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根蘖型苜蓿(Medicago varia)差异表达基因分析及根蘖性状发生分子机制研究

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-6页
目录第6-9页
1 引言第9-21页
   ·苜蓿简介第9-11页
     ·根蘖型苜楷的起源第9页
     ·苜蓿根蘖性状特点及研究进展第9-11页
     ·根蘖型苜蓿的应用与展望第11页
   ·功能基因组学概述第11-13页
     ·转录组学及研究方法第11-12页
     ·基于RNA-seq技术的转录组学研究第12-13页
   ·豆科模式植物蒺藜状苜蓿研究第13-14页
   ·差异基因表达分析的研究方法第14-17页
     ·mRNA差异显示技术第14-15页
     ·抑制性消减杂交(SSH)技术第15页
     ·基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)第15-16页
     ·DNA微阵列技术第16页
     ·cDNA-SRAP技术的原理与应用第16-17页
   ·生物信息学概论第17-19页
     ·序列比对第17页
     ·蛋白质结构比对和预测第17页
     ·基因识别非编码区分析研究第17-18页
     ·基因注释及功能分类第18-19页
   ·本研究的目的、意义及技术路线第19-21页
2. 根蘖型苜蓿转录组文库的构建与RNA-seq高通量测序分析第21-43页
   ·材料与方法第21-25页
     ·试验材料第21页
     ·试验方法第21-23页
     ·RNA-seq转录组文库生物信息学分析第23-25页
   ·结果与分析第25-41页
     ·RNA提取结果与分析第25-26页
     ·mRNA的分离结果与分析第26-27页
     ·RNA-seq转录组测序结果与分析第27-36页
     ·Gene Ontology功能显著性富集分析结果第36-37页
     ·gnl|UG|Mtr#S5430627基因的序列分析与功能预测第37-40页
     ·gnl|UG|Mtr#S5322324基因的序列分析第40-41页
   ·小结与讨论第41-43页
     ·根蘖型苜蓿转录组解析第41页
     ·根蘖性状发生的相关基因研究第41-43页
3. 根蘖型苜蓿CDNA-SRAP差异表达基因研究第43-53页
   ·材料与方法第43-46页
     ·实验材料第43页
     ·总RNA的提取与检测第43页
     ·cDNA的合成及cDNA-SRAP扩增第43-44页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第44-45页
     ·特异性条带的回收及测序第45-46页
   ·结果与分析第46-51页
     ·RNA提取及cDNA合成结果分析第46-47页
     ·cDNA-SRAP扩增反应及电泳结果分析第47-48页
     ·扩增条带差异性分析第48-49页
     ·差异条带回收与克隆转化结果第49-50页
     ·测序结果分析第50-51页
   ·小结与讨论第51-53页
     ·cDNA-SRAP差异表达基因筛选第51-52页
     ·差异条带扩增结果分析第52页
     ·差异表达基因筛选第52-53页
4. 结论与讨论第53-56页
   ·根蘖型苜蓿转录组表达分析第53页
   ·根蘖性状差异表达基因的分析第53-54页
   ·根蘖性状发生的分子机制的讨论第54-55页
   ·今后研究重点第55-56页
创新点第56-57页
缩写词第57页
试剂第57页
主要仪器设备第57-58页
参考文献第58-63页
个人简介第63-64页
导师简介第64-65页
致谢第65页

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