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水稻木质形成素类AGP蛋白基因家族的鉴定及OsAGP13的生物学功能研究

缩写符号第10-13页
中文摘要第13-16页
ABSTRACT第16-19页
第一章 前言第20-46页
    1. 阿拉伯半乳糖蛋白第20-32页
        1.1 AGPs的鉴定标准第20-21页
        1.2 AGPs的结构特征第21-26页
            1.2.1 蛋白骨架第21-23页
                1.2.1.1 经典AGPs第21-22页
                1.2.1.2 非经典AGPs第22-23页
            1.2.2 GPI锚第23-24页
            1.2.3 糖基侧链第24-25页
            1.2.4 分子模型第25-26页
        1.3 AGPs的生物学功能研究第26-31页
            1.3.1 AGPs在细胞分裂和模式建成中的作用第27页
            1.3.2 AGPs在有性生殖过程中的作用第27-29页
            1.3.3 AGPs在营养生长发育中的作用第29-30页
            1.3.4 AGPs参与植物与环境的相互作用第30-31页
        1.4 木质形成素基因家族的研究现状第31-32页
    2. 植物维管束发育的研究进展第32-41页
        2.1 维管束的结构及功能第32-34页
        2.2 木质部的分化和发育第34-36页
        2.3 韧皮部的分化和发育第36-37页
        2.4 维管束模式建成的时间和空间调控第37-39页
        2.5 维管束参与根向地上部分的信号传递第39-41页
    3. 植物细胞壁发育的研究进展第41-44页
        3.1 细胞壁的成分第41-42页
        3.2 细胞壁的结构第42-43页
        3.3 细胞壁的功能第43-44页
    4. 本研究的目的及意义第44-46页
第二章 水稻木质形成素基因家族的鉴定和表达分析第46-82页
    1. 材料与方法第46-57页
        1.1 材料的种植与胁迫处理第46-47页
        1.2 水稻基因组的抽提第47页
        1.3 水稻总RNA的抽提及反转录第47-49页
        1.4 通过蛋白序列搜索及保守结构域鉴定OsXYLPs蛋白第49-50页
        1.5 染色体定位和基因复制分析第50页
        1.6 进化关系分析和序列比对第50页
        1.7 高通量表达分析第50-52页
        1.8 PCR反应第52-53页
        1.9 T-DNA突变体的三引物法鉴定第53-54页
        1.10 实时荧光定量PCR第54-55页
        1.11 引物第55-56页
        1.12 形态学观察及照相第56-57页
    2. 结果与分析第57-79页
        2.1 OsXYLPs家族成员的鉴定第57-59页
        2.2 OsXYLPs的蛋白质结构分析第59-61页
        2.3 OsXYLPs的进化关系分析及多序列比对第61-63页
        2.4 OsXYLPs基因的染色体定位及基因复制第63-65页
        2.5 OsXYLPs在各个发育时期器官及组织中的表达分析第65-68页
        2.6 OsXYLPs在非生物胁迫及激素处理下的表达分析第68-70页
        2.7 水稻和拟南芥XYLPs基因表达的比较分析第70-72页
        2.8 水稻xylp7突变体的鉴定与表型分析第72-76页
            2.8.1 xylp7突变体的基因组水平鉴定第72-74页
            2.8.2 xylp7突变体的RNA水平鉴定第74-75页
            2.8.3 xylp7突变体的表型观察与分析第75-76页
        2.9 水稻xylp16突变体的鉴定与表型分析第76-79页
            2.9.1 xylp16突变体的基因组水平鉴定第77-78页
            2.9.2 xylp16突变体的RNA水平鉴定第78-79页
            2.9.3 xylp16突变体的表型观察与分析第79页
    3. 讨论第79-82页
        3.1 水稻和拟南芥中类似木质形成素的AGPs第79-80页
        3.2 OsXYLPs基因的表达模式第80页
        3.3 基因复制在OsXYLPs家族扩大及功能多样性中发挥着重要的作用第80-81页
        3.4 OsXYLPs基因在激素应答及植物生长发育中的功能第81-82页
第三章 水稻OsAGP13基因的生物学功能研究第82-128页
    1. 材料与方法第85-97页
        1.1 实验材料第85页
        1.2 水稻基因组的抽提第85页
        1.3 水稻总RNA的抽提及反转录第85-87页
        1.4 所需引物第87-88页
        1.5 PCR反应第88-89页
        1.6 实时荧光定量PCR反应第89-90页
        1.7 石蜡包埋技术第90-91页
        1.8 原位杂交技术第91-93页
            1.8.1 探针构建第91页
            1.8.2 点膜实验第91-92页
            1.8.3 原位杂交反应第92-93页
        1.9 花原基扫描电镜观察第93页
        1.10 冰冻切片及花穗维管束相关参数统计第93-94页
        1.11 树脂包埋与半薄切片第94-95页
        1.12 木质素染色第95页
        1.13 CW染色第95页
        1.14 细胞壁成分含量测定第95-96页
        1.15 AGPs和果胶的免疫反应第96页
        1.16 机械拉伸试验第96页
        1.17 RNA高通量测序第96-97页
    2. 结果与分析第97-125页
        2.1 OsAGP13基因的表达分析第97-100页
        2.2 OsAGP13-RNAi植株的表型分析第100-105页
            2.2.1 野生型与OsAGP13-RNAi植株穗芽结构及分化时期的比较分析第100-102页
            2.2.2 野生型与OsAGP13-RNAi植株花穗结构特征第102-105页
                2.2.2.1 野生型与RNAi植株穗轴结构比较第102-103页
                2.2.2.2 野生型与RNAi植株穗轴中维管束数目比较第103-104页
                2.2.2.3 野生型与RNAi植株花穗维管束结构及厚壁组织比较第104-105页
        2.3 野生型与OsAGP13-RNAi植株机械强度分析第105-106页
        2.4 野生型与OsAGP13-RNAi植株细胞壁物质含量分析第106-108页
        2.5 野生型与OsAGP13-RNAi植株中木质素的含量及分布第108-109页
        2.6 野生型与OsAGP13-RNAi植株中纤维素的含量及分布第109-110页
        2.7 野生型与OsAGP13-RNAi植株中木聚糖的分布第110-111页
        2.8 野生型与OsAGP13-RNAi植株花穗轴的转录组测序及分析第111-124页
            2.8.1 野生型与OsAGP13-RNAi植株中花穗轴样品的测序结果分析第112-113页
            2.8.2 野生型和OsAGP13-RNAi植株花穗轴中基因表达及功能分析第113-116页
            2.8.3 野生型和OsAGP13-RNAi植株花穗轴中差异表达的基因与其功能分析第116-119页
            2.8.4 野生型和OsAGP13-RNAi植株花穗轴中与维管束及细胞壁发育相关的差异表达基因功能分析第119-124页
        2.9 野生型和OsAGP13-RNAi植株花穗轴中维管束及细胞壁发育相关差异表达基因的表达验证第124-125页
    3. 讨论第125-128页
        3.1 水稻OsAGP13基因在维管束及顶端分生组织中特异表达第125-126页
        3.2 水稻OsAGP13基因参与维管束和细胞壁的发育第126-127页
        3.3 水稻OsAGP13基因影响维管束和细胞壁发育相关基因的表达第127-128页
第四章 总讨论第128-133页
    1. 水稻XYLPs家族的鉴定与表达分析第128-129页
    2. 水稻OsAGP13基因影响维管束及细胞壁的发育第129-133页
参考文献第133-149页
附表第149-162页
在读期间科研成果第162-163页
致谢第163页

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