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甜菜miRNA生物信息学预测及耐盐相关miRNA表达分析

摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 绪论第8-23页
    1.1 引言第8-9页
    1.2 miRNA第9-20页
        1.2.1 miRNA 简介第9-10页
        1.2.2 miRNA 在植物中的功能与研究进展第10-11页
        1.2.3 miRNA 与植物非生物胁迫应答第11-15页
        1.2.4 miRNA 与植物生物胁迫应答第15-16页
        1.2.5 胁迫应答 miRNA 的调控网络第16-17页
        1.2.6 miRNA 的研究方法第17-19页
        1.2.7 miRBase 数据库第19页
        1.2.8 植物 miRNA 靶基因的预测第19-20页
    1.3 甜菜第20-21页
        1.3.1 甜菜简介第20页
        1.3.2 甜菜耐盐研究进展第20-21页
    1.4 主要研究内容第21页
    1.5 本文研究目的第21-23页
第2章 实验材料与方法第23-32页
    2.1 材料与试剂第23-26页
        2.1.1 实验材料第23页
        2.1.2 实验试剂第23-25页
        2.1.3 实验仪器第25-26页
    2.2 实验方法第26-32页
        2.2.1 甜菜幼苗培育与处理第26页
        2.2.2 甜菜 miRNA 的生物信息学预测第26-27页
        2.2.3 甜菜小 RNA 文库构建与 solexa 测序第27页
        2.2.4 测序数据分析第27-28页
        2.2.5 miRNA 的验证与表达情况分析第28-32页
第3章 甜菜 miRNA 及其靶基因的生物信息学预测第32-44页
    3.1 引言第32页
    3.2 基于同源性筛选出的潜在候选 miRNA第32-33页
    3.3 候选 miRNA 的二级结构预测第33-35页
    3.4 候选 miRNA 的靶基因预测第35-43页
    3.5 本章小结第43-44页
第4章 甜菜叶片 miRNA 的高通量测序第44-55页
    4.1 miRNA 提取及质量检测第44-45页
    4.2 测序结果统计第45-49页
    4.3 测序 miRNA 的靶基因预测第49-54页
    4.4 本章小结第54-55页
第5章 耐盐相关 miRNA 差异表达分析第55-63页
    5.1 甜菜幼苗的盐胁迫处理第55-56页
    5.2 不同处理甜菜 miRNA 测序与差异表达分析第56-60页
    5.3 差异表达 miRNA 的 qRT-PCR 验证第60-62页
    5.4 本章小结第62-63页
结论第63-64页
展望第64-65页
参考文献第65-71页
附录 Ⅰ 部分待选 miRNA 序列同源性信息第71-75页
附录 Ⅱ 具有茎环结果的 pre-miRNA第75-79页
附录 Ⅲ 部分 miRNA 预测的二级结构前体图第79-83页
附录 Ⅳ 部分高通量测序鉴定的 miRNA第83-87页
附录 Ⅴ qRT-PCR 数据处理第87-89页
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果第89-91页
致谢第91页

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