基于多样性函数的单体域划分和tag SNP选择算法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| 1.1 课题的研究背景及意义 | 第11-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-14页 |
| 1.3 研究内容 | 第14页 |
| 1.4 论文结构 | 第14-16页 |
| 第2章 相关理论和技术 | 第16-24页 |
| 2.1 国际人类基因组单体型图计划 | 第16-17页 |
| 2.2 单核苷酸多态性 | 第17-18页 |
| 2.3 单体型和基因型 | 第18-20页 |
| 2.4 连锁不平衡的概念 | 第20-21页 |
| 2.5 单体域的定义和构建 | 第21-23页 |
| 2.5.1 基于单体型多样性的方法 | 第21-22页 |
| 2.5.2 基于重组的方法 | 第22-23页 |
| 2.5.3 基于连锁不平衡的方法 | 第23页 |
| 2.5.4 基于信息复杂度的方法 | 第23页 |
| 2.6 小结 | 第23-24页 |
| 第3章 单体域的划分和tagSNP选择算法 | 第24-43页 |
| 3.1 单体型矩阵及相关知识 | 第24-25页 |
| 3.2 多样性函数 | 第25-28页 |
| 3.3 方法介绍 | 第28-37页 |
| 3.3.1 tagSNP选择算法 | 第29-30页 |
| 3.3.2 单体域划分线性空间算法 | 第30-34页 |
| 3.3.3 限制tagSNP数目的单体域划分算法 | 第34-37页 |
| 3.4 实验结果 | 第37-42页 |
| 3.5 小结 | 第42-43页 |
| 第4章 基于分块的非参考单体型补缺 | 第43-51页 |
| 4.1 数据编码 | 第43-44页 |
| 4.2 问题描述 | 第44-45页 |
| 4.3 相关方法简介 | 第45页 |
| 4.4 研究思路 | 第45-46页 |
| 4.5 基于分块的非参考单体型补缺 | 第46-49页 |
| 4.5.1 非参考单体型下的基因型补缺 | 第46-47页 |
| 4.5.2 非参考单体型下的单体型补缺 | 第47-49页 |
| 4.6 实验结果 | 第49-50页 |
| 4.7 小结 | 第50-51页 |
| 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 附录 攻读学位期间所发表的学术论文和参加的项目 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
