| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 课题的研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外的研究现状 | 第9-11页 |
| 1.3 本文研究的内容和结构 | 第11-12页 |
| 第2章 基于先验生物学知识生成基因网络 | 第12-21页 |
| 2.1 GRANGER因果关系建模-GC模型 | 第12-13页 |
| 2.2 二元GRANGER因果关系建模 | 第13-15页 |
| 2.3 多元GRANGER因果关系建模 | 第15-17页 |
| 2.3.1 现存策略的问题 | 第17页 |
| 2.4 利用先验知识指导Granger因果关系建模 | 第17-19页 |
| 2.5 算法 | 第19-21页 |
| 第3章 基因调控关系显著性 | 第21-26页 |
| 3.1 用蒙特卡洛方法计算显著性水平 | 第21-24页 |
| 3.1.1 F检验的介绍 | 第22-23页 |
| 3.1.2 不能选择F检验的原因 | 第23页 |
| 3.1.3 算法 | 第23-24页 |
| 3.2 皮尔逊相关系数计算 | 第24-26页 |
| 3.2.1 皮尔逊相关系数介绍 | 第24-26页 |
| 第4章 实验结果及分析 | 第26-35页 |
| 4.1 数据来源 | 第26-28页 |
| 4.2 数据处理过程及基因网络生成 | 第28-29页 |
| 4.3 真实生物数据应用与相关结果分析 | 第29-35页 |
| 4.3.1 阻塞性睡眠呼吸暂停综合证基因表达数据 | 第29-32页 |
| 4.3.2 慢性淋巴细胞白血病基因表达数据 | 第32-35页 |
| 第5章 结论 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-40页 |
| 致谢 | 第40-41页 |