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绵羊皮下脂肪小RNA组及miR-124-3p调控前体脂肪细胞分化的研究

摘要第10-12页
第一章 文献综述第12-33页
    1 脂肪组织发育过程第12-13页
        1.1 前体脂肪细胞的来源第12页
        1.2 脂肪细胞的分化过程第12-13页
    2 脂肪分化的关键调节因子第13-24页
        2.1 脂肪细胞分化的关键转录调节因子第13-17页
            2.1.1 C/EBPs家族第14-15页
            2.1.2 PPARγ第15-16页
            2.1.3 KLFs家族第16-17页
            2.1.4 SREBP1第17页
        2.2 脂肪细胞分化的核外调节因子第17-19页
            2.2.1 促进分化的关键核外调节因子第17-18页
            2.2.2 抑制分化的关键核外调节因子第18-19页
        2.3 miRNA对脂肪形成的影响第19-24页
            2.3.1 miRNA的生物合成第19-20页
            2.3.2 促进脂肪形成的miRNA第20-22页
            2.3.3 抑制脂肪形成的miRNA第22-24页
    参考文献第24-33页
第二章 不同品种(系)绵羊皮下脂肪组织miRNA表达谱研究第33-57页
    1 材料与方法第33-40页
        1.1 试验材料第33-34页
        1.2 试验试剂第34页
        1.3 主要仪器第34-35页
        1.4 高通量测序文库的构建第35-37页
            1.4.1 皮下脂肪组织RNA提取及纯度检测第35页
            1.4.2 小分子RNA分离第35-36页
            1.4.3 测序文库构建第36-37页
        1.5 测序数据分析第37-38页
            1.5.1 原始数据分析及小RNA长度统计第37页
            1.5.2 Clean reads组成分析第37-38页
            1.5.3 miRNA表达谱分析第38页
            1.5.4 miRNA靶基因预测及功能分析第38页
        1.6 测序数据stem-loop qPCR检验第38-40页
            1.6.1 引物设计第38-39页
            1.6.2 Stem-loop qPCR第39-40页
            1.6.3 数据分析第40页
    2 结果第40-51页
        2.1 总RNA浓度及完整性分析结果第40-41页
        2.2 测序数据描述统计第41-42页
        2.3 小RNA分类注释结果第42-43页
        2.4 已知miRNA的识别和差异表达分析第43-45页
        2.5 未知miRNA识别和差异表达分析第45-50页
        2.6 靶基因预测及功能分析第50页
        2.7 测序结果验证第50-51页
    3 讨论第51-55页
    参考文献第55-57页
第三章 miR-124-3p对绵羊脂肪源前体脂肪细胞分化能力的影响第57-82页
    1 材料与方法第58-70页
        1.1 样品采集第58页
        1.2 主要试剂的配置第58-59页
            1.2.1 细胞分离及培养试剂第58-59页
            1.2.2 Western blotting相关试剂第59页
        1.3 脂肪源前体脂肪细胞的分离第59页
        1.4 细胞成脂诱导分化第59-60页
        1.5 miR-124-3p靶基因预测第60页
        1.6 C/EBPα 3'-UTR双荧光报告载体构建第60-65页
            1.6.1 PCR扩增C/EBPα基因mRNA 3'-UTR第60-62页
            1.6.2 C/EBPα基因mRNA 3'-UTR克隆第62-64页
            1.6.3 C/EBPα mRNA 3'-UTR连接到荧光报告载体第64-65页
        1.7 miR124-3p和双荧光报告载体共转染293T细胞第65-66页
        1.8 miR-124-3p在前体脂肪细胞中的过表达和抑制表达第66页
        1.9 实时荧光定量PCR第66-68页
            1.9.1 miRNA Stem-loop qPCR检测第66页
            1.9.2 基因mRNA实时荧光定量PCR检测第66-68页
        1.10 Western blotting检测第68-70页
            1.10.1 细胞蛋白提取第68页
            1.10.2 蛋白浓度测定第68页
            1.10.3 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳第68-69页
            1.10.4 蛋白转膜第69页
            1.10.5 抗体孵育第69-70页
        1.11 数据分析第70页
    2 结果第70-75页
        2.1 绵羊脂肪源和肌肉源前体脂肪细胞培养及成脂能力鉴定第70-71页
            2.1.1 前体脂肪细胞分离结果第70页
            2.1.2 分化能力的鉴定第70-71页
        2.2 miR-124-3p靶基因预测结果第71页
        2.3 双荧光报告结果第71-72页
        2.4 miR-124-3p对脂肪源前体脂肪细胞分化的影响第72-75页
            2.4.1 miR-124-3p可抑制脂肪源前体脂肪细胞C/EBPα的表达第72-74页
            2.4.2 miR-124-3p抑制前体脂肪细胞脂肪生成标志基因的表达第74页
            2.4.3 miR-124-3p可抑制脂肪细胞脂滴的生成第74-75页
    3 讨论第75-79页
    参考文献第79-82页
第四章 miR-124-3p对绵羊肌肉源前体脂肪细胞分化的影响第82-107页
    1 材料与方法第83-90页
        1.1 样品采集第83页
        1.2 主要试剂的配制第83页
        1.3 肌肉源前体脂肪细胞的分离第83页
        1.4 miR-124-3p靶基因预测第83页
        1.5 BCKDHA 3'-UTR双荧光报告载体的构建第83-84页
            1.5.1 引物设计第83-84页
            1.5.2 BCKDHA基因mRNA 3,-UTR的PCR扩增第84页
            1.5.3 BCKDHA基因mRNA 3'-UTR的克隆及连接到荧光报告载体第84页
        1.6 BCKDHA表达载体的构建第84-86页
            1.6.1 引物设计第84-85页
            1.6.2 CDS的PCR扩增第85页
            1.6.3 载体的线性化第85页
            1.6.4 重组质粒的构建及克隆第85-86页
        1.7 BCKDHA基因慢病毒干扰载体的构建第86-87页
            1.7.1 shRNA序列的合成第86页
            1.7.2 干扰载体的重组第86-87页
        1.8 慢病毒包装第87-88页
        1.9 前体脂肪细胞感染慢病毒第88页
            1.9.1 最适Polybrene浓度的确定第88页
            1.9.2 慢病毒滴度测定第88页
            1.9.3 慢病毒感染绵羊前体脂肪细胞第88页
        1.10 实时荧光定量PCR第88-89页
        1.11 Western blotting检测第89页
        1.12 支链氨基酸的检测第89-90页
        1.13 数据分析第90页
    2 结果第90-100页
        2.1 绵羊肌肉源前体脂肪细胞的培养及成脂能力鉴定第90-92页
            2.1.1 前体脂肪细胞分离结果第90页
            2.1.2 细胞分化能力的鉴定第90-92页
        2.2 miR-124-3p靶基因预测结果第92页
        2.3 双荧光报告检测结果第92-93页
        2.4 miR-124-3p对肌肉源前体脂肪细胞分化的影响第93-97页
            2.4.1 miR-124-3p和BCKDHA在脂肪细胞分化过程中的表达第93页
            2.4.2 miR-124-3p对于前体脂肪细胞脂滴形成的影响第93-95页
            2.4.3 miR-124-3p对细胞分化过程中BCKDHA的影响第95-96页
            2.4.4 miR-124-3p对支链氨基酸代谢的影响第96-97页
        2.5 BCKDHA可促进肌肉源前体脂肪细胞的分化第97-100页
            2.5.1 BCKDHA慢病毒表达系统构建结果第97-99页
            2.5.2 BCKDHA对前体脂肪细胞分化能力的影响第99-100页
    3 讨论第100-104页
    参考文献第104-107页
全文结论第107-108页
创新与特色第108-110页
附录一 源于多个测序文库的已知miRNA的聚类分析第110-111页
附录二 源于多个测序文库的未知miRNA的聚类分析第111-112页
附录三 小尾寒羊文库中miRNA的基因组分布第112-113页
附录四 山西肉用绵羊母本品系中miRNA的基因组分布第113-114页
附录五 在读期间发表论文第114-116页
Abstract第116-117页
致谢第118页

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