| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-39页 |
| ·引言 | 第20-22页 |
| ·中国黄牛情况简介 | 第20页 |
| ·中国良种黄牛选育情况简介 | 第20-21页 |
| ·现代分子生物技术在中国黄牛育种上的应用情况简介 | 第21-22页 |
| ·牛13 个体尺相关基因的研究进展 | 第22-30页 |
| ·UQCC 基因的研究进展 | 第22页 |
| ·GDF5 基因的研究进展 | 第22-23页 |
| ·ADAMTSL3 基因研究进展 | 第23-24页 |
| ·ZBT838 基因的研究进展 | 第24-25页 |
| ·CDK6 基因的研究进展 | 第25-26页 |
| ·HHIP 基因的研究进展 | 第26-27页 |
| ·IHH 基因的研究进展 | 第27页 |
| ·GHRL 基因的研究进展 | 第27页 |
| ·PTHR1 基因的研究进展 | 第27-28页 |
| ·INS 基因的研究进展 | 第28-29页 |
| ·UCP2 基因的研究进展 | 第29页 |
| ·c011A1 和c011A2 基因的研究进展 | 第29-30页 |
| ·单核苷酸多态性标记技术的研究进展 | 第30-37页 |
| ·SNP 技术简介 | 第30页 |
| ·SNP 的分类 | 第30-31页 |
| ·SNP 的检测方法及原理 | 第31-37页 |
| ·电泳方法 | 第31页 |
| ·酶学方法 | 第31-35页 |
| ·杂交方法 | 第35-36页 |
| ·熔解方法 | 第36页 |
| ·物理方法 | 第36页 |
| ·化学方法 | 第36-37页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第37-39页 |
| 第二章 材料与方法 | 第39-58页 |
| ·材料 | 第39-41页 |
| ·血样 | 第39页 |
| ·组织样品 | 第39页 |
| ·试验牛数据 | 第39-40页 |
| ·载体和菌株 | 第40-41页 |
| ·主要仪器设备和试剂 | 第41-44页 |
| ·主要仪器设备 | 第41-42页 |
| ·主要试剂 | 第42页 |
| ·主要试剂和溶液的配制 | 第42-44页 |
| ·DNA 提取所需试剂的配制 | 第42-43页 |
| ·电泳所用的有关试剂 | 第43页 |
| ·基因克隆试剂 | 第43-44页 |
| ·试验方法 | 第44-58页 |
| ·RNA 的提取和检测 | 第44页 |
| ·总RNA 提取 | 第44页 |
| ·普通RT-PCR 合成cDNA | 第44页 |
| ·总RNA 质量检测 | 第44页 |
| ·血液DNA 的提取和检测 | 第44-45页 |
| ·DNA 的提取 | 第44-45页 |
| ·DNA 质量检测 | 第45页 |
| ·基因序列的分离和克隆 | 第45-48页 |
| ·目的基因的ESTs 检索、收集与拼接 | 第45-46页 |
| ·基因分离、克隆的引物设计 | 第46-47页 |
| ·PCR 扩增产物的回收纯化、克隆和测序 | 第47-48页 |
| ·基因的表达谱分析 | 第48-49页 |
| ·Q-PCR 引物设计 | 第48-49页 |
| ·Q-PCR 扩增 | 第49页 |
| ·组织表达谱分析 | 第49页 |
| ·启动子结构特征分析 | 第49页 |
| ·基因的低通量多态检测 | 第49-52页 |
| ·多态位点筛查的引物设计 | 第49页 |
| ·筛查出的SNP 多态位点的酶切验证和分型 | 第49-51页 |
| ·筛查出的SNP 多态位点的等位基因PCR 验证及分型 | 第51页 |
| ·筛查出的SNP 多态位点的创造酶切位点PCR 验证及分型 | 第51-52页 |
| ·筛查出的SNP 多态位点的直接测序法验证及分型 | 第52页 |
| ·基因的中通量多态检测 | 第52-54页 |
| ·基因组DNA 的准备 | 第52页 |
| ·SNP 位点的准备及引物设计 | 第52页 |
| ·多重PCR 反应 | 第52-53页 |
| ·SAP 酶消化反应 | 第53页 |
| ·单碱基延伸反应 | 第53-54页 |
| ·质谱仪检测 | 第54页 |
| ·质谱对SNP 多态位点的分型 | 第54页 |
| ·测定指标的统计分析 | 第54-56页 |
| ·基因和基因型频率 | 第54页 |
| ·多态信息含量 | 第54页 |
| ·有效等位基因数 | 第54-55页 |
| ·群体纯合度和杂合度 | 第55页 |
| ·Hardy-Weinberg 平衡 | 第55页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第55-56页 |
| ·相关性统计分析模型 | 第56页 |
| ·主要分子生物学软件和数据库 | 第56-58页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第56页 |
| ·序列分析工具和数据库 | 第56页 |
| ·蛋白质析工具 | 第56-58页 |
| 第三章 结果与分析 | 第58-134页 |
| ·总RNA 和DNA 提取结果 | 第58页 |
| ·总RNA 提取结果 | 第58页 |
| ·DNA 提取结果 | 第58页 |
| ·基因克隆与生物信息学分析 | 第58-93页 |
| ·牛UQCC 基因的克隆及生物信息学分析 | 第58-62页 |
| ·牛UQCC 基因Contig 的获得 | 第58页 |
| ·牛UQCC 基因cDNA 的克隆 | 第58页 |
| ·牛UQCC 基因cDNA 序列分析 | 第58-60页 |
| ·牛UQCC 基因推导出的蛋白质特性分析 | 第60-62页 |
| ·牛GDF5 基因生物信息学分析 | 第62-65页 |
| ·牛GDF5 基因序列特征分析 | 第62页 |
| ·牛GDF5 基因蛋白质特性分析 | 第62-65页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因生物信息学分析 | 第65-68页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因序列特征分析 | 第65页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因蛋白质特性分析 | 第65-68页 |
| ·牛ZBT838 基因生物信息学分析 | 第68-71页 |
| ·牛ZBT838 基因序列特征分析 | 第68页 |
| ·牛ZBT838 基因蛋白质特性分析 | 第68-71页 |
| ·牛CDK6 基因生物信息学分析 | 第71-73页 |
| ·牛CDK6 基因序列特征分析 | 第71页 |
| ·牛CDK6 基因蛋白质特性分析 | 第71-73页 |
| ·牛HHIP 基因生物信息学分析 | 第73-75页 |
| ·牛HHIP 基因序列特征分析 | 第73页 |
| ·牛HHIP 基因蛋白质特性分析 | 第73-75页 |
| ·牛IHH 基因生物信息学分析 | 第75-78页 |
| ·牛IHH 基因序列特征分析 | 第75页 |
| ·牛IHH 基因蛋白质特性分析 | 第75-78页 |
| ·牛GHRL 基因生物信息学分析 | 第78-80页 |
| ·牛GHRL 基因序列特征分析 | 第78页 |
| ·牛GHRL 基因蛋白质特性分析 | 第78-80页 |
| ·牛PTHR1 基因生物信息学分析 | 第80-83页 |
| ·牛PTHR1 基因序列特征分析 | 第80页 |
| ·牛PTHR1 基因蛋白质特性分析 | 第80-83页 |
| ·牛INS 基因生物信息学分析 | 第83-85页 |
| ·牛INS 基因序列特征分析 | 第83页 |
| ·牛INS 基因蛋白质特性分析 | 第83-85页 |
| ·牛UCP2 基因生物信息学分析 | 第85-87页 |
| ·牛UCP2 基因序列特征分析 | 第85页 |
| ·牛UCP2 基因蛋白质特性分析 | 第85-87页 |
| ·牛c011A1 基因生物信息学分析 | 第87-90页 |
| ·牛c011A1 基因序列特征分析 | 第87页 |
| ·牛c011A1 基因蛋白质特性分析 | 第87-90页 |
| ·牛c011A2 基因生物信息学分析 | 第90-93页 |
| ·牛c011A2 基因序列特征分析 | 第90页 |
| ·牛c011A2 基因蛋白质特性分析 | 第90-93页 |
| ·基因启动子序列特征分析 | 第93-96页 |
| ·牛GDF5 基因的启动子序列特征分析 | 第93-95页 |
| ·牛GDF5 基因启动子的克隆 | 第93页 |
| ·牛GDF5 基因启动子序列特征分析 | 第93-95页 |
| ·牛CDK6 基因的启动子序列特征分析 | 第95-96页 |
| ·牛CDK6 基因启动子的克隆 | 第95页 |
| ·牛CDK6 基因启动子的克隆 | 第95-96页 |
| ·基因荧光定量组织表达谱分析 | 第96-98页 |
| ·牛UQCC 基因荧光定量组织表达谱分析 | 第96页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因荧光定量组织表达谱分析 | 第96-98页 |
| ·牛13 个基因表达谱在线分析 | 第98页 |
| ·基因多态性检测及遗传效应分析 | 第98-126页 |
| ·牛UQCC 基因的遗传变异与体尺性状的关联分析 | 第98-103页 |
| ·牛UQCC 基因的SNPs 筛查 | 第98-99页 |
| ·PCR 扩增产物及酶切分型结果 | 第99页 |
| ·牛UQCC 基因SNP 位点等位基因频率、基因型频率及哈代-温博格平衡检验 | 第99-101页 |
| ·牛UQCC 基因SNP 位点在群体中的遗传特性 | 第101-102页 |
| ·牛UQCC 基因SNP 位点的连锁不平衡分析及联合基因型频率分析 | 第102页 |
| ·牛UQCC 基因多态性与体尺性状的关联分析 | 第102-103页 |
| ·牛GDF5 基因的遗传变异与肉质和体尺性状的关联分析 | 第103-106页 |
| ·牛GDF5 基因的SNPs 筛查 | 第103-104页 |
| ·PCR 扩增产物及酶切分型结果 | 第104页 |
| ·牛GDF5 基因SNP 位点等位基因频率、基因型频率及哈代-温博格平衡检验 | 第104页 |
| ·牛GDF5 基因SNP 位点在群体中的遗传特性 | 第104-105页 |
| ·牛GDF5 基因多态性与体尺性状的关联分析 | 第105-106页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因的遗传变异与体尺性状的关联分析 | 第106-111页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因的SNPs 筛查 | 第106-107页 |
| ·PCR 扩增产物及AS-PCR 分型结果 | 第107-108页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因SNP 位点等位基因频率、基因型频率及哈代-温博格平衡检验 | 第108-109页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因SNP 位点在群体中的遗传特性 | 第109-110页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因SNP 位点的连锁不平衡分析及联合基因型频率分析 | 第110页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因多态性与体尺性状的关联分析 | 第110-111页 |
| ·牛ZBT838 基因的遗传变异与体尺性状的关联分析 | 第111-124页 |
| ·牛ZBT838 基因的SNPs 筛查 | 第111-112页 |
| ·PCR 扩增产物及AS-PCR 分型结果 | 第112-113页 |
| ·牛ZBT838 基因SNP 位点等位基因频率、基因型频率及哈代-温博格平衡检验 | 第113-119页 |
| ·牛ZBT838 基因SNP 位点在群体中的遗传特性 | 第119-122页 |
| ·牛ZBT838 基因SNP A841G 多态性与体尺性状的关联分析 | 第122-123页 |
| ·牛ZBT838 基因直接测序得到的9 个SNP 位点的连锁不平衡分析 | 第123-124页 |
| ·牛ZBT838 基因9 个SNP 位点与体尺性状的关联分析 | 第124页 |
| ·牛CDK6 基因的遗传变异与体尺性状的关联分析 | 第124-126页 |
| ·牛CDK6 基因的SNPs 筛查 | 第124页 |
| ·PCR 扩增产物及创造酶切PCR 分型结果 | 第124-125页 |
| ·牛CDK6 基因SNP 位点等位基因频率、基因型频率及哈代-温博格平衡检验 | 第125页 |
| ·牛CDK6 基因SNP 位点在群体中的遗传特性 | 第125-126页 |
| ·牛CDK6 基因多态性与体尺性状的关联分析 | 第126页 |
| ·中通量法检测基因多态性及遗传效应分析 | 第126-134页 |
| ·DNA 样品及SNPs 位点的准备 | 第126-127页 |
| ·DNA 样品的预处理结果 | 第126-127页 |
| ·SNPs 位点的多重PCR 软件筛选结果 | 第127页 |
| ·飞行质谱分析SNPs 位点的分型结果 | 第127-128页 |
| ·飞行质谱芯片分析样品的总体结果 | 第127-128页 |
| ·飞行质谱筛查有效SNPs 结果 | 第128页 |
| ·有效SNP 位点等位基因频率、基因型频率及哈代-温博格平衡检验 | 第128-129页 |
| ·有效SNP 位点在群体中的遗传特性 | 第129页 |
| ·有效SNP 位点的连锁不平衡分析 | 第129-131页 |
| ·牛基因23 个有效SNP 位点与体尺性状的关联分析 | 第131-134页 |
| 第四章 讨论 | 第134-140页 |
| ·关于组织中RNA 的提取 | 第134页 |
| ·关于牛基因的分离和克隆 | 第134-135页 |
| ·关于基因的生物信息学的分析 | 第135-136页 |
| ·关于实时荧光定量PCR 检测 | 第136页 |
| ·牛UQCC 基因的组织表达谱分析 | 第136页 |
| ·牛ADAMTSL3 基因的组织表达谱分析 | 第136页 |
| ·关于基因启动子结构特征分析 | 第136-137页 |
| ·关于SNPS 的筛查及SNPS 的群体遗传检测 | 第137-139页 |
| ·关于SNPs 的筛查 | 第137-138页 |
| ·SNPs 的群体遗传检测 | 第138-139页 |
| ·关于基因的遗传效应分析 | 第139-140页 |
| 第五章 结论 | 第140-143页 |
| ·主要的研究结果 | 第140-142页 |
| ·创新点 | 第142-143页 |
| 参考文献 | 第143-164页 |
| 附录1 31 个质谱检测多态位点聚合图 | 第164-172页 |
| 附录2 31 个质谱检测多态位点分型图 | 第172-196页 |
| 缩略词 | 第196-198页 |
| 致谢 | 第198-199页 |
| 作者简介 | 第199-200页 |
