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几种产毒海洋微藻的膜分类芯片检测技术

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第1章 绪论第11-22页
    1.1 赤潮概述第11-12页
        1.1.1 赤潮的定义及危害第11页
        1.1.2 赤潮的形成因素第11页
        1.1.3 赤潮的预报及检测第11-12页
    1.2 赤潮藻检测的分子技术第12-17页
        1.2.1 凝集素探针第12-13页
        1.2.2 抗体探针第13-14页
        1.2.3 基因探针第14-17页
    1.3 国内外研究进展第17-20页
        1.3.1 国内研究进展第17页
        1.3.2 国外研究进展第17-20页
    1.4 本课题研究内容及意义第20-22页
        1.4.1 研究内容第20-21页
        1.4.2 研究意义第21-22页
第2章 产毒微藻的核糖体大亚基 D1–D2 区的克隆及特异性探针的设计第22-38页
    2.1 前言第22页
    2.2 材料与方法第22-28页
        2.2.1 实验藻种及培养第22-23页
        2.2.2 实验试剂第23页
        2.2.3 主要培养基及溶液配制第23-24页
        2.2.4 实验仪器第24页
        2.2.5 藻种 LSU 的克隆测序第24-26页
        2.2.6 分类探针的设计第26页
        2.2.7 探针特异性验证第26-28页
    2.3 结果与讨论第28-37页
        2.3.1 基因组的提取与质量检验第28-29页
        2.3.2 LSU D1–D2 区基因的扩增第29页
        2.3.3 PCR 产物的纯化第29-30页
        2.3.4 阳性克隆的菌落的 PCR 筛选第30-31页
        2.3.5 目标序列的 T-A 克隆及测序结果第31-34页
        2.3.6 分类探针的设计第34页
        2.3.7 分类探针的特异性验证第34-37页
    2.4 小结第37-38页
第3章 膜分类芯片检测技术杂交条件优化第38-50页
    3.1 前言第38页
    3.2 材料与方法第38-40页
        3.2.1 实验藻种及培养第38页
        3.2.2 实验试剂及仪器第38页
        3.2.3 制备膜分类芯片第38-39页
        3.2.4 制备生物素标记的 PCR 产物第39页
        3.2.5 紫外交联时间梯度实验第39页
        3.2.6 探针上样量梯度实验第39-40页
        3.2.7 PCR 产物反应浓度梯度实验第40页
        3.2.8 杂交时间梯度实验第40页
        3.2.9 杂交温度梯度实验第40页
        3.2.10 洗膜温度梯度实验第40页
        3.2.11 杂交图片的分析第40页
    3.3 结果与讨论第40-49页
        3.3.1 紫外交联时间优化结果第40-42页
        3.3.2 探针上样量优化结果第42-43页
        3.3.3 PCR 产物反应浓度优化结果第43-45页
        3.3.4 杂交时间优化结果第45-46页
        3.3.5 杂交温度优化结果第46页
        3.3.6 洗膜温度优化结果第46-49页
    3.4 小结第49-50页
第4章 膜分类芯片检测技术中靶序列的生物素标记方法优化第50-57页
    4.1 前言第50页
    4.2 材料与方法第50-52页
        4.2.1 实验藻种及培养第50页
        4.2.2 实验试剂及仪器第50页
        4.2.3 生物素掺入标记法第50-51页
        4.2.4 生物素引物标记法第51页
        4.2.5 PCR-随机引物扩增标记法第51页
        4.2.6 制备膜分类芯片第51页
        4.2.7 膜分类芯片检测第51-52页
        4.2.8 杂交图片的分析第52页
        4.2.9 成本核算第52页
    4.3 结果与讨论第52-56页
        4.3.1 3 种生物素标记方法扩增产物电泳图谱第52-53页
        4.3.2 3 种生物素标记方法扩增产物掺入效果检测第53-54页
        4.3.3 3 种生物素标记方法 PCR 产物的定量第54页
        4.3.4 3 种生物素标记方法的膜分类芯片检测第54-55页
        4.3.5 3 种生物素标记方法的成本核算第55-56页
    4.4 小结第56-57页
第5章 膜分类芯片检测技术的靶细胞处理方法优化第57-65页
    5.1 前言第57页
    5.2 材料与方法第57-59页
        5.2.1 实验藻种及培养第57页
        5.2.2 实验试剂及仪器第57页
        5.2.3 产毒微藻的计数及梯度设计第57-58页
        5.2.4 3 种细胞微藻基因组提取方法第58页
        5.2.5 靶核酸的 PCR 扩增和标记第58-59页
        5.2.6 膜分类芯片的制备第59页
        5.2.7 膜分类芯片检测第59页
        5.2.8 杂交图片的分析第59页
    5.3 结果与讨论第59-64页
        5.3.1 微藻细胞计数第59页
        5.3.2 LSU D1–D2 区的 PCR 扩增和标记第59-61页
        5.3.3 裂解缓冲液法的膜分类芯片检测第61-62页
        5.3.4 一管式植物 DNA 提取试剂盒法的膜分类芯片检测第62-63页
        5.3.5 CTAB 抽提法的膜分类芯片检测第63-64页
    5.4 小结第64-65页
第6章 非目标基因组的干扰和模拟自然水样实验第65-71页
    6.1 前言第65页
    6.2 材料与方法第65-66页
        6.2.1 实验藻种及培养第65页
        6.2.2 实验试剂及仪器第65页
        6.2.3 非目标基因组干扰实验第65-66页
        6.2.4 模拟自然水样实验第66页
    6.3 结果与讨论第66-70页
        6.3.1 非目标基因组干扰实验第66-68页
        6.3.2 模拟自然水样实验第68-70页
    6.4 小结第70-71页
结论第71-72页
参考文献第72-78页
攻读硕士学位期间发表的学术论文及其它成果第78-80页
致谢第80页

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