| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1.引言 | 第14-26页 |
| 1.1 银杏概述及进化历程 | 第14-15页 |
| 1.2 垂乳银杏概述及研究进展 | 第15-20页 |
| 1.2.1 银杏垂乳名称 | 第15-16页 |
| 1.2.2 银杏垂乳形态学概述 | 第16页 |
| 1.2.3 银杏垂乳解剖特征 | 第16-17页 |
| 1.2.4 银杏垂乳的发生机制 | 第17-18页 |
| 1.2.5 垂乳银杏分子生物学研究进展 | 第18页 |
| 1.2.6 垂乳银杏的生态学意义 | 第18-19页 |
| 1.2.7 垂乳银杏的开发与利用 | 第19-20页 |
| 1.3 转录组测序技术研究及应用 | 第20-23页 |
| 1.3.1 转录组测序技术的研究 | 第20-21页 |
| 1.3.2 转录组技术在植物中的应用 | 第21-22页 |
| 1.3.2.1 新基因的发现及基因库的构建 | 第21-22页 |
| 1.3.2.2 基因表达研究 | 第22页 |
| 1.3.2.3 分子标记的开发 | 第22页 |
| 1.3.3 转录组技术在植物器官发育中的应用 | 第22-23页 |
| 1.4 SSR技术及应用 | 第23-24页 |
| 1.5 高效液相色谱技术及应用 | 第24页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第24-25页 |
| 1.7 本研究的技术路线 | 第25-26页 |
| 2.材料与方法 | 第26-40页 |
| 2.1 试验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第26-27页 |
| 2.1.2 试验地概况 | 第27页 |
| 2.1.3 主要试剂与设备 | 第27-28页 |
| 2.1.4 生物信息学分析相关的数据库及软件 | 第28页 |
| 2.2 试验方法 | 第28-40页 |
| 2.2.1 垂乳银杏资源调查 | 第28-29页 |
| 2.2.1.1 垂乳银杏调查 | 第28-29页 |
| 2.2.1.2 银杏垂乳调查 | 第29页 |
| 2.2.1.3 环境因子调查 | 第29页 |
| 2.2.1.4 垂乳再生 | 第29页 |
| 2.2.2 银杏垂乳转录组测序分析 | 第29-40页 |
| 2.2.2.1 植物RNA的提取和反转录 | 第29-31页 |
| 2.2.2.2 转录组文库的构建和上机测序 | 第31-32页 |
| 2.2.2.3 测序数据处理与分析 | 第32-35页 |
| 2.2.2.4 SSR信息分析 | 第35页 |
| 2.2.2.5 表达量分析 | 第35页 |
| 2.2.2.6 差异表达分析 | 第35-36页 |
| 2.2.2.7 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第36页 |
| 2.2.2.8 qRT-PCR验证 | 第36-38页 |
| 2.2.2.9 植物激素的提取及测定 | 第38-40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-66页 |
| 3.1 中国垂乳银杏种质资源分析 | 第40-46页 |
| 3.1.1 垂乳银杏的生境分析 | 第40-41页 |
| 3.1.2 垂乳银杏资源分布及株数 | 第41页 |
| 3.1.3 垂乳银杏的生长特性分析 | 第41-42页 |
| 3.1.4 银杏垂乳再生 | 第42-44页 |
| 3.1.5 银杏垂乳的形态特征 | 第44-46页 |
| 3.2 银杏垂乳发生过程的转录组学分析 | 第46-64页 |
| 3.2.1 总RNA提取质量检测 | 第46-47页 |
| 3.2.2 转录组测序和组装 | 第47-48页 |
| 3.2.3 unigene序列的功能注释 | 第48-53页 |
| 3.2.4 SSR信息分析 | 第53-55页 |
| 3.2.5 差异表达基因分析 | 第55-61页 |
| 3.2.5.1 差异表达基因统计 | 第55-57页 |
| 3.2.5.2 差异表达基因GO和KEGG功能分类 | 第57-61页 |
| 3.2.6 转录因子家族的预测 | 第61-62页 |
| 3.2.7 qRT-PCR分析 | 第62-64页 |
| 3.3 银杏垂乳生长素（IAA）含量变化 | 第64-66页 |
| 4.讨论 | 第66-73页 |
| 4.1 垂乳银杏资源分布 | 第66-67页 |
| 4.2 银杏垂乳再生特性 | 第67页 |
| 4.3 植物激素与银杏垂乳发生 | 第67-68页 |
| 4.4 银杏垂乳发生的转录组测序分析 | 第68-73页 |
| 4.4.1 银杏垂乳的转录组测序 | 第68-70页 |
| 4.4.2 碳水化合物/储存代谢与银杏垂乳发生 | 第70页 |
| 4.4.3 细胞周期与银杏垂乳发生的关系 | 第70-71页 |
| 4.4.4 银杏垂乳发生过程中差异表达的转录因子分析 | 第71-73页 |
| 5.结论 | 第73-74页 |
| 5.1 结论 | 第73页 |
| 5.2 创新点 | 第73-74页 |
| 6.参考文献 | 第74-89页 |
| 附表 | 第89-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第94页 |