摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第1章 绪论 | 第8-23页 |
1.1 引言 | 第8-9页 |
1.2 miRNA | 第9-20页 |
1.2.1 miRNA 简介 | 第9-10页 |
1.2.2 miRNA 在植物中的功能与研究进展 | 第10-11页 |
1.2.3 miRNA 与植物非生物胁迫应答 | 第11-15页 |
1.2.4 miRNA 与植物生物胁迫应答 | 第15-16页 |
1.2.5 胁迫应答 miRNA 的调控网络 | 第16-17页 |
1.2.6 miRNA 的研究方法 | 第17-19页 |
1.2.7 miRBase 数据库 | 第19页 |
1.2.8 植物 miRNA 靶基因的预测 | 第19-20页 |
1.3 甜菜 | 第20-21页 |
1.3.1 甜菜简介 | 第20页 |
1.3.2 甜菜耐盐研究进展 | 第20-21页 |
1.4 主要研究内容 | 第21页 |
1.5 本文研究目的 | 第21-23页 |
第2章 实验材料与方法 | 第23-32页 |
2.1 材料与试剂 | 第23-26页 |
2.1.1 实验材料 | 第23页 |
2.1.2 实验试剂 | 第23-25页 |
2.1.3 实验仪器 | 第25-26页 |
2.2 实验方法 | 第26-32页 |
2.2.1 甜菜幼苗培育与处理 | 第26页 |
2.2.2 甜菜 miRNA 的生物信息学预测 | 第26-27页 |
2.2.3 甜菜小 RNA 文库构建与 solexa 测序 | 第27页 |
2.2.4 测序数据分析 | 第27-28页 |
2.2.5 miRNA 的验证与表达情况分析 | 第28-32页 |
第3章 甜菜 miRNA 及其靶基因的生物信息学预测 | 第32-44页 |
3.1 引言 | 第32页 |
3.2 基于同源性筛选出的潜在候选 miRNA | 第32-33页 |
3.3 候选 miRNA 的二级结构预测 | 第33-35页 |
3.4 候选 miRNA 的靶基因预测 | 第35-43页 |
3.5 本章小结 | 第43-44页 |
第4章 甜菜叶片 miRNA 的高通量测序 | 第44-55页 |
4.1 miRNA 提取及质量检测 | 第44-45页 |
4.2 测序结果统计 | 第45-49页 |
4.3 测序 miRNA 的靶基因预测 | 第49-54页 |
4.4 本章小结 | 第54-55页 |
第5章 耐盐相关 miRNA 差异表达分析 | 第55-63页 |
5.1 甜菜幼苗的盐胁迫处理 | 第55-56页 |
5.2 不同处理甜菜 miRNA 测序与差异表达分析 | 第56-60页 |
5.3 差异表达 miRNA 的 qRT-PCR 验证 | 第60-62页 |
5.4 本章小结 | 第62-63页 |
结论 | 第63-64页 |
展望 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-71页 |
附录 Ⅰ 部分待选 miRNA 序列同源性信息 | 第71-75页 |
附录 Ⅱ 具有茎环结果的 pre-miRNA | 第75-79页 |
附录 Ⅲ 部分 miRNA 预测的二级结构前体图 | 第79-83页 |
附录 Ⅳ 部分高通量测序鉴定的 miRNA | 第83-87页 |
附录 Ⅴ qRT-PCR 数据处理 | 第87-89页 |
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第89-91页 |
致谢 | 第91页 |