| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第10-30页 |
| 1. 代谢与肿瘤的关系 | 第10-14页 |
| 1.1 经典肿瘤相关基因直接调控代谢酶 | 第10-13页 |
| 1.2 代谢基因在肿瘤中发生突变 | 第13-14页 |
| 2. IDH在肿瘤中发生突变 | 第14-19页 |
| 2.1 正常的IDH产生NADPH和α-KG | 第14-16页 |
| 2.2 IDH在多种肿瘤中发生突变 | 第16-17页 |
| 2.3 IDH突变在生化和临床病例方面的特征 | 第17-18页 |
| 2.4 突变的IDH降低α-KG并积累代谢废物2-HG | 第18-19页 |
| 3. 以α-KG为底物的双加氧酶 | 第19-26页 |
| 3.1 组蛋白去甲基化酶 | 第21-24页 |
| 3.2 TET蛋白DNA羟甲基化酶 | 第24-26页 |
| 4. 代谢中间物参与表观遗传调控 | 第26-28页 |
| 4.1 2-HG与α-KG结构相似 | 第26-27页 |
| 4.2 2-HG抑制组蛋白去甲基化酶 | 第27页 |
| 4.3 2-HG抑制TET蛋白DNA羟甲基化酶 | 第27-28页 |
| 5. 本文主要的研究内容,目的,意义和创新点 | 第28-30页 |
| 第二章 致癌代谢物2-HG调控细胞的信号通路和表观遗传特征 | 第30-81页 |
| 1. 研究背景 | 第30-31页 |
| 2. 材料和方法 | 第31-52页 |
| 2.1 实验材料和试剂 | 第31-35页 |
| 2.2 实验方法 | 第35-52页 |
| 3. 结果 | 第52-76页 |
| 3.1 肿瘤相关的IDH1/2突变可以降低细胞内α-KG的水平,并大量积累2-HG | 第52-53页 |
| 3.2 体外酶活实验显示2-HG抑制以α-KG为底物的组蛋白去甲基化酶的活力 | 第53-56页 |
| 3.3 结构学研究表明2-HG是α-KG为底物的组蛋白去甲基化酶的抑制剂 | 第56-57页 |
| 3.4 2-HG引起全基因组水平组蛋白甲基化水平的升高 | 第57-59页 |
| 3.5 肿瘤相关的IDH1 R132H突变引起全基因组水平组蛋白甲基化水平的升高 | 第59-62页 |
| 3.6 降低IDH活力导致全基因组组蛋白甲基化水平的升高 | 第62-63页 |
| 3.7 2-HG可以抑制以α-KG为底物的PHDs和C-P4H的活力 | 第63-67页 |
| 3.8 肿瘤相关的IDH1~(R132H)可以抑制以α-KG为底物的PHDs和C-4PH的活力 | 第67-69页 |
| 3.9 降低IDH活力使得PHDs和C-4PH的活力受阻 | 第69-71页 |
| 3.10 体外酶活实验显示2-HG可以抑制5-甲基胞嘧啶羟基化酶的活力 | 第71-72页 |
| 3.11 肿瘤相关的IDH1/2突变可以抑制5-甲基胞嘧啶羟基化酶的活力 | 第72-76页 |
| 4. 讨论 | 第76-79页 |
| 4.1 D-2-HG是α-KG一个弱的竞争性抑制剂 | 第76-77页 |
| 4.2 以α-KG为底物的双加氧酶对细胞内α-KG的浓度降低可能更为敏感 | 第77-78页 |
| 4.3 IDH1/2的突变改变了细胞内组蛋白和DNA的甲基化水平 | 第78页 |
| 4.4 TCA循环中的代谢中间物都是α-KG的类似物吗? | 第78-79页 |
| 5. 小结 | 第79-81页 |
| 第三章 表观遗传标记物5hmC的水平以及相关基因TET在肿瘤中丢失 | 第81-96页 |
| 1. 研究背景 | 第81-82页 |
| 2. 材料和方法 | 第82-85页 |
| 2.1 实验材料 | 第82页 |
| 2.2 实验方法 | 第82-85页 |
| 3. 结果 | 第85-94页 |
| 3.1 IHC检测发现5hmC在多种肿瘤中出现丢失 | 第85-89页 |
| 3.2 IHC检测发现5hmC在多种基因敲除小鼠肿瘤模型中出现丢失 | 第89-90页 |
| 3.3 建立简单而灵敏的5hmC的检测方法 | 第90-93页 |
| 3.4 肿瘤组织中5hmC水平的降低与TET基因表达下调相关 | 第93-94页 |
| 4. 讨论 | 第94-95页 |
| 5. 小结 | 第95-96页 |
| 第四章 代谢中间物α-KG动态调控细胞表观遗传特征 | 第96-112页 |
| 1. 研究背景 | 第96-97页 |
| 2. 材料和方法 | 第97-100页 |
| 2.1 实验材料 | 第97页 |
| 2.2 实验方法 | 第97-100页 |
| 3. 结果 | 第100-111页 |
| 3.1 高糖刺激后,小鼠各组织中5hmC动态变化 | 第100-103页 |
| 3.2 小鼠肝脏细胞中5hmC的动态变化与高糖引起的α-KG水平变化正相关 | 第103-105页 |
| 3.3 谷氨酰胺和谷氨酸的刺激引起小鼠肝脏细胞中5hmC动态变化 | 第105-108页 |
| 3.4 小鼠肝脏细胞中5hmC的动态变化与谷氨酸引起的α-KG水平变化正相关 | 第108-110页 |
| 3.5 高糖刺激,转录激活糖酵解途径,抑制糖异生途径 | 第110-111页 |
| 4. 讨论 | 第111页 |
| 5. 小结 | 第111-112页 |
| 第五章 小分子Vitamin C动态调控小鼠胚胎干细胞表观遗传特征 | 第112-122页 |
| 1. 研究背景 | 第112-113页 |
| 2. 材料和方法 | 第113页 |
| 2.1 实验材料 | 第113页 |
| 2.2 实验方法 | 第113页 |
| 3. 结果 | 第113-119页 |
| 3.1 维生素C增加细胞内TET蛋白生成5hmC的活力 | 第113-115页 |
| 3.2 维生素C动态调控小鼠ES细胞中5hmC的水平 | 第115-116页 |
| 3.3 CoCl_2,DFO和DMOG抑制维生素C介导的TET蛋白生成5hmC的活力 | 第116-119页 |
| 4. 讨论 | 第119-121页 |
| 5. 小结 | 第121-122页 |
| 参考文献 | 第122-134页 |
| 已发表论文 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135-137页 |
