六种储粮甲虫线粒体基因组测定及分析
摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 前言 | 第10-18页 |
1.1 线粒体基因组概述 | 第10-13页 |
1.1.1 线粒体基因组的结构特征 | 第10-11页 |
1.1.2 线粒体基因组各组分特征 | 第11-13页 |
1.2 鞘翅目与研究物种介绍 | 第13-17页 |
1.2.1 鞘翅目简介 | 第13-14页 |
1.2.2 鞘翅目昆虫线粒体基因组研究现状 | 第14-15页 |
1.2.3 研究物种介绍 | 第15-17页 |
1.3 论文的研究目的及意义 | 第17-18页 |
第2章 研究材料与方法 | 第18-22页 |
2.1 研究材料 | 第18-19页 |
2.1.1 动物材料 | 第18页 |
2.1.2 主要仪器与试剂 | 第18-19页 |
2.2 研究方法 | 第19-22页 |
2.2.1 DNA的提取与检测 | 第19-20页 |
2.2.2 引物设计与PCR扩增 | 第20页 |
2.2.3 序列拼接与注释 | 第20-21页 |
2.2.4 系统发育分析 | 第21-22页 |
第3章 六种多食亚目甲虫线粒体基因组 | 第22-66页 |
3.1 杂拟谷盗线粒体基因组 | 第22-29页 |
3.1.1 基因组结构 | 第22-24页 |
3.1.2 碱基组成 | 第24-25页 |
3.1.3 基因的间隔区与重叠区 | 第25页 |
3.1.4 蛋白质编码基因 | 第25-26页 |
3.1.5 tRNA基因与rRNA基因 | 第26-29页 |
3.1.6 A+T丰富区 | 第29页 |
3.2 美洲黑拟谷盗线粒体基因组 | 第29-36页 |
3.2.1 基因组结构 | 第29页 |
3.2.2 碱基组成 | 第29-30页 |
3.2.3 基因的间隔区与重叠区 | 第30-32页 |
3.2.4 蛋白质编码基因 | 第32-33页 |
3.2.5 tRNA基因与rRNA基因 | 第33-36页 |
3.2.6 A+T丰富区 | 第36页 |
3.3 米象线粒体基因组 | 第36-43页 |
3.3.1 基因组结构 | 第36页 |
3.3.2 碱基组成 | 第36-37页 |
3.3.3 基因的间隔区与重叠区 | 第37-39页 |
3.3.4 蛋白质编码基因 | 第39-40页 |
3.3.5 tRNA基因与rRNA基因 | 第40-43页 |
3.4 锯谷盗线粒体基因组 | 第43-50页 |
3.4.1 基因组结构 | 第43-45页 |
3.4.2 碱基组成 | 第45-46页 |
3.4.3 基因的间隔区与重叠区 | 第46页 |
3.4.4 蛋白质编码基因 | 第46-47页 |
3.4.5 tRNA基因与rRNA基因 | 第47-50页 |
3.5 绿豆象线粒体基因组 | 第50-57页 |
3.5.1 基因组结构 | 第50-52页 |
3.5.2 碱基组成 | 第52-53页 |
3.5.3 基因的间隔区与重叠区 | 第53页 |
3.5.4 蛋白质编码基因 | 第53页 |
3.5.5 tRNA基因与rRNA基因 | 第53-54页 |
3.5.6 A+T丰富区 | 第54-57页 |
3.6 烟草甲线粒体基因组 | 第57-64页 |
3.6.1 基因组结构 | 第57-59页 |
3.6.2 碱基组成 | 第59-60页 |
3.6.3 基因的间隔区与重叠区 | 第60页 |
3.6.4 蛋白质编码基因 | 第60-61页 |
3.6.5 tRNA基因与rRNA基因 | 第61-64页 |
3.7 六种多食亚目甲虫线粒体基因组比较 | 第64-66页 |
3.7.1 基因组结构与碱基组成 | 第64页 |
3.7.2 蛋白质编码基因 | 第64页 |
3.7.3 基因间隔与基因重叠 | 第64-65页 |
3.7.4 tRNA基因 | 第65-66页 |
第4章 多食亚目甲虫蛋白质编码基因比较研究 | 第66-76页 |
4.1 蛋白质编码基因的碱基组成 | 第66-68页 |
4.2 蛋白质编码基因的氨基酸使用频率 | 第68-71页 |
4.3 蛋白质编码基因的密码子使用情况 | 第71-72页 |
4.4 蛋白质编码基因的起始密码子 | 第72-76页 |
第5章 多食亚目甲虫系统发育分析 | 第76-84页 |
5.1 材料与方法 | 第76-79页 |
5.1.1 外类群的选择 | 第76-77页 |
5.1.2 序列来源 | 第77-78页 |
5.1.3 序列的比对与修饰 | 第78-79页 |
5.2 建树结果分析 | 第79-84页 |
5.2.1 似然法构建的多食亚目系统发育树 | 第79-81页 |
5.2.2 贝叶斯法构建的多食亚目系统发育树 | 第81页 |
5.2.3 系统发育结果分析及讨论 | 第81-84页 |
第6章 总结 | 第84-88页 |
参考文献 | 第88-102页 |
致谢 | 第102-104页 |
攻读硕士期间的研究成果 | 第104页 |