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水稻穗颈维管束性状的全基因组关联分析

摘要第8-9页
Abstract第9页
英文缩略词表第10-11页
1 前言第11-19页
    1.1 水稻维管束的研究进展第11-13页
        1.1.1 维管束的结构及功能第11-12页
        1.1.2 水稻维管束的生理研究第12-13页
        1.1.3 水稻维管束的调控机制研究第13页
    1.2 全基因组关联分析研究进展第13-18页
        1.2.1 全基因组关联分析概述第13-15页
        1.2.2 GWAS中处理群体结构的方法第15-16页
        1.2.3 GWAS的优势第16页
        1.2.4 GWAS的局限性第16-17页
        1.2.5 GWAS在水稻中的研究进展第17-18页
    1.3 试验目的及意义第18-19页
2 材料与方法第19-24页
    2.1 试验材料第19页
    2.2 试验设计第19页
    2.3 表型鉴定第19页
    2.4 表型数据分析第19-20页
    2.5 基因型数据分析第20页
    2.6 GWAS定位QTL第20页
    2.7 候选基因分析第20-21页
    2.8 NAL1基因相关第21-24页
        2.8.1 NAL1基因近等基因系的构建第21页
        2.8.2 NAL1基因的表达分析第21-22页
        2.8.3 NAL1基因序列分析第22页
        2.8.4 表型鉴定第22-24页
3 结果与分析第24-42页
    3.1 维管束相关性状的表现第24-26页
        3.1.1 穗颈维管束相关性状表现第24-25页
        3.1.2 相关分析第25-26页
    3.2 基因型与群体结构分析第26-28页
        3.2.1 基因型第26-27页
        3.2.2 群体结构分析第27-28页
    3.3 GWAS定位QTL第28-33页
    3.4 候选基因分析第33-39页
    3.5 NAL1是qLVA4.1和qLVPA4.1的候选基因第39-42页
        3.5.1 近等基因系的表型鉴定第39-40页
        3.5.2 NAL1基因序列分析第40-41页
        3.5.3 NAL1基因表达分析第41-42页
4 讨论与结论第42-46页
    4.1 籼稻和粳稻亚种间维管束性状的差异第42页
    4.2 候选基因分析第42-45页
    4.3 对分子标记辅助选择改良水稻维管束性状的育种启示第45-46页
参考文献第46-52页
附表 供试材料信息第52-62页
附录 R语言进行数据分析及作图代码第62-65页
致谢第65-66页
攻读硕士学位期间发表文章第66-67页

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