| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文章综述 | 第9-14页 |
| 1.1 菲律宾蛤仔简介 | 第9页 |
| 1.2 贝类寄生虫 | 第9-11页 |
| 1.3 贝类寄生虫鉴定 | 第11-12页 |
| 1.4 双壳贝类高通量转录组研究概况 | 第12-13页 |
| 1.5 论文研究目的与意义 | 第13-14页 |
| 第二章 感染复殖吸虫蛤仔解剖观察及复殖吸虫分子鉴定 | 第14-23页 |
| 2.1 材料来源 | 第15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-17页 |
| 2.2.1 蛤仔性腺观察 | 第15页 |
| 2.2.2 复殖吸虫解剖观察 | 第15-16页 |
| 2.2.3 复殖吸虫分子鉴定 | 第16-17页 |
| 2.2.3.1 DNA的提取 | 第16-17页 |
| 2.2.3.2 引物设计 | 第17页 |
| 2.2.3.3 18S rRNA基因片段PCR扩增及纯化 | 第17页 |
| 2.2.3.4 测序 | 第17页 |
| 2.3 结果 | 第17-22页 |
| 2.3.1 感染部位的观察 | 第17-18页 |
| 2.3.2 复殖吸虫胞幼与尾蚴形态观察 | 第18-19页 |
| 2.3.3 感染部位切片观察 | 第19-20页 |
| 2.3.4 复殖吸虫分子鉴定结果 | 第20-22页 |
| 2.3.4.1 复殖吸虫 18S r RNA序列凝胶电泳结果 | 第20-21页 |
| 2.3.4.2 测序比对结果 | 第21-22页 |
| 2.4 讨论 | 第22-23页 |
| 第三章 感染复殖吸虫蛤仔转录组分析 | 第23-47页 |
| 3.1 转录组测序分析 | 第23-35页 |
| 3.1.1 亲贝来源 | 第23页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第23-25页 |
| 3.1.2.1 RNA的提取 | 第23-24页 |
| 3.1.2.2 cDNA文库的构建 | 第24页 |
| 3.1.2.3 测序数据质量评估和过滤 | 第24-25页 |
| 3.1.2.4 参考序列比对分析 | 第25页 |
| 3.1.2.5 基因表达水平分析与RNA-seq整体质量评估 | 第25页 |
| 3.1.2.6 差异表达分析与筛选 | 第25页 |
| 3.1.2.7 差异基因GO功能聚类以及KEGG通路富集分析 | 第25页 |
| 3.1.3 结果 | 第25-34页 |
| 3.1.3.1 RNA提取结果 | 第25-26页 |
| 3.1.3.2 测序数据质量评估和过滤结果 | 第26-28页 |
| 3.1.3.3 参考序列比对分析结果 | 第28-29页 |
| 3.1.3.4 基因表达水平分析与RNA-seq整体质量评估结果 | 第29-30页 |
| 3.1.3.5 差异表达筛选与聚类分析结果 | 第30-31页 |
| 3.1.3.6 GO注释结果分析 | 第31-33页 |
| 3.1.3.7 KEGG通路注释结果 | 第33-34页 |
| 3.1.4 讨论 | 第34-35页 |
| 3.2 候选基因的验证以及表达分析 | 第35-47页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第35页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第35-39页 |
| 3.2.3 结果 | 第39-43页 |
| 3.2.4 讨论 | 第43-47页 |
| 结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-57页 |
| 攻读学位期间发表的论文目录 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
