英文缩略词 | 第6-8页 |
摘要 | 第8-11页 |
ABSTRACT | 第11-14页 |
第一章 基于全基因组DNA甲基化芯片技术建立肾透明细胞癌启动子区域的DNA甲基化谱 | 第15-44页 |
1. 前言 | 第15-18页 |
2. 研究对象与研究方法 | 第18-23页 |
2.1 研究对象 | 第18页 |
2.2 TCGA数据库肾透明细胞癌甲基化及mRNA数据下载 | 第18-19页 |
2.3 全基因组甲基化差异分析 | 第19-20页 |
2.4 缩小重心分类算法挖掘诊断标记甲基化位点 | 第20-21页 |
2.5 负二项分布模型进行基因表达差异分析 | 第21-22页 |
2.6 通路富集分析 | 第22-23页 |
3. 结果 | 第23-35页 |
3.1 样本信息 | 第23-24页 |
3.2 肾透明细胞癌与癌旁组织的启动子差异DNA甲基化位点 | 第24-26页 |
3.3 肾透明细胞癌与癌旁组织的启动子差异DNA甲基化基因 | 第26-27页 |
3.4 诊断标记甲基化位点 | 第27-31页 |
3.5 肾透明细胞癌与癌旁组织的mRNA表达差异基因 | 第31-33页 |
3.6 通路富集 | 第33-35页 |
4. 讨论 | 第35-39页 |
参考文献A | 第39-44页 |
第二章 诊断标记位点甲基化程度及RAB25、CA9、CYP4B1基因表达水平的验证 | 第44-86页 |
1. 前言 | 第44-45页 |
2. 材料及方法 | 第45-63页 |
2.1 组织样本 | 第45-46页 |
2.2 主要试剂、耗材及设备 | 第46-47页 |
2.3 实验步骤 | 第47-62页 |
2.4 GEO数据验证 | 第62-63页 |
2.5 统计学分析 | 第63页 |
3. 结果 | 第63-74页 |
3.1 实验样本信息 | 第63-64页 |
3.2 诊断标记位点的甲基化程度验证 | 第64-67页 |
3.3 RAB25、CA9、CYP4B1基因mRNA表达水平验证 | 第67-70页 |
3.4 RAB25、CA9、CYP4B1基因启动子甲基化对其mRNA表达影响 | 第70-71页 |
3.5 肾透明细胞癌组织中RAB25、CA9启动子甲基化与患者预后的关系 | 第71-74页 |
4. 讨论 | 第74-79页 |
5. 全文小结 | 第79-81页 |
5.1 本研究的结论 | 第79页 |
5.2 本研究的创新性和局限性 | 第79-81页 |
参考文献B | 第81-86页 |
第三章 肾癌表观遗传机制的研究进展 | 第86-91页 |
1. DNA甲基化 | 第87页 |
2. 组蛋白修饰 | 第87-89页 |
参考文献C | 第89-91页 |
攻读学位期间发表的学术论文及成果 | 第91-92页 |
致谢 | 第92页 |