| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-19页 |
| 1.1 肠道菌群与人体健康 | 第12页 |
| 1.2 早期肠道菌群建立重要性及影响因素 | 第12-14页 |
| 1.2.1 早期肠道菌群建立重要性 | 第12页 |
| 1.2.2 早期肠道菌群建立影响因素 | 第12-14页 |
| 1.3 肠道菌群分布及多样性的研究方法 | 第14-18页 |
| 1.3.1 传统培养方法 | 第14-15页 |
| 1.3.2 分子生物学方法 | 第15-18页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第18页 |
| 1.5 研究内容 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-27页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第19-23页 |
| 2.1.1 婴儿肠道粪便样本采集 | 第19-20页 |
| 2.1.2 主要生化试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.3 主要仪器与设备 | 第21-22页 |
| 2.1.4 常用培养基及溶液配制 | 第22-23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 婴儿肠道粪便样本的采集与保存 | 第23页 |
| 2.2.2 肠道细菌的培养和分离 | 第23页 |
| 2.2.3 DNA提取及PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.2.4 生物信息学分析 | 第24-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-45页 |
| 3.1 基于传统培养方法的肠道菌群多样性 | 第27-31页 |
| 3.1.1 菌株的分离纯化 | 第27页 |
| 3.1.2 基因组DNA提取 | 第27页 |
| 3.1.3 PCR扩增 | 第27-28页 |
| 3.1.4 16SrDNA序列的鉴定 | 第28-31页 |
| 3.2 肠道粪便基因组提取及16SrDNA序列全长扩增 | 第31-32页 |
| 3.3 各分类水平的分类学组成分析 | 第32-45页 |
| 3.3.1 各分类水平的微生物类群数统计 | 第32页 |
| 3.3.2 分类学组成分析 | 第32-36页 |
| 3.3.3 样本组间分类学组成的差异分析 | 第36-37页 |
| 3.3.4 系统发育分析 | 第37-38页 |
| 3.3.5 Alpha多样性分析 | 第38-40页 |
| 3.3.6 Beta多样性分析 | 第40-43页 |
| 3.3.7 PICRUSt菌群功能预测 | 第43-45页 |
| 4 讨论 | 第45-50页 |
| 4.1 基于传统培养方法的菌群多样性研究 | 第45-46页 |
| 4.1.1 培养基及培养条件的选择 | 第45页 |
| 4.1.2 基于培养方法的婴儿肠道菌群多样性 | 第45-46页 |
| 4.1.3 不同环境因素对肠道菌群的影响 | 第46页 |
| 4.2 基于单分子实时测序的菌群多样性研究 | 第46-50页 |
| 4.2.1 菌群结构与分类学分析 | 第46-47页 |
| 4.2.2 肠道菌群多样性分析 | 第47-48页 |
| 4.2.3 PICRUSt功能预测 | 第48-50页 |
| 5 结论 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-62页 |
| 附录 | 第62-67页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第67页 |