| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第14-25页 |
| 1.1 牡蛎产业现状及品质评价 | 第14-16页 |
| 1.1.1 牡蛎产业现状 | 第14页 |
| 1.1.2 牡蛎品质及营养价值 | 第14-16页 |
| 1.2 牡蛎品质性状研究现状 | 第16-18页 |
| 1.2.1 牡蛎生长性状研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.2 牡蛎营养品质性状研究现状 | 第17-18页 |
| 1.2.3 牡蛎品质性状遗传改良方向 | 第18页 |
| 1.3 品质性状遗传解析策略与进展 | 第18-23页 |
| 1.3.1 关联与连锁分析原理及比较 | 第18-19页 |
| 1.3.2 全基因组关联分析及其影响因素 | 第19-20页 |
| 1.3.3 品质性状连锁分析及QTL定位研究进展 | 第20-22页 |
| 1.3.4 品质性状全基因组关联分析研究进展 | 第22-23页 |
| 1.4 研究目标及意义 | 第23-25页 |
| 第二章 长牡蛎生长与营养品质性状的全基因组关联分析 | 第25-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-35页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第25-28页 |
| 2.1.2 表型鉴定-后裔测定法 | 第28-31页 |
| 2.1.3 DNA提取 | 第31页 |
| 2.1.4 测序文库制备 | 第31-33页 |
| 2.1.5 测序与SNPs过滤与分析 | 第33-34页 |
| 2.1.6 全基因组关联分析 | 第34-35页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第35-49页 |
| 2.2.1 表型分析 | 第35-43页 |
| 2.2.2 测序文库质量检测 | 第43页 |
| 2.2.3 基因型分析 | 第43页 |
| 2.2.4 全基因组关联分析 | 第43-49页 |
| 2.3 结论 | 第49-51页 |
| 第三章 长牡蛎遗传图谱构建与品质性状QTL定位 | 第51-89页 |
| 3.1 材料与方法 | 第51-58页 |
| 3.1.1 家系构建 | 第51页 |
| 3.1.2 表型鉴定及分析 | 第51页 |
| 3.1.3 GBS文库构建与测序策略 | 第51-54页 |
| 3.1.4 测序及基因分型 | 第54-55页 |
| 3.1.5 连锁图谱构建 | 第55-56页 |
| 3.1.6 重组率计算和热图绘制 | 第56页 |
| 3.1.7 基因组覆盖度与共线性分析 | 第56-57页 |
| 3.1.8 QTL定位与候选基因选取方法 | 第57页 |
| 3.1.9 候选基因定量验证 | 第57-58页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第58-86页 |
| 3.2.1 表型分析 | 第58-66页 |
| 3.2.2 测序文库质量检测 | 第66页 |
| 3.2.3 测序及基因分型 | 第66-68页 |
| 3.2.4 遗传图谱构建与重组率、热图分析 | 第68-73页 |
| 3.2.5 基因组共线性分析 | 第73-75页 |
| 3.2.6 生长与营养品质性状QTL定位及基因解读 | 第75-85页 |
| 3.2.7 候选基因定量验证 | 第85-86页 |
| 3.3 结论 | 第86-89页 |
| 第四章 长牡蛎CgCaspase8-2 基因功能研究 | 第89-110页 |
| 4.1 绪论 | 第89-93页 |
| 4.1.1 细胞凋亡与凋亡酶 | 第89-90页 |
| 4.1.2 Caspase-8 与外源性细胞凋亡信号通路 | 第90-91页 |
| 4.1.3 Caspase-8 免疫功能研究进展 | 第91-92页 |
| 4.1.4 研究目标及意义 | 第92-93页 |
| 4.2 材料与方法 | 第93-99页 |
| 4.2.1 实验材料、取样及细胞培养 | 第93-94页 |
| 4.2.2 RNA提取与反转录 | 第94-95页 |
| 4.2.3 cDNA全长克隆及测序 | 第95-96页 |
| 4.2.4 序列分析方法 | 第96-97页 |
| 4.2.5 mRNA定量检测 | 第97页 |
| 4.2.6 质粒构建与转染 | 第97-98页 |
| 4.2.7 CgCaspase8-2 诱导细胞死亡率检测 | 第98页 |
| 4.2.8 亚细胞定位 | 第98页 |
| 4.2.9 免疫共沉淀及免疫印迹检测 | 第98-99页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第99-109页 |
| 4.3.1 CgCaspase8-2 全长克隆 | 第99-102页 |
| 4.3.2 CgCaspase8-2 多序列比对与进化分析 | 第102-103页 |
| 4.3.3 CgCaspase8-2 诱导细胞死亡与蛋白表达位置分析 | 第103-105页 |
| 4.3.4 CgCaspase8-2 与FADD相互作用 | 第105-106页 |
| 4.3.5 CgCaspase8-2 在不同组织、发育期的表达分析 | 第106-107页 |
| 4.3.6 CgCaspase8-2 在溶藻弧菌与Poly (I:C)刺激后的表达分析 | 第107-109页 |
| 4.4 结论 | 第109-110页 |
| 第五章 全文总结 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-128页 |
| 致谢 | 第128-130页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第130页 |
