| 缩略词表 | 第5-11页 |
| 中文摘要 | 第11-13页 |
| ABSTRACT | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-39页 |
| 前言 | 第15页 |
| 1.1 水稻白叶枯病和细菌性条斑病的发生和分布 | 第15-17页 |
| 1.2 水稻白叶枯病和条斑病的症状 | 第17-18页 |
| 1.3 水稻白叶枯病和条斑病病原菌的检验检疫研究 | 第18-26页 |
| 1.3.1 水稻白叶枯病菌和条斑病菌的命名 | 第18-19页 |
| 1.3.2 水稻白叶枯病菌和条斑病菌的形态学特征和理化性质 | 第19页 |
| 1.3.3 水稻白叶枯病菌和条斑病菌的检疫方法研究 | 第19-26页 |
| 1.4 水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的致病机制的探究 | 第26-37页 |
| 1.4.1 水稻白叶枯病菌和条斑病菌的侵染模式 | 第27-28页 |
| 1.4.2 水稻白叶枯病菌和水稻细菌性条斑病菌激发植物的抗病性和感病性 | 第28-29页 |
| 1.4.3 水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的致病性效应因子 | 第29-37页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第37-39页 |
| 第二章 水稻白叶枯病菌和条斑病菌的分子标记筛选及检测 | 第39-57页 |
| 1 材料与方法 | 第39-42页 |
| 1.1 供试菌株 | 第39-40页 |
| 1.2 水稻种子 | 第40页 |
| 1.3 仪器与试剂 | 第40页 |
| 1.4 病菌序列的获得及模式种的选取 | 第40页 |
| 1.5 显性与共显性分子标记引物的设计 | 第40-41页 |
| 1.6 PCR模板的制备 | 第41页 |
| 1.7 PCR检测体系的建立 | 第41页 |
| 1.8 携菌水稻种子样品的检测 | 第41-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-53页 |
| 2.1 对水稻白叶枯病菌专化的显性分子标记筛选及验证 | 第42-45页 |
| 2.2 对水稻细菌性条斑病菌专化的显性分子标记筛选及验证 | 第45-49页 |
| 2.3 对水稻白叶枯病菌和条斑病菌的共显性分子标记进行PCR验证 | 第49-52页 |
| 2.4 对稻种样品的检测 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| 3.1 获得了可以有效区分XOO和XOC的分子标记 | 第54页 |
| 3.2 分子标记的联合应用 | 第54-55页 |
| 3.3 分子标记可应用于种间差异分析 | 第55页 |
| 3.4 分子标记可应用于进化上的差异分析 | 第55页 |
| 4 结论 | 第55-57页 |
| 第三章 水稻细菌性条斑病菌的致病因子AvrRxo1的相关研究 | 第57-85页 |
| 1 材料与方法 | 第57-65页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第57-58页 |
| 1.2 植物材料 | 第58页 |
| 1.3 引物设计与合成 | 第58页 |
| 1.4 仪器与试剂 | 第58-59页 |
| 1.5 五菌株来源的avrRxo1瞬时表达载体的构建 | 第59页 |
| 1.6 avrRxo1_(RS105)氨基端与羧基端截短后基因的瞬时表达载体的构建 | 第59页 |
| 1.7 avrRxo1_(RS105)点突变的瞬时表达载体的构建 | 第59-60页 |
| 1.8 农杆菌介导的烟草瞬时表达体系 | 第60页 |
| 1.9 VIGS | 第60页 |
| 1.10 水稻细菌性条斑病菌RS105基因组DNA的提取 | 第60-61页 |
| 1.11 水稻细菌性条斑病菌RS105电转化感受态细胞的制备 | 第61页 |
| 1.12 突变菌株的T载体构建 | 第61-63页 |
| 1.12.1 pEASY~(TM)-T1：：avrRxo1-1载体构建 | 第61页 |
| 1.12.2 pEASY~(TM)-T1：：avrRxo1-2载体构建 | 第61页 |
| 1.12.3 pEASY~(TM)-T1：：avrRxo1-3载体构建 | 第61页 |
| 1.12.4 突变体菌株的构建 | 第61-62页 |
| 1.12.5 功能互补菌株的构建 | 第62-63页 |
| 1.13 对于水稻细菌性条斑病菌进行生理生化性质的检测 | 第63-64页 |
| 1.13.1 生长曲线的测定 | 第63页 |
| 1.13.2 游动性和趋化应答试验 | 第63页 |
| 1.13.4 胞外纤维素酶的测定 | 第63页 |
| 1.13.5 生物膜的检测 | 第63-64页 |
| 1.13.6 在非寄主玉米B73上的过敏性反应的检测 | 第64页 |
| 1.13.7 在寄主水稻上的致病性测定 | 第64页 |
| 1.13.8 水稻细菌性条斑病菌在水稻上的生长曲线检测 | 第64页 |
| 1.14 细菌RNA的抽提与RT-PCR | 第64-65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-81页 |
| 2.0 不同来源的avrRxo1等位基因的核苷酸序列存在差异 | 第65页 |
| 2.1 相关载体构建 | 第65-68页 |
| 2.1.1 不同来源的五个条斑病菌菌株的avrRxo1瞬时表达载体的构建 | 第65-66页 |
| 2.1.2 avrRxo1_(RS105)氨基端与羧基端截短后基因的瞬时表达载体的构建 | 第66-67页 |
| 2.1.3 avrRxol rsios 相关点突变的瞬时表达载体的构建 | 第67-68页 |
| 2.2 野生型Xoc能激发烟草产生的HR反应依赖于SGT1和HSP90 | 第68-71页 |
| 2.3 来源不同avrRxo1在烟草上的瞬时表达表现为毒性并且存在差异 | 第71-72页 |
| 2.4 avrRxo1基因毒性功能的关键结构域 | 第72-74页 |
| 2.5 avrRxo1基因毒性功能的关键位点 | 第74页 |
| 2.6 R△avrRxo1突变菌株的相关研究 | 第74-77页 |
| 2.6.1 RS105突变菌株T载体的构建 | 第75页 |
| 2.6.2 RS105突变菌株功能互补子载体的构建 | 第75-76页 |
| 2.6.3 突变菌株中avrRxo1基因的表达分析 | 第76页 |
| 2.6.4 R△avrRxo1突变菌株在非寄主玉米上的反应 | 第76-77页 |
| 2.7 R△avrRxo1突变菌株在寄主水稻IR24上的致病力 | 第77-78页 |
| 2.8 R△avrRxo1突变菌株的基本生理生化性质的检测 | 第78-81页 |
| 2.8.1 在MMX培养基中的生长曲线 | 第78-79页 |
| 2.8.2 游动性与趋化性 | 第79-80页 |
| 2.8.3 胞外纤维素酶的活性 | 第80页 |
| 2.8.4 生物膜的测定 | 第80-81页 |
| 3 讨论 | 第81-84页 |
| 3.1 效应因子AvrRxo1有助于分析XOO和XOC的致病力的差异 | 第81-82页 |
| 3.2 效应因子AvrRxo1对烟草细胞具有毒性 | 第82页 |
| 3.3 效应因子AvrRxo1功能的关键位点和结构域的分析 | 第82-83页 |
| 3.4 效应因子AvrRxo1功能的多样性分析 | 第83-84页 |
| 3.5 效应因子AvrRxo1影响XOC的致病力 | 第84页 |
| 4 结论 | 第84-85页 |
| 第四章 水稻白叶枯病菌中与IAA相关的新致病因子的研究 | 第85-108页 |
| 1 材料与方法 | 第85-92页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第85-86页 |
| 1.2 植物材料 | 第86页 |
| 1.3 引物设计与合成 | 第86页 |
| 1.4 基因的结构分析 | 第86-87页 |
| 1.5 XOO菌株PX099A的基因组DNA的提取 | 第87页 |
| 1.6 XOO菌株PX099A电转化感受态细胞的制备 | 第87页 |
| 1.7 载体构建 | 第87-88页 |
| 1.7.1 pEASY~(TM)-T1：：pxo_04004载体构建 | 第87页 |
| 1.7.2 pEASY~(TM)-T1：：pxo_04823载体构建 | 第87-88页 |
| 1.7.3 pEASY~(TM)-T1：：pxo_00867载体构建 | 第88页 |
| 1.7.4 pEASY~(TM)-T1：：pxo_03584载体构建 | 第88页 |
| 1.7.5 突变菌株的构建 | 第88页 |
| 1.8 功能互补菌株的构建 | 第88页 |
| 1.9 XOO菌株发酵液中IAA产量的测定 | 第88-89页 |
| 1.10 XOO菌株及其突变菌株生理生化性质的检测 | 第89页 |
| 1.10.1 生长曲线的测定 | 第89页 |
| 1.10.2 游动性和趋化应答试验 | 第89页 |
| 1.10.3 胞外多糖的检测 | 第89页 |
| 1.10.4 胞外纤维素酶的测定 | 第89页 |
| 1.10.5 生物膜的检测 | 第89页 |
| 1.11 在非寄主烟草上的过敏性坏死反应的测定 | 第89页 |
| 1.12 在寄主水稻上的致病性测定 | 第89-90页 |
| 1.13 用双向电泳的方法检测各菌株的分泌蛋白 | 第90-91页 |
| 1.14 细菌RNA的抽提以及RT-PCR | 第91-92页 |
| 2 结果与分析 | 第92-105页 |
| 2.1 突变菌株以及互补菌株的构建 | 第92-95页 |
| 2.1.1 构建突变菌株的四个片段的TA克隆 | 第92页 |
| 2.1.2 构建互补菌株的四个片段的载体 | 第92-93页 |
| 2.1.3 突变菌株及互补菌株的构建及鉴定 | 第93-95页 |
| 2.2 HPLC法测定各个XOO菌株所代谢的IAA含量 | 第95-98页 |
| 2.3 突变菌株在水稻上的致病性检测 | 第98-99页 |
| 2.4 在非寄主植物烟草上的过敏性坏死反应 | 第99页 |
| 2.5 突变体的生理生化性质的测定 | 第99-103页 |
| 2.5.1 胞外多糖(EPS)的产生 | 第99-101页 |
| 2.5.2 游动性与趋化性 | 第101-102页 |
| 2.5.3 胞外纤维素酶的活性 | 第102页 |
| 2.5.4 生物膜的形成 | 第102-103页 |
| 2.5.5 生长曲线的测定 | 第103页 |
| 2.6 利用双向电泳的方法检测各菌株分泌蛋白的差异 | 第103-105页 |
| 3 讨论 | 第105-106页 |
| 3.1 XOO中存在多种IAA合成途径 | 第105-106页 |
| 3.2 与IAA合成相关的XOO突变菌株的致病力提高 | 第106页 |
| 3.3 IAA负调控致病相关因子EPS及Ⅲ型分泌蛋白的合成 | 第106页 |
| 4 结论 | 第106-108页 |
| 全文总结及主要创新点 | 第108-109页 |
| 参考文献 | 第109-129页 |
| 附录Ⅰ | 第129-133页 |
| 附录Ⅱ | 第133-135页 |
| 附录Ⅲ | 第135-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第140页 |
