| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 英文缩略表 | 第9-10页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 蓖麻的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.1.1 蓖麻概况 | 第11页 |
| 1.1.2 蓖麻的应用价值 | 第11-12页 |
| 1.1.3 蓖麻基因组研究现状 | 第12页 |
| 1.2 植物油脂的研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2.1 植物油脂及其合成途径 | 第12-13页 |
| 1.2.2 植物油脂家族的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3 基因加倍对植物进化的影响 | 第14-16页 |
| 1.3.1 基因加倍对植物进化的影响 | 第14-15页 |
| 1.3.2 基因加倍与基因家族进化 | 第15-16页 |
| 1.4 研究所涉及生物信息学方法与工具 | 第16-19页 |
| 1.4.1 生物信息学简介 | 第16页 |
| 1.4.2 信息分析及工具 | 第16-19页 |
| 第2章 基因加倍与油脂合成相关基因的多基因组比较分析 | 第19-28页 |
| 2.1 数据材料与方法 | 第19-21页 |
| 2.1.1 研究对象及种系统发育 | 第19页 |
| 2.1.2 数据获取与基本处理 | 第19-20页 |
| 2.1.3 全基因组尺度的油脂相关基因的鉴定 | 第20-21页 |
| 2.1.4 同源共线分析 | 第21页 |
| 2.1.5 油脂合成相关基因与基因加倍关联 | 第21页 |
| 2.2 结果与分析 | 第21-27页 |
| 2.2.1 全基因组尺度同源搜索油脂合成相关基因 | 第21-23页 |
| 2.2.2 蓖麻全基因组加倍分析 | 第23-26页 |
| 2.2.3 油脂合成相关基因与基因加倍的关系 | 第26-27页 |
| 2.3 本章小结 | 第27-28页 |
| 第3章 油脂合成相关基因多基因组的层级系统发育研究 | 第28-37页 |
| 3.1 研究方法 | 第28页 |
| 3.1.1 构建所有油脂合成相关基因的系统发育树 | 第28页 |
| 3.1.2 系统发育树进行局部分析 | 第28页 |
| 3.2 结果分析 | 第28-36页 |
| 3.2.1 油脂合成基因系统发育树 | 第28-29页 |
| 3.2.2 油脂合成家族局部系统发育分析 | 第29-35页 |
| 3.2.3 油脂合成家族局部正选择分析 | 第35-36页 |
| 3.3 本章小结 | 第36-37页 |
| 第4章 蓖麻油脂家族进化及结构分析 | 第37-45页 |
| 4.1 研究方法 | 第37-38页 |
| 4.1.1 蓖麻油脂家族的系统发育树的构建 | 第37页 |
| 4.1.2 蓖麻油脂家族成员相似性分析 | 第37页 |
| 4.1.3 蓖麻油脂家族的进化分析 | 第37页 |
| 4.1.4 蓖麻油脂家族分类与基因结构 | 第37-38页 |
| 4.1.5 蓖麻油脂家族蛋白基本性质及结构域分析 | 第38页 |
| 4.1.6 蓖麻油脂家族蛋白三维结构 | 第38页 |
| 4.2 结果分析 | 第38-44页 |
| 4.2.1 蓖麻油脂家族系统发育 | 第38-39页 |
| 4.2.2 蓖麻油脂家族相似性分析 | 第39-40页 |
| 4.2.3 蓖麻油脂家族基因结构 | 第40-41页 |
| 4.2.4 蓖麻油脂家族成员蛋白基本性质 | 第41-42页 |
| 4.2.5 蓖麻油脂家族成员结构域 | 第42-43页 |
| 4.2.6 蓖麻油脂家族成员三维结构模型 | 第43-44页 |
| 4.3 本章小结 | 第44-45页 |
| 第5章 蓖麻油脂相关家族的功能注释 | 第45-55页 |
| 5.1 研究方法 | 第45页 |
| 5.2 结果分析 | 第45-54页 |
| 5.2.1 Blast2go功能注释数据分析情况 | 第45-46页 |
| 5.2.2 PFAM数据库中蓖麻油脂相关家族的功能注释 | 第46页 |
| 5.2.3 GO数据库中蓖麻油脂相关家族的功能注释 | 第46-54页 |
| 5.3 本章小结 | 第54-55页 |
| 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 附录A 蓖麻油脂合成相关基因结构 | 第63-69页 |
| 附录B 蓖麻油脂合成相关蛋白基本性质 | 第69-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 导师简介 | 第79-80页 |
| 作者简介 | 第80-81页 |
| 学位论文数据集 | 第81页 |
