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盐胁迫下两个甜瓜品种的转录组分析

摘要第3-6页
ABSTRACT第6-9页
目录第10-13页
第一章 绪论第13-30页
    1.1 盐胁迫对植物产生的危害第13-16页
        1.1.1 盐胁迫对植物形态发育的影响第13-14页
        1.1.2 盐胁迫对植物代谢的影响第14-16页
    1.2 植物的耐盐机制第16-20页
        1.2.1 植物的耐盐机制第16-18页
        1.2.2 植物的耐盐指标第18-20页
    1.3 甜瓜耐盐性研究进展第20-21页
    1.4 转录组学在植物抗逆性方面的研究进展第21-26页
        1.4.1 转录组学的研究方法第21-23页
        1.4.2 Illumina 转录组测序技术第23页
        1.4.3 有参考基因组的转录组的方法及数据分析第23-25页
        1.4.4 转录组学在植物抗逆性方面的研究进展第25-26页
    1.5 甜瓜基因组学研究进展第26-27页
    1.6 本研究的目的和意义第27页
    1.7 研究内容和技术路线第27-30页
        1.7.1 研究内容第27-28页
        1.7.2 技术路线第28-30页
第二章 :两个甜瓜品种的生理生化指标比较分析第30-40页
    2.1 材料与方法第30-31页
        2.1.1 实验材料第30页
        2.1.2 材料处理第30页
        2.1.3 实验方法第30-31页
        2.1.4 数据处理第31页
    2.2 结果第31-38页
        2.2.1 表型观察第31-32页
        2.2.2 盐胁迫对甜瓜幼苗叶绿素荧光参数的影响第32-33页
        2.2.3 盐胁迫对甜瓜幼苗光合参数的影响第33-34页
        2.2.4 盐胁迫对甜瓜幼苗离子流参数的影响第34-36页
        2.2.5 植株干鲜重、株高的测定第36-38页
    2.3 讨论第38-40页
        2.3.1 盐胁迫对甜瓜幼苗叶绿素荧光参数的影响第38页
        2.3.2 盐胁迫对甜瓜幼苗光合参数的影响第38-39页
        2.3.3 盐胁迫对甜瓜幼苗离子流参数的影响第39页
        2.3.4 盐胁迫对甜瓜生长的影响第39-40页
第三章 :两个甜瓜品种转录组测序及分析第40-53页
    3.1 材料与试剂第40-41页
        3.1.1 实验材料第40页
        3.1.2 材料处理第40页
        3.1.3 实验试剂第40-41页
    3.2 实验方法第41-47页
        3.2.1 叶片总 RNA 的提取及质量检测第41-43页
        3.2.2 测序文库制备第43页
        3.2.3 Illumina 测序第43页
        3.2.4 测序数据处理及分析第43-45页
        3.2.5 Illumina 测序结果的 q PCR 验证第45-47页
    3.3 结果第47-53页
        3.3.1 RNA 样品的制备及质量评价第47-48页
        3.3.2 测序产量统计及评价、组装序列质量评价第48页
        3.3.3 两种甜瓜盐胁迫差异表达基因筛选第48-50页
        3.3.4 Illumina 测序结果的 q PCR 验证第50-53页
    3.4 讨论第53页
第四章 :差异表达基因功能注释及代谢通路分析第53-65页
    4.1 引言第53-54页
    4.2 分析方法第54-55页
        4.2.1 GO 功能注释第54页
        4.2.2 KEGG pathway 分析第54-55页
    4.3 分析结果第55-65页
        4.3.1 差异表达基因的 GO 功能分类第55-60页
        4.3.2 差异表达基因的 KEGG 代谢通路分析第60-65页
第五章 :盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析第65-71页
    5.1 盐胁迫应答转录因子的鉴定第65-69页
        5.1.1 甜瓜响应盐胁迫转录因子的数量和变化幅度第66页
        5.1.2 对盐胁迫响应的品种特异和重叠转录因子数量第66-67页
        5.1.3 盐胁迫响应的转录因子分类及部分转录因子第67-69页
    5.2 讨论第69-71页
第六章 盐胁迫下两个甜瓜品种其它盐响应基因的转录组分析第71-91页
    6.1 盐胁迫应答物质运输相关基因的鉴定第72-77页
    6.2 盐胁迫应答抗氧化系统相关基因的鉴定第77-79页
    6.3 盐胁迫应答糖代谢途径相关基因的鉴定第79-82页
    6.4 盐胁迫应答细胞壁组成相关基因的鉴定第82-84页
    6.5 盐胁迫应答光合作用相关基因的鉴定第84页
    6.6 盐胁迫应答热激蛋白(HSP)相关基因的鉴定第84-86页
    6.7 盐胁迫应答胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)相关基因的鉴定第86页
    6.8 目的基因在不同盐胁迫时间下的差异表达分析第86-90页
    6.9 本章小结第90-91页
第七章 :总结与展望第91-93页
    7.1 结论第91-92页
    7.2 主要创新点第92页
    7.3 展望第92-93页
参考文献第93-103页
致谢第103-105页
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第105-106页
攻读硕士学位期间参与的科研项目第106-108页

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