摘要 | 第3-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
CHAPTER1 CHARACTERIZATION OF SANTALENE SYNTHASES USING IPP1 COUPLED COLORIMETRIC ASSAY | 第11-68页 |
1.1 INTRODUCTION | 第11-20页 |
1.1.1 Terpenoids | 第11-12页 |
1.1.2 Terpene synthases | 第12-13页 |
1.1.3 Santalene synthase | 第13-15页 |
1.1.4 Traditional methods for terpene synthases activity assay | 第15-17页 |
1.1.5 Inorganic pyrophosphatase coupled colorimetric assay | 第17-20页 |
1.2 MATERIALS AND METHODS | 第20-56页 |
1.2.1 Materials | 第20-30页 |
1.2.2 Methods | 第30-56页 |
1.3 RESULTS AND DISCUSSION | 第56-68页 |
1.3.1 Sequence alignment and protein structure modeling | 第56-58页 |
1.3.2 Bovine serum albumin(BSA)standard curve | 第58-59页 |
1.3.3 Protein purification | 第59-61页 |
1.3.4 Qualitative assessment of products formed by santalene synthases | 第61-62页 |
1.3.5 The use of IPP1 to establish a pyrophosphate standard curve | 第62-63页 |
1.3.6 Time and dose dependent enzyme activities | 第63页 |
1.3.7 Kinetic parameter measurement | 第63-64页 |
1.3.8 Authentic standard preparation and quantitation | 第64-65页 |
1.3.9 Correlation of IPP1 coupled assay with GC-MS assay for santalene synthases | 第65-68页 |
CHAPTER2 IN VITRO RECONSTITUTION AND ANALYSIS OF CLOSTRIDIAL TAURINE DEGRADATION PATHWAY | 第68-84页 |
2.1 INTRODUCTION | 第68-71页 |
2.1.1 Human gut microbiota | 第68页 |
2.1.2 Taurine | 第68-69页 |
2.1.3 Investigation of enzymes involved in taurine degradation | 第69-70页 |
2.1.4 The discovery of a new Clostridial taurine metabolism pathway | 第70-71页 |
2.2 MATERIALS AND METHODS | 第71-79页 |
2.2.1 Materials | 第71-73页 |
2.2.2 Methods | 第73-79页 |
2.3 RESULTS AND DISCUSSION | 第79-84页 |
2.3.1 Bacillus subtilis alanine dehydrogenase(Bs AlaDH) | 第79页 |
2.3.2 Clostridium butyricum taurine-pyruvate transaminase(Cb TPA) | 第79-81页 |
2.3.3 Clostridium butyricum sulfoacetaldehyde dehydrogenase(Cb TauF) | 第81-84页 |
SUMMARY AND CONCLUSION | 第84-85页 |
REFERENCES | 第85-95页 |
APPENDICES | 第95-99页 |
NOTES ON PUBLICATIONS AND PARTICIPATION IN SCIENTIFIC RESEARCH | 第99-101页 |
ACKNOWLEDGEMENTS | 第101页 |