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大兴安岭土壤木聚糖酶基因多样性分析及其基因克隆与表达

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
1 前言第9-23页
    1.1 木聚糖概述第9-10页
    1.2 木聚糖酶简介第10-16页
        1.2.1 木聚糖酶的分类第11-15页
        1.2.2 木聚糖酶催化作用第15-16页
    1.3 木聚糖酶的分子结构区域第16-17页
    1.4 木聚糖酶的来源第17-18页
    1.5 木聚糖酶的酶活性第18-19页
    1.6 木聚糖酶分子克隆及基因工程第19-20页
    1.7 木聚糖酶的应用第20-22页
        1.7.1 饲料工业中的应用第20页
        1.7.2 造纸工业中的应用第20-21页
        1.7.3 食品工业中的应用第21页
        1.7.4 能源及环境保护方面的应用第21-22页
    1.8 本研究的内容、目的和意义第22-23页
2 材料与方法第23-33页
    2.1 实验材料及设备第23-25页
        2.1.1 采样第23页
        2.1.2 菌株和载体第23页
        2.1.3 主要化学试剂第23页
        2.1.4 主要试剂盒及工具酶第23-24页
        2.1.5 主要仪器设备第24页
        2.1.6 培养基第24页
        2.1.7 实验试剂第24-25页
        2.1.8 引物第25页
    2.2 土壤微生物宏基因组DNA的提取和纯化第25-26页
    2.3 16S rDNA测序及多样性分析第26-27页
    2.4 GH10、GH11家族木聚糖酶基因片段的测序及系统发育分析第27页
        2.4.1 基因片段的扩增、测序第27页
        2.4.2 基因片段的序列分析第27页
        2.4.3 GH10、GH11木聚糖酶基因系统发育分析第27页
    2.5 GH10、11木聚糖酶的多样性分析第27-28页
    2.6 GH10木聚糖酶基因xynH6的克隆第28-30页
        2.6.1 目标基因序列的选择第28页
        2.6.2 木聚糖酶全长序列的扩增第28-30页
    2.7 xynH6木聚糖酶基因的转化与表达方法第30-33页
        2.7.1 目的基因的扩增第30页
        2.7.2 目的基因的连接转化与鉴定第30-32页
        2.7.3 目的基因在大肠杆菌中的诱导表达第32页
        2.7.4 诱导表达蛋白的聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析第32页
        2.7.5 木聚糖酶酶活检测第32-33页
3 结果与分析第33-52页
    3.1 土壤宏基因组DNA第33页
    3.2 16S rDNA多样性第33-39页
        3.2.1 原始数据去除嵌合体及靶区域外序列第33-34页
        3.2.2 操作分类单元(OTU)分类第34页
        3.2.3 属水平群落结构分析第34-36页
        3.2.4 Alpha多样性分析第36-39页
    3.3 GH10家族木聚糖酶基因多样性分析第39-43页
        3.3.1 土壤中GH10木聚糖酶的序列分析第39-40页
        3.3.2 大兴安岭土壤环境中GH10木聚糖酶基因片段的系统发育分析第40-42页
        3.3.3 大兴安岭土壤环境中GH10木聚糖酶基因片段的丰度分析第42-43页
    3.4 GH11家族木聚糖酶基因多样性分析第43-49页
        3.4.1 土壤中GH11木聚糖酶的序列分析第43-45页
        3.4.2 大兴安岭土壤环境中GH11木聚糖酶基因片段的系统发育分析第45-48页
        3.4.3 大兴安岭土壤环境中GH11木聚糖酶基因片段的丰度分析第48-49页
    3.5 木聚糖酶基因的异源表达第49-52页
        3.5.1 木聚糖酶基因xynH6的扩增第49-50页
        3.5.2 木聚糖酶基因xynH6的克隆第50页
        3.5.3 木聚糖酶基因xynH6的诱导表达及其活性检测第50-52页
4 讨论与结论第52-55页
    4.1 讨论第52-53页
        4.1.1 土壤微生物种类多样性第52页
        4.1.2 木聚糖酶基因来源多样性第52-53页
    4.2 结论第53-55页
致谢第55-56页
参考文献第56-63页
附录第63-73页
作者简介第73页

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