| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 符号说明 | 第14-15页 |
| 1 文献综述 | 第15-25页 |
| 1.1 BVDV研究背景 | 第15-19页 |
| 1.1.1 BVDV生物学特性 | 第15-16页 |
| 1.1.2 BVDV的持续性感染 | 第16-17页 |
| 1.1.3 BVDV国内外流行情况 | 第17-18页 |
| 1.1.4 诊断技术 | 第18-19页 |
| 1.1.5 BVDV的防治 | 第19页 |
| 1.2 转录组学 | 第19-23页 |
| 1.2.1 研究方法 | 第20页 |
| 1.2.2 RNA-seq优势 | 第20-21页 |
| 1.2.3 转录组学发展前景 | 第21-22页 |
| 1.2.4 转录组学新兴技术 | 第22-23页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第23-25页 |
| 2 BVDV的中国区域流行性调查及Meta分析 | 第25-35页 |
| 2.1 研究对象 | 第25页 |
| 2.2 研究方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 检索文库范围 | 第25页 |
| 2.2.2 检索策略 | 第25-26页 |
| 2.2.3 选择标准 | 第26页 |
| 2.2.4 文献获取 | 第26页 |
| 2.2.5 数据提取 | 第26页 |
| 2.2.6 数据分析 | 第26-27页 |
| 2.2.7 森林图 | 第27页 |
| 2.2.8 偏倚分析 | 第27页 |
| 2.3 结果 | 第27-32页 |
| 2.3.1 搜索结果 | 第27-28页 |
| 2.3.2 文献Meta分析 | 第28页 |
| 2.3.3 我国各省份感染情况 | 第28-31页 |
| 2.3.4 发表偏倚性分析 | 第31页 |
| 2.3.5 Meta分析森林图 | 第31-32页 |
| 2.4 讨论 | 第32-35页 |
| 3 BVDV感染MDBK细胞后基因表达谱变化分析 | 第35-57页 |
| 3.1 实验材料 | 第35-36页 |
| 3.1.1 材料 | 第35页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第35-36页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第36页 |
| 3.2 实验方法 | 第36-38页 |
| 3.2.1 MDBK细胞的培养 | 第36页 |
| 3.2.2 BVDV毒力的测定 | 第36页 |
| 3.2.3 总RNA的提取 | 第36-37页 |
| 3.2.4 文库构建、数据质控和功能注释 | 第37页 |
| 3.2.5 RNA测序数据的处理 | 第37-38页 |
| 3.2.6 基因表达分析 | 第38页 |
| 3.2.7 差异mRNA的GO和KEGG富集分析 | 第38页 |
| 3.3 结果 | 第38-54页 |
| 3.3.1 BVDV感染细胞的检测 | 第38-39页 |
| 3.3.2 转录组数据整理 | 第39-40页 |
| 3.3.3 差异基因的比较 | 第40-42页 |
| 3.3.4 基因表达分析 | 第42-43页 |
| 3.3.5 KEGG和GO富集分析 | 第43-53页 |
| 3.3.6 新转录位点分析 | 第53-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-57页 |
| 4 差异表达基因的验证 | 第57-67页 |
| 4.1 材料 | 第57-58页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第57页 |
| 4.1.2 试剂耗材 | 第57页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第57-58页 |
| 4.2 方法 | 第58-61页 |
| 4.2.1 引物设计与合成 | 第58页 |
| 4.2.2 cDNA的合成 | 第58-59页 |
| 4.2.3 Real-timePCR反应 | 第59页 |
| 4.2.4 细胞培养 | 第59-60页 |
| 4.2.5 细胞接毒 | 第60页 |
| 4.2.6 细胞总蛋白提取 | 第60页 |
| 4.2.7 PI3K、AKT、FOXO基因Westernblot验证 | 第60-61页 |
| 4.3 结果 | 第61-65页 |
| 4.3.1 RNA质量检测 | 第61-62页 |
| 4.3.2 差异基因数据分析 | 第62-64页 |
| 4.3.3 PI3K、AKT、FOXO蛋白表达量及mRNA变化 | 第64-65页 |
| 4.4 讨论 | 第65-67页 |
| 5 结论 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 附录 | 第79-81页 |
| 个人简历 | 第81页 |