌培养和紫外辐照处理 | 第108页 |
| ·耐辐射球菌UV辐射的存活率测定 | 第108页 |
| ·RNA提取,芯片杂交和数据分析 | 第108-109页 |
| ·实时定量PCR | 第109页 |
| ·结果和讨论 | 第109-120页 |
| ·指数期耐辐射球菌UV辐射后的存活率 | 第109-110页 |
| ·耐辐射球菌紫外辐射后的生长曲线 | 第110页 |
| ·紫外辐射后的转录组变化 | 第110-119页 |
| ·QRT-PCR方法验证芯片数据 | 第119-120页 |
| ·参考文献 | 第120-123页 |
| 6 小结 | 第123-126页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第126页 |
