应用高通量转录组测序筛选结肠癌发生相关基因
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 一、文献综述 | 第9-17页 |
| 1.1 结肠癌研究现状概述 | 第9-11页 |
| 1.1.1 原癌基因和抑癌基因 | 第9页 |
| 1.1.2 肿瘤微环境 | 第9-10页 |
| 1.1.3 肿瘤干细胞 | 第10页 |
| 1.1.4 肿瘤细胞信号转导 | 第10-11页 |
| 1.2 测序技术概述及其在医学中的应用 | 第11-15页 |
| 1.2.1 测序技术概述 | 第11-12页 |
| 1.2.2 测序技术在医学中的应用 | 第12-15页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第15-17页 |
| 二、实验研究 | 第17-23页 |
| 2.1 材料、试剂与仪器 | 第17-18页 |
| 2.1.1 实验仪器 | 第17页 |
| 2.1.2 生化试剂 | 第17-18页 |
| 2.2 实验方法 | 第18-23页 |
| 2.2.1 组织样本的采集 | 第18页 |
| 2.2.2 样本总RNA的抽提 | 第18-19页 |
| 2.2.3 总RNA的质量控制 | 第19页 |
| 2.2.4 高通量转录组测序实验流程 | 第19-20页 |
| 2.2.5 生物信息学分析 | 第20-23页 |
| 三、实验结果与分析 | 第23-45页 |
| 3.1 总RNA质量控制结果 | 第23-24页 |
| 3.2 原始数据及筛选 | 第24-26页 |
| 3.2.1 下机原始数据统计 | 第24页 |
| 3.2.2 原始数据过滤和质控分析结果 | 第24-26页 |
| 3.3 实验数据处理 | 第26-45页 |
| 3.3.1 比对到基因组和染色体数目统计 | 第26-27页 |
| 3.3.2 基因组注释整理 | 第27-28页 |
| 3.3.3 表达差异基因分析结果 | 第28-30页 |
| 3.3.4 eggNOG分析处理 | 第30-33页 |
| 3.3.5 表达差异GO富集分析结果 | 第33-38页 |
| 3.3.6 表达差异基因KEGG分析结果 | 第38-43页 |
| 3.3.7 差异表达基因的聚类分析 | 第43-45页 |
| 四、讨论 | 第45-51页 |
| 4.1 eggNOG分析讨论 | 第45页 |
| 4.2 GO分析讨论 | 第45-46页 |
| 4.3 KEGG信号通路分析讨论 | 第46-48页 |
| 4.4 肿瘤相关信号通路中的差异表达基因研究 | 第48-51页 |
| 五、结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 致谢 | 第61-63页 |
| 个人简介 | 第63页 |
