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肾透明细胞癌启动子区域DNA甲基化研究

英文缩略词第6-8页
摘要第8-11页
ABSTRACT第11-14页
第一章 基于全基因组DNA甲基化芯片技术建立肾透明细胞癌启动子区域的DNA甲基化谱第15-44页
    1. 前言第15-18页
    2. 研究对象与研究方法第18-23页
        2.1 研究对象第18页
        2.2 TCGA数据库肾透明细胞癌甲基化及mRNA数据下载第18-19页
        2.3 全基因组甲基化差异分析第19-20页
        2.4 缩小重心分类算法挖掘诊断标记甲基化位点第20-21页
        2.5 负二项分布模型进行基因表达差异分析第21-22页
        2.6 通路富集分析第22-23页
    3. 结果第23-35页
        3.1 样本信息第23-24页
        3.2 肾透明细胞癌与癌旁组织的启动子差异DNA甲基化位点第24-26页
        3.3 肾透明细胞癌与癌旁组织的启动子差异DNA甲基化基因第26-27页
        3.4 诊断标记甲基化位点第27-31页
        3.5 肾透明细胞癌与癌旁组织的mRNA表达差异基因第31-33页
        3.6 通路富集第33-35页
    4. 讨论第35-39页
    参考文献A第39-44页
第二章 诊断标记位点甲基化程度及RAB25、CA9、CYP4B1基因表达水平的验证第44-86页
    1. 前言第44-45页
    2. 材料及方法第45-63页
        2.1 组织样本第45-46页
        2.2 主要试剂、耗材及设备第46-47页
        2.3 实验步骤第47-62页
        2.4 GEO数据验证第62-63页
        2.5 统计学分析第63页
    3. 结果第63-74页
        3.1 实验样本信息第63-64页
        3.2 诊断标记位点的甲基化程度验证第64-67页
        3.3 RAB25、CA9、CYP4B1基因mRNA表达水平验证第67-70页
        3.4 RAB25、CA9、CYP4B1基因启动子甲基化对其mRNA表达影响第70-71页
        3.5 肾透明细胞癌组织中RAB25、CA9启动子甲基化与患者预后的关系第71-74页
    4. 讨论第74-79页
    5. 全文小结第79-81页
        5.1 本研究的结论第79页
        5.2 本研究的创新性和局限性第79-81页
    参考文献B第81-86页
第三章 肾癌表观遗传机制的研究进展第86-91页
    1. DNA甲基化第87页
    2. 组蛋白修饰第87-89页
    参考文献C第89-91页
攻读学位期间发表的学术论文及成果第91-92页
致谢第92页

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