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樟芝无性孢子介导的高效循环发酵策略及其产孢分子机制解析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第11-24页
    1.1 樟芝概述第11-15页
        1.1.1 樟芝的生物学特性第11-12页
        1.1.2 樟芝与灵芝的比较第12页
        1.1.3 樟芝的主要生物活性第12-14页
        1.1.4 樟芝的人工培养第14-15页
        1.1.5 樟芝无性孢子的发现及发酵应用第15页
    1.2 基因组学、转录组学及蛋白质组学概述第15-18页
        1.2.1 基因组学、转录组学及蛋白质组学简介第15-16页
        1.2.2 基因组学、转录组学及蛋白质组学相关技术第16页
        1.2.3 组学技术在丝状真菌中的应用第16-18页
    1.3 丝状真菌无性产孢的研究第18-21页
        1.3.1 丝状真菌无性繁殖过程简介第18页
        1.3.2 丝状真菌无性产孢分子机制研究进展第18-21页
    1.4 研究意义与主要研究内容第21-24页
        1.4.1 研究意义第21-22页
        1.4.2 主要研究内容第22-24页
第二章 无性孢子介导的樟芝高效循环发酵工艺第24-40页
    2.1 前言第24-25页
    2.2 实验材料第25-26页
        2.2.1 菌种第25页
        2.2.2 主要试剂第25页
        2.2.3 主要仪器第25页
        2.2.4 培养基第25-26页
    2.3 实验方法第26-29页
        2.3.1 樟芝种子制备第26页
        2.3.2 樟芝深层发酵培养第26页
        2.3.3 孢子萌发率的检测第26页
        2.3.4 樟芝循环发酵工艺的建立第26-27页
        2.3.5 残糖含量的检测第27页
        2.3.6 生物量的检测第27页
        2.3.7 樟芝胞内多糖含量的检测第27页
        2.3.8 樟芝总三萜含量的检测第27页
        2.3.9 樟芝Antrodin A和Antrodin B含量的检测第27页
        2.3.10 樟芝循环发酵动力学分析第27-28页
        2.3.11 数据统计学分析第28-29页
    2.4 实验结果与讨论第29-38页
        2.4.1 樟芝循环发酵工艺的建立第29-32页
        2.4.2 樟芝循环发酵工艺性能分析第32-38页
    2.5 本章小结第38-40页
第三章 樟芝深层发酵无性产孢过程的分子机制研究第40-65页
    3.1 前言第40页
    3.2 实验材料第40-42页
        3.2.1 菌种第40页
        3.2.2 主要试剂第40-41页
        3.2.3 主要仪器第41页
        3.2.4 培养基第41-42页
    3.3 实验方法第42-48页
        3.3.1 樟芝种子制备及发酵培养第42页
        3.3.2 产孢量及生物量的检测第42页
        3.3.3 樟芝孢子样品的收集第42页
        3.3.4 樟芝菌丝体样品的收集第42页
        3.3.5 总蛋白提取及定量第42-43页
        3.3.6 2DE分析第43-44页
        3.3.7 MALDI-TOF/TOF质谱鉴定第44-45页
        3.3.8 总RNA提取及质量控制第45页
        3.3.9 RNA-seq测序第45-46页
        3.3.10 生物信息学分析第46-47页
        3.3.11 RT-qCPR分析第47-48页
        3.3.12 数据统计学分析第48页
    3.4 实验结果与讨论第48-63页
        3.4.1 樟芝深层发酵产孢过程第48页
        3.4.2 2DE分析第48-52页
        3.4.3 RNA-seq分析第52-57页
        3.4.4 生物信息学分析第57-61页
        3.4.5 樟芝深层发酵无性产孢过程信号通路模型图第61-62页
        3.4.6 RT-qPCR分析第62-63页
    3.5 本章小结第63-65页
第四章 营养限制诱导樟芝无性产孢的分子机制研究第65-84页
    4.1 前言第65页
    4.2 实验材料第65-66页
        4.2.1 菌种第65页
        4.2.2 主要试剂第65-66页
        4.2.3 主要仪器第66页
        4.2.4 培养基第66页
    4.3 实验方法第66-68页
        4.3.1 樟芝种子制备及发酵培养第66页
        4.3.2 检测方法第66-67页
        4.3.3 不同营养条件对樟芝无性产孢的影响第67页
        4.3.4 樟芝菌丝体样品的收集第67页
        4.3.5 总RNA提取及质量控制第67页
        4.3.6 RNA-seq测序第67页
        4.3.7 生物信息学分析第67-68页
        4.3.8 RT-qPCR分析第68页
        4.3.9 数据统计学分析第68页
    4.4 实验结果与讨论第68-83页
        4.4.1 发酵液主要成分的检测第68-69页
        4.4.2 不同营养条件对樟芝无性产孢的影响第69-70页
        4.4.3 RNA-seq测序分析第70-79页
        4.4.4 生物信息学分析第79-81页
        4.4.5 RT-qPCR分析第81-82页
        4.4.6 营养限制诱导樟芝无性产孢信号通路模型图第82-83页
    4.5 本章小结第83-84页
第五章 Ca~(2+)诱导樟芝无性产孢的分子机制研究第84-92页
    5.1 前言第84页
    5.2 实验材料第84-85页
        5.2.1 菌种第84页
        5.2.2 主要试剂第84页
        5.2.3 主要仪器第84页
        5.2.4 培养基第84-85页
    5.3 实验方法第85-86页
        5.3.1 樟芝种子制备及发酵培养第85页
        5.3.2 产孢量及生物量的检测第85页
        5.3.3 不同浓度Ca~(2+)对樟芝无性产孢的影响第85页
        5.3.4 樟芝菌丝体样品的收集第85页
        5.3.5 总蛋白提取及定量第85页
        5.3.6 2DE分析第85页
        5.3.7 MALDI-TOF/TOF质谱鉴定第85页
        5.3.8 生物信息学分析第85页
        5.3.9 总RNA提取及质量控制第85页
        5.3.10 RT-qPCR分析第85-86页
        5.3.11 数据统计学分析第86页
    5.4 实验结果与讨论第86-91页
        5.4.1 樟芝深层发酵菌体生长及产孢过程第86-87页
        5.4.2 不同浓度Ca~(2+)对樟芝深层发酵无性产孢的影响第87页
        5.4.3 2DE分析及蛋白鉴定第87-88页
        5.4.4 生物信息学分析第88页
        5.4.5 RT-qPCR分析第88-90页
        5.4.6 Ca~(2+)诱导樟芝无性产信号通路模型图第90-91页
    5.5 本章小结第91-92页
主要结论与展望第92-95页
    主要结论第92-93页
    课题展望第93-95页
论文创新点第95-97页
致谢第97-99页
参考文献第99-107页
附录1: 作者在攻读博士学位期间发表的论文第107-108页
附录2: 2DE蛋白鉴定结果(104个点)第108-111页
附录3: 差异表达蛋白点在2DE样品中的表达量(104个)第111-114页
附录4: RNA-seq分析所得樟芝无性产孢相关基因第114-116页
附录5: 樟芝无性产孢相关基因在RNA-Seq样品中的表达量第116-118页
附录6: 2DE蛋白鉴定结果(28个点)第118页

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