| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-24页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 1.1 棒杆菌属分类变化及概述 | 第11-15页 |
| 1.2 植物病原细菌检测方法概述 | 第15-24页 |
| 1.2.1 传统检测鉴定方法 | 第15-18页 |
| 1.2.1.1 病害症状观察与镜检 | 第16页 |
| 1.2.1.2 病原物分离培养与细菌染色技术 | 第16-17页 |
| 1.2.1.3 致病性测定 | 第17页 |
| 1.2.1.4 生理生化试验 | 第17-18页 |
| 1.2.2 血清学检测技术 | 第18-19页 |
| 1.2.3 分子生物学检测技术 | 第19页 |
| 1.2.4 DNA条形码技术的概述 | 第19-24页 |
| 第2章 棒形杆菌属条码基因的筛选 | 第24-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-30页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第24-26页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第26-27页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第27-30页 |
| 2.2 结果与分析 | 第30-38页 |
| 2.2.1 PCR扩增效率及测序成功率 | 第30页 |
| 2.2.2 序列信息 | 第30-31页 |
| 2.2.3 遗传距离分析 | 第31-32页 |
| 2.2.4 不同序列种间、种内变异比较 | 第32-33页 |
| 2.2.5 DNA barcoding gap分析 | 第33-34页 |
| 2.2.6 基于系统发育树的分析 | 第34-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-40页 |
| 第3章 短小杆菌属条码基因的筛选 | 第40-60页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-44页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第40-42页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第42页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第42-44页 |
| 3.1.3.1 DNA的提取 | 第42页 |
| 3.1.3.2 PCR扩增及测序 | 第42-44页 |
| 3.1.3.3 数据处理 | 第44页 |
| 3.2 结果与分析 | 第44-58页 |
| 3.2.1 PCR扩增效率及测序成功率 | 第44页 |
| 3.2.2 序列信息 | 第44-45页 |
| 3.2.3 遗传距离分析 | 第45-46页 |
| 3.2.4 不同序列种间、种内变异比较 | 第46-48页 |
| 3.2.5 DNA BARCODING GAP分析 | 第48-50页 |
| 3.2.6 基于系统发育树的分析 | 第50-58页 |
| 3.3 讨论 | 第58-60页 |
| 第4章 棒形杆菌属DNA条形码方法应用 | 第60-66页 |
| 4.1 材料与方法 | 第60-61页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第60页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第60页 |
| 4.1.3 实验方法 | 第60-61页 |
| 4.1.3.1 病菌的分离和纯培养及特征观察 | 第60页 |
| 4.1.3.2 烟草过敏反应 | 第60页 |
| 4.1.3.3 马铃薯软腐试验 | 第60页 |
| 4.1.3.4 致病性测定 | 第60-61页 |
| 4.1.3.5 生理生化测定 | 第61页 |
| 4.1.3.6 DNA条形码方法验证 | 第61页 |
| 4.2 结果与分析 | 第61-64页 |
| 4.2.1 培养特征 | 第61-62页 |
| 4.2.2 烟草过敏反应 | 第62页 |
| 4.2.3 马铃薯软腐反应 | 第62页 |
| 4.2.4 生理生化测定 | 第62-63页 |
| 4.2.5 DNA条码方法验证 | 第63-64页 |
| 4.3 讨论 | 第64-66页 |
| 第5章 番茄溃疡病特异性检测引物对比及分析 | 第66-72页 |
| 5.1 材料与方法 | 第66-67页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第66页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第66-67页 |
| 5.1.2.1 番茄溃疡病特异性检测引物扩增效率比对 | 第66-67页 |
| 5.1.2.2 不同引物的特异性评价 | 第67页 |
| 5.2 结果与分析 | 第67-70页 |
| 5.2.1 番茄溃疡病特异性检测引物扩增效率比对 | 第67-68页 |
| 5.2.2 不同引物的特异性评价 | 第68-70页 |
| 5.3 讨论 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-80页 |
| 附录 | 第80-82页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第82-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
