| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 课题的背景和意义 | 第10-12页 |
| 1.1.1 癌症基因组学 | 第10-11页 |
| 1.1.2 基因组学分析 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外相关研究及发展现状 | 第12-14页 |
| 1.2.1 目前的肿瘤基因组学分析工具 | 第12-13页 |
| 1.2.2 肿瘤基因组数据分析进展 | 第13-14页 |
| 1.3 研究内容和目标 | 第14-18页 |
| 2 TCGA4U在线肿瘤基因组学分析平台系统框架构建 | 第18-24页 |
| 2.1 引言 | 第18页 |
| 2.2 TCGA4U框架 | 第18-19页 |
| 2.3 TCGA4U平台搭建 | 第19-22页 |
| 2.3.1 TCGA4U肿瘤基因组学知识库的构建 | 第19-20页 |
| 2.3.2 TCGA4U数据分析模块 | 第20-21页 |
| 2.3.3 TCGA4U前端显示层构建 | 第21-22页 |
| 2.4 本章小结 | 第22-24页 |
| 3 TCGA4U平台实现 | 第24-39页 |
| 3.1 引言 | 第24页 |
| 3.2 TCGA4U数据服务的具体构建 | 第24-28页 |
| 3.3 台功能模块设计 | 第28-38页 |
| 3.3.1 特定基因的基因组学数据分析 | 第28-32页 |
| 3.3.2 基因术语映射 | 第32-35页 |
| 3.3.3 潜在驱动基因的挖掘 | 第35-38页 |
| 3.3.4 肿瘤基因组数据与病人存活分析模块 | 第38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 4 基因表达模式与病人存活关系 | 第39-52页 |
| 4.1 引言 | 第39页 |
| 4.2 数据与方法 | 第39-42页 |
| 4.2.1 研究数据的准备和整合 | 第39-40页 |
| 4.2.2 基因表达模式与存活相关性 | 第40页 |
| 4.2.3 生物信息学算法及工具 | 第40-42页 |
| 4.3 结果分析 | 第42-51页 |
| 4.3.1 Log-Rank测试基因表达与病人存活相关性结果 | 第42页 |
| 4.3.2 功能描述聚类分析 | 第42-43页 |
| 4.3.3 恶性肿瘤具有更多线粒体活动 | 第43-45页 |
| 4.3.4 线粒体核糖体和胞质核糖体对比 | 第45-48页 |
| 4.3.5 HSPA2在乳腺癌中扮演着不同的角色 | 第48-50页 |
| 4.3.6 讨论 | 第50-51页 |
| 4.4 本章小结 | 第51-52页 |
| 5 总结与展望 | 第52-55页 |
| 5.1 总结 | 第52-53页 |
| 5.2 展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 作者简介 | 第60页 |
| 作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第60页 |