| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩写词表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-38页 |
| 1.1 纤维素资源的开发利用 | 第12页 |
| 1.2 纤维素的结构 | 第12-14页 |
| 1.3 纤维素的微生物降解 | 第14-17页 |
| 1.3.1 纤维素降解微生物 | 第14-15页 |
| 1.3.2 微生物纤维素降解策略 | 第15-17页 |
| 1.4 哈氏噬纤维菌研究背景 | 第17-23页 |
| 1.4.1 哈氏噬纤维菌系统发生以及特性 | 第17-19页 |
| 1.4.2 运动性 | 第19-21页 |
| 1.4.3 新型的蛋白分泌系统 | 第21-22页 |
| 1.4.4 新型的启动子概述 | 第22页 |
| 1.4.5 对纤维素的吸附 | 第22-23页 |
| 1.5 哈氏噬纤维菌的研究进展 | 第23-26页 |
| 1.6 Pal相关研究 | 第26-30页 |
| 1.6.1 Pal背景介绍 | 第26-27页 |
| 1.6.2 Pal和tol-pal系统结构 | 第27-28页 |
| 1.6.3 tol-pal生理功能 | 第28-29页 |
| 1.6.4 哈氏噬纤维菌中对应的tol-Pal蛋白 | 第29-30页 |
| 1.7 HtrA总结 | 第30-37页 |
| 1.7.1 氨基酸序列分析 | 第31-33页 |
| 1.7.2 不同的生理作用 | 第33-34页 |
| 1.7.3 结构研究 | 第34-35页 |
| 1.7.4 结构变化的分子调节机制 | 第35-37页 |
| 1.8 论文的立题和工作思路 | 第37-38页 |
| 第二章 CHU_0125在Cytophaga hutchinsonii纤维素降解中作用的研究 | 第38-73页 |
| 2.1 材料与方法 | 第38-51页 |
| 2.1.1 菌种、质粒与引物 | 第38-39页 |
| 2.1.2 培养基、缓冲液和抗生素 | 第39-40页 |
| 2.1.3 试剂与仪器 | 第40-41页 |
| 2.1.4 实验方法 | 第41-51页 |
| 2.2 实验结果 | 第51-71页 |
| 2.2.1 chu_0125的敲除和验证 | 第51-52页 |
| 2.2.2 chu_0125突变株对纤维素降解测定 | 第52-54页 |
| 2.2.3 突变株其他生长相关表型的测定 | 第54-57页 |
| 2.2.4 菌体纤维素酶活的测定 | 第57-58页 |
| 2.2.5 菌体对纤维素吸附率的测定 | 第58-59页 |
| 2.2.6 滑动及软、硬琼脂运动能力测定 | 第59-60页 |
| 2.2.7 菌体形态和滤纸表面菌体排列的观察 | 第60-62页 |
| 2.2.8 外膜蛋白的SDS-PAGE | 第62-63页 |
| 2.2.9 抗逆性实验 | 第63-64页 |
| 2.2.10 CHU_0125异源表达 | 第64-65页 |
| 2.2.11 生物信息学分析 | 第65-69页 |
| 2.2.12 tol-pal系统/MotB相关基因的敲除与表型验证 | 第69-71页 |
| 2.3 讨论 | 第71-73页 |
| 第三章 chu_3006和chu_0052基因功能的研究 | 第73-106页 |
| 3.1 材料与方法 | 第73-78页 |
| 3.1.1 菌种、质粒和引物 | 第73-74页 |
| 3.1.2 培养基、缓冲液和抗生素以及试剂和仪器 | 第74-75页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第75-78页 |
| 3.2 实验结果 | 第78-103页 |
| 3.2.1 基因敲除 | 第78-79页 |
| 3.2.2 基因缺失对菌体降解纤维素的影响 | 第79-80页 |
| 3.2.3 葡萄糖或纤维二糖为碳源的生长曲线的测量 | 第80-81页 |
| 3.2.4 纤维素酶活的测定和软琼脂扩散实验 | 第81-82页 |
| 3.2.5 生物信息学分析 | 第82-85页 |
| 3.2.6 温度、pH敏感实验-不同温度和pH下生长曲线测量 | 第85-90页 |
| 3.2.7 菌落形态的观察：显微镜和电镜 | 第90-95页 |
| 3.2.8 菌落大小的观察 | 第95-96页 |
| 3.2.9 外膜蛋白的提取 | 第96-100页 |
| 3.2.10 外膜蛋白纤维素吸附蛋白的提取 | 第100-102页 |
| 3.2.11 异源表达 | 第102-103页 |
| 3.3 讨论 | 第103-106页 |
| 第四章 CHU_3384和CHU_0293等基因功能的研究 | 第106-117页 |
| 4.1 材料与方法 | 第106-108页 |
| 4.1.1 菌种、质粒和引物 | 第106-107页 |
| 4.1.2 培养基和缓冲液 | 第107页 |
| 4.1.3 实验方法与仪器 | 第107-108页 |
| 4.2 实验结果 | 第108-115页 |
| 4.2.1 chu_3384相关研究 | 第108-109页 |
| 4.2.2 chu_1317相关研究 | 第109-110页 |
| 4.2.3 chu_3822相关研究 | 第110-112页 |
| 4.2.4 chu_0293相关研究 | 第112-113页 |
| 4.2.5 其它一些敲除基因列表及简介 | 第113-115页 |
| 4.3 讨论 | 第115-117页 |
| 全文总结与展望 | 第117-119页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-127页 |
| 致谢 | 第127-128页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第128页 |
