| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略词 | 第11-12页 |
| 第一部分 恶性黑素瘤转录组研究 | 第12-45页 |
| 前言 | 第12-15页 |
| 1.方法 | 第15-27页 |
| 1.1 实验材料 | 第15页 |
| 1.2 主要仪器与设备 | 第15-16页 |
| 1.3 主要试剂与耗材 | 第16页 |
| 1.4 实验方法 | 第16-23页 |
| 1.4.1 细胞培养 | 第16-18页 |
| 1.4.2 总 RNA 提取 | 第18-19页 |
| 1.4.3 mRNA 分离 | 第19-20页 |
| 1.4.4 SOLiD 转录组 cDNA 文库的构建 | 第20-22页 |
| 1.4.5 SOLiD 上机前准备 | 第22-23页 |
| 1.5 数据分析方法 | 第23-27页 |
| 1.5.1 SOLiD 测序序列与基因组对比 | 第23-24页 |
| 1.5.2 构建 Junction 数据集 | 第24页 |
| 1.5.3 基因表达丰富度的统计 | 第24-25页 |
| 1.5.4 差异表达基因的鉴定和功能分析 | 第25页 |
| 1.5.5 差异表达基因在染色体上的分布研究 | 第25-26页 |
| 1.5.6 差异表达基因调控网络和细胞转导通路的构建 | 第26页 |
| 1.5.7 基因差异表达数学模型的构建 | 第26-27页 |
| 2.结果 | 第27-40页 |
| 2.1 mRNA 转录组文库的构建 | 第27页 |
| 2.2 RNA-seq 数据质量控制研究 | 第27-28页 |
| 2.3 RNA-seq 数据分析 | 第28-30页 |
| 2.4 基因表达丰度的统计 | 第30-31页 |
| 2.5 A375 和 A2058 细胞株差异表达基因的分析 | 第31-33页 |
| 2.6 恶性黑素瘤相关基因的染色体分布特点 | 第33-34页 |
| 2.7 与恶性黑素瘤转移相关的信号转导通路 | 第34-36页 |
| 2.8 与恶性黑素瘤发生、转移相关的基因表达模式 | 第36-37页 |
| 2.9 鉴别 scUscU, scUscD1 和 scDscU2 的网络 | 第37-40页 |
| 3. 讨论 | 第40-44页 |
| 4. 结论 | 第44-45页 |
| 第二部分 恶性黑素瘤转移相关分子机制的研究 | 第45-69页 |
| 前言 | 第45-47页 |
| 1.材料与方法 | 第47-58页 |
| 1.1 细胞和质粒 | 第47页 |
| 1.2 实验试剂和仪器 | 第47-50页 |
| 1.2.1 实验试剂和耗材 | 第47-48页 |
| 1.2.2 试剂盒 | 第48-49页 |
| 1.2.3 常用溶液和培养基 | 第49页 |
| 1.2.4 实验仪器 | 第49-50页 |
| 1.3 实验方法 | 第50-58页 |
| 1.3.1 基因过表达载体构建 | 第50-52页 |
| 1.3.2 化学转染(Lipofeactmine 2000) | 第52页 |
| 1.3.3 免疫印迹技术(Western blot) | 第52-54页 |
| 1.3.4 实时定量 PCR (Quantitative Real –time PCR) | 第54-56页 |
| 1.3.5 细胞培养 | 第56-57页 |
| 1.3.6. 细胞迁移实验 | 第57页 |
| 1.3.7. 细胞侵袭实验 | 第57-58页 |
| 2. 结果 | 第58-63页 |
| 2.1 与恶性黑素瘤转移相关的候选基因的确定 | 第58-59页 |
| 2.2 候选基因的 real time-PCR 验证 | 第59-60页 |
| 2.3 CTGF、Twist1、MAGEA1 过表达可促进 A375 迁移和侵袭 | 第60-63页 |
| 3. 讨论 | 第63-68页 |
| 4. 结论 | 第68-69页 |
| 文献综述 | 第69-75页 |
| 参考文献 | 第75-80页 |
| 研究生期间发表论文 | 第80-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
