摘要 | 第3-6页 |
ABSTRACT | 第6-9页 |
目录 | 第10-13页 |
第一章 绪论 | 第13-30页 |
1.1 盐胁迫对植物产生的危害 | 第13-16页 |
1.1.1 盐胁迫对植物形态发育的影响 | 第13-14页 |
1.1.2 盐胁迫对植物代谢的影响 | 第14-16页 |
1.2 植物的耐盐机制 | 第16-20页 |
1.2.1 植物的耐盐机制 | 第16-18页 |
1.2.2 植物的耐盐指标 | 第18-20页 |
1.3 甜瓜耐盐性研究进展 | 第20-21页 |
1.4 转录组学在植物抗逆性方面的研究进展 | 第21-26页 |
1.4.1 转录组学的研究方法 | 第21-23页 |
1.4.2 Illumina 转录组测序技术 | 第23页 |
1.4.3 有参考基因组的转录组的方法及数据分析 | 第23-25页 |
1.4.4 转录组学在植物抗逆性方面的研究进展 | 第25-26页 |
1.5 甜瓜基因组学研究进展 | 第26-27页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第27页 |
1.7 研究内容和技术路线 | 第27-30页 |
1.7.1 研究内容 | 第27-28页 |
1.7.2 技术路线 | 第28-30页 |
第二章 :两个甜瓜品种的生理生化指标比较分析 | 第30-40页 |
2.1 材料与方法 | 第30-31页 |
2.1.1 实验材料 | 第30页 |
2.1.2 材料处理 | 第30页 |
2.1.3 实验方法 | 第30-31页 |
2.1.4 数据处理 | 第31页 |
2.2 结果 | 第31-38页 |
2.2.1 表型观察 | 第31-32页 |
2.2.2 盐胁迫对甜瓜幼苗叶绿素荧光参数的影响 | 第32-33页 |
2.2.3 盐胁迫对甜瓜幼苗光合参数的影响 | 第33-34页 |
2.2.4 盐胁迫对甜瓜幼苗离子流参数的影响 | 第34-36页 |
2.2.5 植株干鲜重、株高的测定 | 第36-38页 |
2.3 讨论 | 第38-40页 |
2.3.1 盐胁迫对甜瓜幼苗叶绿素荧光参数的影响 | 第38页 |
2.3.2 盐胁迫对甜瓜幼苗光合参数的影响 | 第38-39页 |
2.3.3 盐胁迫对甜瓜幼苗离子流参数的影响 | 第39页 |
2.3.4 盐胁迫对甜瓜生长的影响 | 第39-40页 |
第三章 :两个甜瓜品种转录组测序及分析 | 第40-53页 |
3.1 材料与试剂 | 第40-41页 |
3.1.1 实验材料 | 第40页 |
3.1.2 材料处理 | 第40页 |
3.1.3 实验试剂 | 第40-41页 |
3.2 实验方法 | 第41-47页 |
3.2.1 叶片总 RNA 的提取及质量检测 | 第41-43页 |
3.2.2 测序文库制备 | 第43页 |
3.2.3 Illumina 测序 | 第43页 |
3.2.4 测序数据处理及分析 | 第43-45页 |
3.2.5 Illumina 测序结果的 q PCR 验证 | 第45-47页 |
3.3 结果 | 第47-53页 |
3.3.1 RNA 样品的制备及质量评价 | 第47-48页 |
3.3.2 测序产量统计及评价、组装序列质量评价 | 第48页 |
3.3.3 两种甜瓜盐胁迫差异表达基因筛选 | 第48-50页 |
3.3.4 Illumina 测序结果的 q PCR 验证 | 第50-53页 |
3.4 讨论 | 第53页 |
第四章 :差异表达基因功能注释及代谢通路分析 | 第53-65页 |
4.1 引言 | 第53-54页 |
4.2 分析方法 | 第54-55页 |
4.2.1 GO 功能注释 | 第54页 |
4.2.2 KEGG pathway 分析 | 第54-55页 |
4.3 分析结果 | 第55-65页 |
4.3.1 差异表达基因的 GO 功能分类 | 第55-60页 |
4.3.2 差异表达基因的 KEGG 代谢通路分析 | 第60-65页 |
第五章 :盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析 | 第65-71页 |
5.1 盐胁迫应答转录因子的鉴定 | 第65-69页 |
5.1.1 甜瓜响应盐胁迫转录因子的数量和变化幅度 | 第66页 |
5.1.2 对盐胁迫响应的品种特异和重叠转录因子数量 | 第66-67页 |
5.1.3 盐胁迫响应的转录因子分类及部分转录因子 | 第67-69页 |
5.2 讨论 | 第69-71页 |
第六章 盐胁迫下两个甜瓜品种其它盐响应基因的转录组分析 | 第71-91页 |
6.1 盐胁迫应答物质运输相关基因的鉴定 | 第72-77页 |
6.2 盐胁迫应答抗氧化系统相关基因的鉴定 | 第77-79页 |
6.3 盐胁迫应答糖代谢途径相关基因的鉴定 | 第79-82页 |
6.4 盐胁迫应答细胞壁组成相关基因的鉴定 | 第82-84页 |
6.5 盐胁迫应答光合作用相关基因的鉴定 | 第84页 |
6.6 盐胁迫应答热激蛋白(HSP)相关基因的鉴定 | 第84-86页 |
6.7 盐胁迫应答胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)相关基因的鉴定 | 第86页 |
6.8 目的基因在不同盐胁迫时间下的差异表达分析 | 第86-90页 |
6.9 本章小结 | 第90-91页 |
第七章 :总结与展望 | 第91-93页 |
7.1 结论 | 第91-92页 |
7.2 主要创新点 | 第92页 |
7.3 展望 | 第92-93页 |
参考文献 | 第93-103页 |
致谢 | 第103-105页 |
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第105-106页 |
攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第106-108页 |